RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
LRP1-204ENST00000553277 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.5■■■□□ 2.31
LRP1-204ENST00000553277 NUP160Q12769 1436 aa29.46■■■□□ 2.31
LRP1-204ENST00000553277 CLIP1P30622 1438 aa29.44■■■□□ 2.3
LRP1-204ENST00000553277 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.41■■■□□ 2.3
LRP1-204ENST00000553277 CEP170Q5SW79 1584 aa29.39■■■□□ 2.29
LRP1-204ENST00000553277 CHD1O14646 1710 aa29.37■■■□□ 2.29
LRP1-204ENST00000553277 FBLN2P98095 1184 aa29.37■■■□□ 2.29
LRP1-204ENST00000553277 IQGAP2Q13576 1575 aa29.36■■■□□ 2.29
LRP1-204ENST00000553277 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.32■■■□□ 2.28
LRP1-204ENST00000553277 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.29■■■□□ 2.28
LRP1-204ENST00000553277 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.28■■■□□ 2.28
LRP1-204ENST00000553277 SAMD9Q5K651 1589 aa29.25■■■□□ 2.27
LRP1-204ENST00000553277 ARAP1Q96P48 1450 aa29.23■■■□□ 2.27
LRP1-204ENST00000553277 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
LRP1-204ENST00000553277 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.16■■■□□ 2.26
LRP1-204ENST00000553277 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.15■■■□□ 2.26
LRP1-204ENST00000553277 JPH4Q96JJ6 628 aa29.15■■■□□ 2.26
LRP1-204ENST00000553277 DISP1Q96F81 1524 aa29.12■■■□□ 2.25
LRP1-204ENST00000553277 SHROOM2Q13796 1616 aa29.1■■■□□ 2.25
LRP1-204ENST00000553277 KIAA0556O60303 1618 aa29.06■■■□□ 2.24
LRP1-204ENST00000553277 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.06■■■□□ 2.24
LRP1-204ENST00000553277 OSCARQ8IYS5 282 aa29.02■■■□□ 2.24
LRP1-204ENST00000553277 P3H3Q8IVL6 736 aa29.02■■■□□ 2.24
LRP1-204ENST00000553277 FMN1Q68DA7 1419 aa29.01■■■□□ 2.24
LRP1-204ENST00000553277 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.01■■■□□ 2.24
LRP1-204ENST00000553277 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LRP1-204ENST00000553277 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.91■■■□□ 2.22
LRP1-204ENST00000553277 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
LRP1-204ENST00000553277 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.89■■■□□ 2.21
LRP1-204ENST00000553277 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
LRP1-204ENST00000553277 MAP3K1Q13233 1512 aa28.84■■■□□ 2.21
LRP1-204ENST00000553277 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.8■■■□□ 2.2
LRP1-204ENST00000553277 PTPRGP23470 1445 aa28.76■■■□□ 2.19
LRP1-204ENST00000553277 APLP2Q06481 763 aa28.74■■■□□ 2.19
LRP1-204ENST00000553277 ABCA8O94911 1581 aa28.72■■■□□ 2.19
LRP1-204ENST00000553277 HECW1Q76N89 1606 aa28.71■■■□□ 2.19
LRP1-204ENST00000553277 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.71■■■□□ 2.19
LRP1-204ENST00000553277 TIAM1Q13009 1591 aa28.7■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.69■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.67■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.66■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.66■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
LRP1-204ENST00000553277 UACAQ9BZF9 1416 aa28.61■■■□□ 2.17
LRP1-204ENST00000553277 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LRP1-204ENST00000553277 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LRP1-204ENST00000553277 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LRP1-204ENST00000553277 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.58■■■□□ 2.17
LRP1-204ENST00000553277 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.57■■■□□ 2.16
LRP1-204ENST00000553277 ABCC2Q92887 1545 aa28.54■■■□□ 2.16
LRP1-204ENST00000553277 ARHGEF11O15085 1522 aa28.54■■■□□ 2.16
LRP1-204ENST00000553277 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
LRP1-204ENST00000553277 ATP10BO94823 1461 aa28.49■■■□□ 2.15
LRP1-204ENST00000553277 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.44■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.43■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.43■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.42■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.4■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.4■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.4■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.4■■■□□ 2.14
LRP1-204ENST00000553277 ARID3CA6NKF2 412 aa28.35■■■□□ 2.13
LRP1-204ENST00000553277 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
LRP1-204ENST00000553277 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
LRP1-204ENST00000553277 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
LRP1-204ENST00000553277 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.3■■■□□ 2.12
LRP1-204ENST00000553277 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
LRP1-204ENST00000553277 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
LRP1-204ENST00000553277 NCOA2Q15596 1464 aa28.29■■■□□ 2.12
LRP1-204ENST00000553277 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.27■■■□□ 2.12
LRP1-204ENST00000553277 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
LRP1-204ENST00000553277 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.18■■■□□ 2.1
LRP1-204ENST00000553277 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.18■■■□□ 2.1
LRP1-204ENST00000553277 KIF14Q15058 1648 aa28.16■■■□□ 2.1
LRP1-204ENST00000553277 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.16■■■□□ 2.1
LRP1-204ENST00000553277 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.14■■■□□ 2.1
LRP1-204ENST00000553277 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
LRP1-204ENST00000553277 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.12■■■□□ 2.09
LRP1-204ENST00000553277 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.12■■■□□ 2.09
LRP1-204ENST00000553277 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
LRP1-204ENST00000553277 MIA2Q96PC5 1412 aa28.11■■■□□ 2.09
LRP1-204ENST00000553277 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
LRP1-204ENST00000553277 ASXL2Q76L83 1435 aa28.09■■■□□ 2.09
LRP1-204ENST00000553277 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
LRP1-204ENST00000553277 MAPKBP1O60336 1514 aa28.05■■■□□ 2.08
LRP1-204ENST00000553277 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.08
LRP1-204ENST00000553277 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
LRP1-204ENST00000553277 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.02■■■□□ 2.08
LRP1-204ENST00000553277 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28■■■□□ 2.07
LRP1-204ENST00000553277 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.98■■■□□ 2.07
LRP1-204ENST00000553277 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.98■■■□□ 2.07
LRP1-204ENST00000553277 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.98■■■□□ 2.07
LRP1-204ENST00000553277 KCNH8Q96L42 1107 aa27.96■■■□□ 2.07
LRP1-204ENST00000553277 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.95■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 PREX2Q70Z35 1606 aa27.93■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms