RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550795.1

PXN-217, Transcript of paxillin, humanhuman

TSL 3

Gene PXN, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXN-217ENST00000550795 IGF1RP08069 1367 aa41.97■■■■■ 4.31
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PXN-217ENST00000550795 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.8■■■■■ 4.28
PXN-217ENST00000550795 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.73■■■■■ 4.27
PXN-217ENST00000550795 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.69■■■■■ 4.26
PXN-217ENST00000550795 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.66■■■■■ 4.26
PXN-217ENST00000550795 IQGAP2Q13576 1575 aa41.52■■■■■ 4.24
PXN-217ENST00000550795 MAPKBP1O60336 1514 aa41.49■■■■■ 4.23
PXN-217ENST00000550795 DIP2BQ9P265 1576 aa41.41■■■■■ 4.22
PXN-217ENST00000550795 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.37■■■■■ 4.21
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PXN-217ENST00000550795 DISP1Q96F81 1524 aa41.32■■■■■ 4.2
PXN-217ENST00000550795 PTPRGP23470 1445 aa41.28■■■■■ 4.2
PXN-217ENST00000550795 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.27■■■■■ 4.2
PXN-217ENST00000550795 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.26■■■■■ 4.2
PXN-217ENST00000550795 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.26■■■■■ 4.2
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PXN-217ENST00000550795 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.2■■■■■ 4.19
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PXN-217ENST00000550795 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.87■■■■■ 4.13
PXN-217ENST00000550795 EEA1Q15075 1411 aa40.85■■■■■ 4.13
PXN-217ENST00000550795 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
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PXN-217ENST00000550795 ABCA8O94911 1581 aa40.79■■■■■ 4.12
PXN-217ENST00000550795 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.78■■■■■ 4.12
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PXN-217ENST00000550795 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.45■■■■■ 4.07
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PXN-217ENST00000550795 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.83■■■■□ 3.97
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PXN-217ENST00000550795 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.72■■■■□ 3.95
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PXN-217ENST00000550795 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.47■■■■□ 3.91
PXN-217ENST00000550795 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.45■■■■□ 3.91
PXN-217ENST00000550795 PLCH2O75038 1416 aa39.44■■■■□ 3.9
PXN-217ENST00000550795 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
PXN-217ENST00000550795 MADDQ8WXG6 1647 aa39.41■■■■□ 3.9
PXN-217ENST00000550795 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
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