RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555881.5

COCH-209, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 2

Gene COCH, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-209ENST00000555881 SHROOM2Q13796 1616 aa36.55■■■■□ 3.44
COCH-209ENST00000555881 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.53■■■■□ 3.44
COCH-209ENST00000555881 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.5■■■■□ 3.43
COCH-209ENST00000555881 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
COCH-209ENST00000555881 ARAP1Q96P48 1450 aa36.37■■■■□ 3.41
COCH-209ENST00000555881 IQGAP2Q13576 1575 aa36.36■■■■□ 3.41
COCH-209ENST00000555881 JPH4Q96JJ6 628 aa36.36■■■■□ 3.41
COCH-209ENST00000555881 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.35■■■■□ 3.41
COCH-209ENST00000555881 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.35■■■■□ 3.41
COCH-209ENST00000555881 KIF21BO75037 1637 aa36.32■■■■□ 3.4
COCH-209ENST00000555881 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
COCH-209ENST00000555881 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.19■■■■□ 3.38
COCH-209ENST00000555881 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.18■■■■□ 3.38
COCH-209ENST00000555881 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.09■■■■□ 3.37
COCH-209ENST00000555881 GOLGA3Q08378 1498 aa36.07■■■■□ 3.37
COCH-209ENST00000555881 DISP1Q96F81 1524 aa36.07■■■■□ 3.36
COCH-209ENST00000555881 KIAA0556O60303 1618 aa36.02■■■■□ 3.36
COCH-209ENST00000555881 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.95■■■■□ 3.35
COCH-209ENST00000555881 PTPRGP23470 1445 aa35.9■■■■□ 3.34
COCH-209ENST00000555881 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.88■■■■□ 3.33
COCH-209ENST00000555881 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
COCH-209ENST00000555881 SAMD9Q5K651 1589 aa35.87■■■■□ 3.33
COCH-209ENST00000555881 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.79■■■■□ 3.32
COCH-209ENST00000555881 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.75■■■■□ 3.31
COCH-209ENST00000555881 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
COCH-209ENST00000555881 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.68■■■■□ 3.3
COCH-209ENST00000555881 UACAQ9BZF9 1416 aa35.68■■■■□ 3.3
COCH-209ENST00000555881 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
COCH-209ENST00000555881 ABCC2Q92887 1545 aa35.66■■■■□ 3.3
COCH-209ENST00000555881 P3H3Q8IVL6 736 aa35.65■■■■□ 3.3
COCH-209ENST00000555881 ABCA8O94911 1581 aa35.6■■■■□ 3.29
COCH-209ENST00000555881 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.6■■■■□ 3.29
COCH-209ENST00000555881 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.6■■■■□ 3.29
COCH-209ENST00000555881 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.56■■■■□ 3.28
COCH-209ENST00000555881 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.54■■■■□ 3.28
COCH-209ENST00000555881 MAPKBP1O60336 1514 aa35.52■■■■□ 3.28
COCH-209ENST00000555881 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.5■■■■□ 3.27
COCH-209ENST00000555881 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.46■■■■□ 3.27
COCH-209ENST00000555881 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
COCH-209ENST00000555881 CLIP1P30622 1438 aa35.4■■■■□ 3.26
COCH-209ENST00000555881 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.38■■■■□ 3.25
COCH-209ENST00000555881 FMN1Q68DA7 1419 aa35.37■■■■□ 3.25
COCH-209ENST00000555881 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
COCH-209ENST00000555881 CEP162Q5TB80 1403 aa35.32■■■■□ 3.24
COCH-209ENST00000555881 ASXL2Q76L83 1435 aa35.32■■■■□ 3.24
COCH-209ENST00000555881 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
COCH-209ENST00000555881 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.3■■■■□ 3.24
COCH-209ENST00000555881 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.29■■■■□ 3.24
COCH-209ENST00000555881 DIP2BQ9P265 1576 aa35.28■■■■□ 3.24
COCH-209ENST00000555881 ATP10BO94823 1461 aa35.27■■■■□ 3.24
COCH-209ENST00000555881 HECW1Q76N89 1606 aa35.22■■■■□ 3.23
COCH-209ENST00000555881 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.2■■■■□ 3.23
COCH-209ENST00000555881 ARID3CA6NKF2 412 aa35.18■■■■□ 3.22
COCH-209ENST00000555881 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
COCH-209ENST00000555881 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
COCH-209ENST00000555881 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.13■■■■□ 3.21
COCH-209ENST00000555881 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.13■■■■□ 3.21
COCH-209ENST00000555881 GLI2P10070 1586 aa35.13■■■■□ 3.21
COCH-209ENST00000555881 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
COCH-209ENST00000555881 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.08■■■■□ 3.21
COCH-209ENST00000555881 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.06■■■■□ 3.2
COCH-209ENST00000555881 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
COCH-209ENST00000555881 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
COCH-209ENST00000555881 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
COCH-209ENST00000555881 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.99■■■■□ 3.19
COCH-209ENST00000555881 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.98■■■■□ 3.19
COCH-209ENST00000555881 TSPOAP1O95153 1857 aa34.95■■■■□ 3.18
COCH-209ENST00000555881 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.94■■■■□ 3.18
COCH-209ENST00000555881 KCNH8Q96L42 1107 aa34.94■■■■□ 3.18
COCH-209ENST00000555881 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.94■■■■□ 3.18
COCH-209ENST00000555881 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
COCH-209ENST00000555881 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.89■■■■□ 3.18
COCH-209ENST00000555881 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.89■■■■□ 3.18
COCH-209ENST00000555881 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
COCH-209ENST00000555881 CD109Q6YHK3 1445 aa34.81■■■■□ 3.16
COCH-209ENST00000555881 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
COCH-209ENST00000555881 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.78■■■■□ 3.16
COCH-209ENST00000555881 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.78■■■■□ 3.16
COCH-209ENST00000555881 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.76■■■■□ 3.161e-6■□□□□ 10.3
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COCH-209ENST00000555881 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.74■■■■□ 3.15
COCH-209ENST00000555881 TIAM1Q13009 1591 aa34.65■■■■□ 3.14
COCH-209ENST00000555881 KDM6BO15054 1643 aa34.63■■■■□ 3.13
COCH-209ENST00000555881 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.6■■■■□ 3.13
COCH-209ENST00000555881 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.6■■■■□ 3.13
COCH-209ENST00000555881 MAP3K1Q13233 1512 aa34.59■■■■□ 3.13
COCH-209ENST00000555881 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.59■■■■□ 3.13
COCH-209ENST00000555881 NEO1Q92859 1461 aa34.56■■■■□ 3.12
COCH-209ENST00000555881 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.55■■■■□ 3.12
COCH-209ENST00000555881 PLCH2O75038 1416 aa34.55■■■■□ 3.12
COCH-209ENST00000555881 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.54■■■■□ 3.12
COCH-209ENST00000555881 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.52■■■■□ 3.12
COCH-209ENST00000555881 FANCAO15360 1455 aa34.5■■■■□ 3.11
COCH-209ENST00000555881 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
COCH-209ENST00000555881 PREX2Q70Z35 1606 aa34.48■■■■□ 3.11
COCH-209ENST00000555881 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.47■■■■□ 3.11
COCH-209ENST00000555881 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.46■■■■□ 3.11
COCH-209ENST00000555881 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.45■■■■□ 3.11
COCH-209ENST00000555881 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
COCH-209ENST00000555881 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.41■■■■□ 3.1
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