RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551127.5

TPCN1-218, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 2

Gene TPCN1, Length 2,975 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-218ENST00000551127 IGF1RP08069 1367 aa19.71■□□□□ 0.75
TPCN1-218ENST00000551127 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
TPCN1-218ENST00000551127 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 36.4
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TPCN1-218ENST00000551127 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.62■□□□□ 0.73
TPCN1-218ENST00000551127 PRXQ9BXM0 1461 aa19.62■□□□□ 0.73
TPCN1-218ENST00000551127 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
TPCN1-218ENST00000551127 BCL11AQ9H165 835 aa19.6■□□□□ 0.73
TPCN1-218ENST00000551127 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.56■□□□□ 0.72
TPCN1-218ENST00000551127 WDR62O43379 1518 aa19.54■□□□□ 0.72
TPCN1-218ENST00000551127 APLP2Q06481 763 aa19.54■□□□□ 0.72
TPCN1-218ENST00000551127 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
TPCN1-218ENST00000551127 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
TPCN1-218ENST00000551127 P3H3Q8IVL6 736 aa19.53■□□□□ 0.72
TPCN1-218ENST00000551127 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
TPCN1-218ENST00000551127 FBLN2P98095 1184 aa19.49■□□□□ 0.71
TPCN1-218ENST00000551127 WDR97A6NE52 1622 aa19.49■□□□□ 0.71
TPCN1-218ENST00000551127 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.45■□□□□ 0.7
TPCN1-218ENST00000551127 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.45■□□□□ 0.7
TPCN1-218ENST00000551127 IFT140Q96RY7 1462 aa19.43■□□□□ 0.7
TPCN1-218ENST00000551127 ARAP1Q96P48 1450 aa19.4■□□□□ 0.7
TPCN1-218ENST00000551127 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
TPCN1-218ENST00000551127 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
TPCN1-218ENST00000551127 PBRM1Q86U86 1689 aa19.34■□□□□ 0.69
TPCN1-218ENST00000551127 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.33■□□□□ 0.69
TPCN1-218ENST00000551127 GRIN2BQ13224 1484 aa19.33■□□□□ 0.69
TPCN1-218ENST00000551127 MAPKBP1O60336 1514 aa19.32■□□□□ 0.68
TPCN1-218ENST00000551127 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
TPCN1-218ENST00000551127 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
TPCN1-218ENST00000551127 KCNH8Q96L42 1107 aa19.3■□□□□ 0.68
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TPCN1-218ENST00000551127 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.29■□□□□ 0.68
TPCN1-218ENST00000551127 FKBP8Q14318 412 aa19.29■□□□□ 0.68
TPCN1-218ENST00000551127 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.27■□□□□ 0.68
TPCN1-218ENST00000551127 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
TPCN1-218ENST00000551127 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.26■□□□□ 0.67
TPCN1-218ENST00000551127 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.25■□□□□ 0.67
TPCN1-218ENST00000551127 ADAMTS12P58397 1594 aa19.23■□□□□ 0.67
TPCN1-218ENST00000551127 ARID3CA6NKF2 412 aa19.22■□□□□ 0.67
TPCN1-218ENST00000551127 BCANQ96GW7 911 aa19.21■□□□□ 0.67
TPCN1-218ENST00000551127 CCER2I3L3R5 266 aa19.2■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.18■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 NEFLP07196 543 aa19.17■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 MAP3K1Q13233 1512 aa19.17■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.15■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.14■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.14■□□□□ 0.66
TPCN1-218ENST00000551127 GRIN2AQ12879 1464 aa19.14■□□□□ 0.65
TPCN1-218ENST00000551127 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
TPCN1-218ENST00000551127 MSH5O43196 834 aa19.11■□□□□ 0.65
TPCN1-218ENST00000551127 SYNJ2O15056 1496 aa19.1■□□□□ 0.65
TPCN1-218ENST00000551127 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
TPCN1-218ENST00000551127 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.1■□□□□ 0.65
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TPCN1-218ENST00000551127 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TPCN1-218ENST00000551127 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.99■□□□□ 0.63
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TPCN1-218ENST00000551127 ITGAEP38570 1179 aa18.98■□□□□ 0.63
TPCN1-218ENST00000551127 CHD1O14646 1710 aa18.97■□□□□ 0.63
TPCN1-218ENST00000551127 TRIM52Q96A61 297 aa18.96■□□□□ 0.63
TPCN1-218ENST00000551127 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.96■□□□□ 0.63
TPCN1-218ENST00000551127 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.95■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.95■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 SAMD9Q5K651 1589 aa18.94■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.94■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 NUP160Q12769 1436 aa18.92■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.92■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 DISP1Q96F81 1524 aa18.92■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 FMN1Q68DA7 1419 aa18.91■□□□□ 0.62
TPCN1-218ENST00000551127 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
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TPCN1-218ENST00000551127 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.89■□□□□ 0.61
TPCN1-218ENST00000551127 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.87■□□□□ 0.61
TPCN1-218ENST00000551127 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.87■□□□□ 0.61
TPCN1-218ENST00000551127 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TPCN1-218ENST00000551127 KIAA0556O60303 1618 aa18.85■□□□□ 0.61
TPCN1-218ENST00000551127 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.83■□□□□ 0.61
TPCN1-218ENST00000551127 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.83■□□□□ 0.61
TPCN1-218ENST00000551127 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.83■□□□□ 0.6
TPCN1-218ENST00000551127 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
TPCN1-218ENST00000551127 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.81■□□□□ 0.6
TPCN1-218ENST00000551127 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.81■□□□□ 0.6
TPCN1-218ENST00000551127 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.8■□□□□ 0.6
TPCN1-218ENST00000551127 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
TPCN1-218ENST00000551127 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.79■□□□□ 0.6
TPCN1-218ENST00000551127 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.77■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.76■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 TONSLQ96HA7 1378 aa18.73■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.72■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 PTPRGP23470 1445 aa18.72■□□□□ 0.59
TPCN1-218ENST00000551127 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
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