RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 MAPKBP1O60336 1514 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-230ENST00000551968 KDM6BO15054 1643 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 JPH4Q96JJ6 628 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.17■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 TSPOAP1O95153 1857 aa25.16■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 TOP2BQ02880 1626 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-230ENST00000551968 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
CS-230ENST00000551968 ADGRL1O94910 1474 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-230ENST00000551968 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CS-230ENST00000551968 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.86■■□□□ 1.57
CS-230ENST00000551968 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-230ENST00000551968 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CS-230ENST00000551968 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CS-230ENST00000551968 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CS-230ENST00000551968 PTPRGP23470 1445 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-230ENST00000551968 ASXL2Q76L83 1435 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-230ENST00000551968 GLI2P10070 1586 aa24.77■■□□□ 1.56
CS-230ENST00000551968 ABCC2Q92887 1545 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-230ENST00000551968 CUL7Q14999 1698 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-230ENST00000551968 IGF1RP08069 1367 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-230ENST00000551968 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.7■■□□□ 1.54
CS-230ENST00000551968 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-230ENST00000551968 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-230ENST00000551968 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CS-230ENST00000551968 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.61■■□□□ 1.53
CS-230ENST00000551968 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.57■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 UACAQ9BZF9 1416 aa24.57■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 KIF27Q86VH2 1401 aa24.56■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.54■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 DISP1Q96F81 1524 aa24.53■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 IQGAP2Q13576 1575 aa24.53■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.52■■□□□ 1.52
CS-230ENST00000551968 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.51■■□□□ 1.51
CS-230ENST00000551968 FBXO41Q8TF61 875 aa24.46■■□□□ 1.51
CS-230ENST00000551968 KIF21BO75037 1637 aa24.41■■□□□ 1.5
CS-230ENST00000551968 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.38■■□□□ 1.49
CS-230ENST00000551968 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-230ENST00000551968 KIAA0556O60303 1618 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-230ENST00000551968 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.32■■□□□ 1.48
CS-230ENST00000551968 CD109Q6YHK3 1445 aa24.31■■□□□ 1.48
CS-230ENST00000551968 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-230ENST00000551968 KCNH8Q96L42 1107 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-230ENST00000551968 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.23■■□□□ 1.47
CS-230ENST00000551968 PTPRMP28827 1452 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-230ENST00000551968 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.19■■□□□ 1.46
CS-230ENST00000551968 ABCA8O94911 1581 aa24.19■■□□□ 1.46
CS-230ENST00000551968 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.16■■□□□ 1.46
CS-230ENST00000551968 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-230ENST00000551968 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CS-230ENST00000551968 MADDQ8WXG6 1647 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-230ENST00000551968 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-230ENST00000551968 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.08■■□□□ 1.45
CS-230ENST00000551968 ARID3CA6NKF2 412 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-230ENST00000551968 RAPGEF3O95398 923 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-230ENST00000551968 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-230ENST00000551968 GOLGA3Q08378 1498 aa24■■□□□ 1.43
CS-230ENST00000551968 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24■■□□□ 1.43
CS-230ENST00000551968 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-230ENST00000551968 HSPA2P54652 639 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-230ENST00000551968 ATP10BO94823 1461 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-230ENST00000551968 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CS-230ENST00000551968 ILDR2Q71H61 639 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-230ENST00000551968 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-230ENST00000551968 NEO1Q92859 1461 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-230ENST00000551968 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-230ENST00000551968 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-230ENST00000551968 CERKQ8TCT0 537 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-230ENST00000551968 P3H3Q8IVL6 736 aa23.87■■□□□ 1.41
CS-230ENST00000551968 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.87■■□□□ 1.41
CS-230ENST00000551968 RICTORQ6R327 1708 aa23.82■■□□□ 1.4
CS-230ENST00000551968 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.79■■□□□ 1.4
CS-230ENST00000551968 PRXQ9BXM0 1461 aa23.79■■□□□ 1.4
CS-230ENST00000551968 SOCS7O14512 581 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-230ENST00000551968 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.77■■□□□ 1.4
CS-230ENST00000551968 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CS-230ENST00000551968 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.73■■□□□ 1.39
CS-230ENST00000551968 SAMD9Q5K651 1589 aa23.72■■□□□ 1.39
CS-230ENST00000551968 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-230ENST00000551968 AKNAQ7Z591 1439 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 FANCAO15360 1455 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 MLECQ14165 292 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 STRCQ7RTU9 1775 aa23.65■■□□□ 1.38
CS-230ENST00000551968 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.372e-20■□□□□ 10.1
CS-230ENST00000551968 HECW1Q76N89 1606 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-230ENST00000551968 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-230ENST00000551968 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-230ENST00000551968 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-230ENST00000551968 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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