RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.85■■■■■ 4.45
LRP1-204ENST00000553277 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.61■■■■□ 3.61
LRP1-204ENST00000553277 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
LRP1-204ENST00000553277 ABCC9O60706 1549 aa35.75■■■■□ 3.31
LRP1-204ENST00000553277 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.56■■■■□ 3.28
LRP1-204ENST00000553277 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.35■■■■□ 3.25
LRP1-204ENST00000553277 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.22■■■■□ 3.23
LRP1-204ENST00000553277 NACADO15069 1562 aa35.14■■■■□ 3.22
LRP1-204ENST00000553277 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.88■■■■□ 3.17
LRP1-204ENST00000553277 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.34■■■■□ 3.09
LRP1-204ENST00000553277 SCRIBQ14160 1630 aa34.32■■■■□ 3.09
LRP1-204ENST00000553277 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.11■■■■□ 3.05
LRP1-204ENST00000553277 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.84■■■■□ 3.01
LRP1-204ENST00000553277 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.58■■■□□ 2.97
LRP1-204ENST00000553277 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.25■■■□□ 2.91
LRP1-204ENST00000553277 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
LRP1-204ENST00000553277 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
LRP1-204ENST00000553277 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.02■■■□□ 2.88
LRP1-204ENST00000553277 SMARCA4P51532 1647 aa32.99■■■□□ 2.87
LRP1-204ENST00000553277 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
LRP1-204ENST00000553277 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
LRP1-204ENST00000553277 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.74■■■□□ 2.83
LRP1-204ENST00000553277 WIZO95785 1651 aa32.68■■■□□ 2.82
LRP1-204ENST00000553277 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.59■■■□□ 2.81
LRP1-204ENST00000553277 SMARCA2P51531 1590 aa32.57■■■□□ 2.8
LRP1-204ENST00000553277 NCAPD3P42695 1498 aa32.45■■■□□ 2.79
LRP1-204ENST00000553277 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
LRP1-204ENST00000553277 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.42■■■□□ 2.78
LRP1-204ENST00000553277 HMGXB3Q12766 1538 aa32.35■■■□□ 2.77
LRP1-204ENST00000553277 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
LRP1-204ENST00000553277 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.05■■■□□ 2.72
LRP1-204ENST00000553277 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.96■■■□□ 2.71
LRP1-204ENST00000553277 CFTRP13569 1480 aa31.58■■■□□ 2.65
LRP1-204ENST00000553277 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.53■■■□□ 2.64
LRP1-204ENST00000553277 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.38■■■□□ 2.61
LRP1-204ENST00000553277 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.37■■■□□ 2.61
LRP1-204ENST00000553277 PRDM2Q13029 1718 aa31.35■■■□□ 2.61
LRP1-204ENST00000553277 NESP48681 1621 aa31.27■■■□□ 2.6
LRP1-204ENST00000553277 ABCC8Q09428 1581 aa31.14■■■□□ 2.58
LRP1-204ENST00000553277 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.12■■■□□ 2.57
LRP1-204ENST00000553277 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.12■■■□□ 2.57
LRP1-204ENST00000553277 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.57
LRP1-204ENST00000553277 TRIM41Q8WV44 630 aa31.03■■■□□ 2.56
LRP1-204ENST00000553277 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.96■■■□□ 2.55
LRP1-204ENST00000553277 SYNJ1O43426 1573 aa30.95■■■□□ 2.54
LRP1-204ENST00000553277 TOP2BQ02880 1626 aa30.93■■■□□ 2.54
LRP1-204ENST00000553277 CUX1P39880 1505 aa30.91■■■□□ 2.54
LRP1-204ENST00000553277 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.91■■■□□ 2.54
LRP1-204ENST00000553277 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.9■■■□□ 2.54
LRP1-204ENST00000553277 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.8■■■□□ 2.52
LRP1-204ENST00000553277 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
LRP1-204ENST00000553277 TOPBP1Q92547 1522 aa30.76■■■□□ 2.51
LRP1-204ENST00000553277 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.72■■■□□ 2.51
LRP1-204ENST00000553277 ERCC6Q03468 1493 aa30.69■■■□□ 2.5
LRP1-204ENST00000553277 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.62■■■□□ 2.49
LRP1-204ENST00000553277 WDR62O43379 1518 aa30.61■■■□□ 2.49
LRP1-204ENST00000553277 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
LRP1-204ENST00000553277 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
LRP1-204ENST00000553277 SOGA1O94964 1423 aa30.51■■■□□ 2.47
LRP1-204ENST00000553277 EEA1Q15075 1411 aa30.5■■■□□ 2.47
LRP1-204ENST00000553277 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.43■■■□□ 2.46
LRP1-204ENST00000553277 CUX2O14529 1486 aa30.4■■■□□ 2.46
LRP1-204ENST00000553277 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.39■■■□□ 2.46
LRP1-204ENST00000553277 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.39■■■□□ 2.46
LRP1-204ENST00000553277 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
LRP1-204ENST00000553277 KIF27Q86VH2 1401 aa30.36■■■□□ 2.45
LRP1-204ENST00000553277 WDR97A6NE52 1622 aa30.33■■■□□ 2.45
LRP1-204ENST00000553277 IFT140Q96RY7 1462 aa30.3■■■□□ 2.44
LRP1-204ENST00000553277 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
LRP1-204ENST00000553277 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.28■■■□□ 2.44
LRP1-204ENST00000553277 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.18■■■□□ 2.42
LRP1-204ENST00000553277 IGF1RP08069 1367 aa30.17■■■□□ 2.42
LRP1-204ENST00000553277 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
LRP1-204ENST00000553277 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.12■■■□□ 2.41
LRP1-204ENST00000553277 PRXQ9BXM0 1461 aa30.1■■■□□ 2.41
LRP1-204ENST00000553277 KIF21BO75037 1637 aa30.08■■■□□ 2.41
LRP1-204ENST00000553277 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.07■■■□□ 2.4
LRP1-204ENST00000553277 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
LRP1-204ENST00000553277 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.05■■■□□ 2.4
LRP1-204ENST00000553277 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.47e-7■■■■□ 23.2
LRP1-204ENST00000553277 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
LRP1-204ENST00000553277 GRIN2BQ13224 1484 aa29.97■■■□□ 2.39
LRP1-204ENST00000553277 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.96■■■□□ 2.39
LRP1-204ENST00000553277 GOLGA3Q08378 1498 aa29.96■■■□□ 2.39
LRP1-204ENST00000553277 CUL7Q14999 1698 aa29.96■■■□□ 2.39
LRP1-204ENST00000553277 PBRM1Q86U86 1689 aa29.93■■■□□ 2.38
LRP1-204ENST00000553277 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.93■■■□□ 2.38
LRP1-204ENST00000553277 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.84■■■□□ 2.37
LRP1-204ENST00000553277 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.82■■■□□ 2.36
LRP1-204ENST00000553277 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
LRP1-204ENST00000553277 ADAMTS12P58397 1594 aa29.79■■■□□ 2.36
LRP1-204ENST00000553277 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.75■■■□□ 2.35
LRP1-204ENST00000553277 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.74■■■□□ 2.35
LRP1-204ENST00000553277 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
LRP1-204ENST00000553277 SYNJ2O15056 1496 aa29.66■■■□□ 2.34
LRP1-204ENST00000553277 HRCP23327 699 aa29.66■■■□□ 2.34
LRP1-204ENST00000553277 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.63■■■□□ 2.33
LRP1-204ENST00000553277 GRIN2AQ12879 1464 aa29.59■■■□□ 2.33
LRP1-204ENST00000553277 CEP162Q5TB80 1403 aa29.57■■■□□ 2.32
LRP1-204ENST00000553277 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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