RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555881.5

COCH-209, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 2

Gene COCH, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-209ENST00000555881 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.85■■■■■ 6.05
COCH-209ENST00000555881 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.95■■■■■ 5.11
COCH-209ENST00000555881 ABCC9O60706 1549 aa45.58■■■■■ 4.89
COCH-209ENST00000555881 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
COCH-209ENST00000555881 NACADO15069 1562 aa44.04■■■■■ 4.64
COCH-209ENST00000555881 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.02■■■■■ 4.64
COCH-209ENST00000555881 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.89■■■■■ 4.62
COCH-209ENST00000555881 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.89■■■■■ 4.62
COCH-209ENST00000555881 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.78■■■■■ 4.6
COCH-209ENST00000555881 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.08■■■■■ 4.49
COCH-209ENST00000555881 SCRIBQ14160 1630 aa42.79■■■■■ 4.44
COCH-209ENST00000555881 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.69■■■■■ 4.43
COCH-209ENST00000555881 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.58■■■■■ 4.41
COCH-209ENST00000555881 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.3■■■■■ 4.36
COCH-209ENST00000555881 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.56■■■■■ 4.24
COCH-209ENST00000555881 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
COCH-209ENST00000555881 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.29■■■■■ 4.2
COCH-209ENST00000555881 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.11■■■■■ 4.17
COCH-209ENST00000555881 SMARCA4P51532 1647 aa40.98■■■■■ 4.15
COCH-209ENST00000555881 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
COCH-209ENST00000555881 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.72■■■■■ 4.11
COCH-209ENST00000555881 SMARCA2P51531 1590 aa40.65■■■■■ 4.1
COCH-209ENST00000555881 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.65■■■■■ 4.1
COCH-209ENST00000555881 NCAPD3P42695 1498 aa40.6■■■■■ 4.09
COCH-209ENST00000555881 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.6■■■■■ 4.09
COCH-209ENST00000555881 HMGXB3Q12766 1538 aa40.47■■■■■ 4.07
COCH-209ENST00000555881 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
COCH-209ENST00000555881 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
COCH-209ENST00000555881 WIZO95785 1651 aa40.31■■■■■ 4.04
COCH-209ENST00000555881 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
COCH-209ENST00000555881 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.53■■■■□ 3.92
COCH-209ENST00000555881 NESP48681 1621 aa39.53■■■■□ 3.92
COCH-209ENST00000555881 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.41■■■■□ 3.9
COCH-209ENST00000555881 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
COCH-209ENST00000555881 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.39■■■■□ 3.9
COCH-209ENST00000555881 ERCC6Q03468 1493 aa39.28■■■■□ 3.88
COCH-209ENST00000555881 CFTRP13569 1480 aa39.25■■■■□ 3.87
COCH-209ENST00000555881 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.21■■■■□ 3.87
COCH-209ENST00000555881 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.14■■■■□ 3.86
COCH-209ENST00000555881 PRDM2Q13029 1718 aa39.08■■■■□ 3.85
COCH-209ENST00000555881 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.98■■■■□ 3.83
COCH-209ENST00000555881 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
COCH-209ENST00000555881 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.92■■■■□ 3.82
COCH-209ENST00000555881 CUX2O14529 1486 aa38.82■■■■□ 3.81
COCH-209ENST00000555881 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.81■■■■□ 3.8
COCH-209ENST00000555881 WDR62O43379 1518 aa38.7■■■■□ 3.79
COCH-209ENST00000555881 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
COCH-209ENST00000555881 ABCC8Q09428 1581 aa38.41■■■■□ 3.74
COCH-209ENST00000555881 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.4■■■■□ 3.74
COCH-209ENST00000555881 TOPBP1Q92547 1522 aa38.39■■■■□ 3.74
COCH-209ENST00000555881 CUX1P39880 1505 aa38.2■■■■□ 3.71
COCH-209ENST00000555881 IFT140Q96RY7 1462 aa38.09■■■■□ 3.69
COCH-209ENST00000555881 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
COCH-209ENST00000555881 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
COCH-209ENST00000555881 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
COCH-209ENST00000555881 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
COCH-209ENST00000555881 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.98■■■■□ 3.67
COCH-209ENST00000555881 TOP2BQ02880 1626 aa37.96■■■■□ 3.67
COCH-209ENST00000555881 SYNJ1O43426 1573 aa37.95■■■■□ 3.67
COCH-209ENST00000555881 SOGA1O94964 1423 aa37.88■■■■□ 3.66
COCH-209ENST00000555881 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.88■■■■□ 3.65
COCH-209ENST00000555881 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
COCH-209ENST00000555881 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
COCH-209ENST00000555881 WDR97A6NE52 1622 aa37.77■■■■□ 3.64
COCH-209ENST00000555881 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.68■■■■□ 3.62
COCH-209ENST00000555881 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.66■■■■□ 3.622e-14■■■□□ 16.3
COCH-209ENST00000555881 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
COCH-209ENST00000555881 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.54■■■■□ 3.6
COCH-209ENST00000555881 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.48■■■■□ 3.59
COCH-209ENST00000555881 PBRM1Q86U86 1689 aa37.46■■■■□ 3.59
COCH-209ENST00000555881 GRIN2BQ13224 1484 aa37.45■■■■□ 3.59
COCH-209ENST00000555881 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.37■■■■□ 3.57
COCH-209ENST00000555881 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
COCH-209ENST00000555881 CHD1O14646 1710 aa37.28■■■■□ 3.56
COCH-209ENST00000555881 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.26■■■■□ 3.56
COCH-209ENST00000555881 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.25■■■■□ 3.55
COCH-209ENST00000555881 TRIM41Q8WV44 630 aa37.22■■■■□ 3.55
COCH-209ENST00000555881 KIF27Q86VH2 1401 aa37.2■■■■□ 3.55
COCH-209ENST00000555881 SYNJ2O15056 1496 aa37.19■■■■□ 3.54
COCH-209ENST00000555881 OSCARQ8IYS5 282 aa37.17■■■■□ 3.54
COCH-209ENST00000555881 ADAMTS12P58397 1594 aa37.17■■■■□ 3.54
COCH-209ENST00000555881 FBLN2P98095 1184 aa37.11■■■■□ 3.53
COCH-209ENST00000555881 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
COCH-209ENST00000555881 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.06■■■■□ 3.52
COCH-209ENST00000555881 IGF1RP08069 1367 aa37■■■■□ 3.51
COCH-209ENST00000555881 CUL7Q14999 1698 aa36.99■■■■□ 3.51
COCH-209ENST00000555881 GRIN2AQ12879 1464 aa36.98■■■■□ 3.51
COCH-209ENST00000555881 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.95■■■■□ 3.51
COCH-209ENST00000555881 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.92■■■■□ 3.5
COCH-209ENST00000555881 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.87■■■■□ 3.49
COCH-209ENST00000555881 NUP160Q12769 1436 aa36.81■■■■□ 3.48
COCH-209ENST00000555881 CEP170Q5SW79 1584 aa36.8■■■■□ 3.48
COCH-209ENST00000555881 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.78■■■■□ 3.48
COCH-209ENST00000555881 EEA1Q15075 1411 aa36.68■■■■□ 3.46
COCH-209ENST00000555881 ARHGEF11O15085 1522 aa36.64■■■■□ 3.46
COCH-209ENST00000555881 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
COCH-209ENST00000555881 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
COCH-209ENST00000555881 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
COCH-209ENST00000555881 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.62■■■■□ 3.45
COCH-209ENST00000555881 PRXQ9BXM0 1461 aa36.57■■■■□ 3.45
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