RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550795.1

PXN-217, Transcript of paxillin, humanhuman

TSL 3

Gene PXN, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXN-217ENST00000550795 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.24■■■■■ 7.23
PXN-217ENST00000550795 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.07■■■■■ 6.25
PXN-217ENST00000550795 ABCC9O60706 1549 aa53.65■■■■■ 6.18
PXN-217ENST00000550795 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.2■■■■■ 5.79
PXN-217ENST00000550795 NACADO15069 1562 aa50.92■■■■■ 5.74
PXN-217ENST00000550795 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.38■■■■■ 5.66
PXN-217ENST00000550795 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.33■■■■■ 5.65
PXN-217ENST00000550795 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.33■■■■■ 5.65
PXN-217ENST00000550795 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.06■■■■■ 5.6
PXN-217ENST00000550795 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
PXN-217ENST00000550795 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.86■■■■■ 5.57
PXN-217ENST00000550795 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.86■■■■■ 5.57
PXN-217ENST00000550795 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.8■■■■■ 5.56
PXN-217ENST00000550795 SCRIBQ14160 1630 aa49.23■■■■■ 5.47
PXN-217ENST00000550795 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.08■■■■■ 5.45
PXN-217ENST00000550795 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.57■■■■■ 5.37
PXN-217ENST00000550795 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
PXN-217ENST00000550795 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.28■■■■■ 5.32
PXN-217ENST00000550795 SMARCA4P51532 1647 aa47.01■■■■■ 5.12
PXN-217ENST00000550795 NCAPD3P42695 1498 aa46.96■■■■■ 5.11
PXN-217ENST00000550795 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.89■■■■■ 5.1
PXN-217ENST00000550795 SMARCA2P51531 1590 aa46.77■■■■■ 5.08
PXN-217ENST00000550795 HMGXB3Q12766 1538 aa46.74■■■■■ 5.07
PXN-217ENST00000550795 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
PXN-217ENST00000550795 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.56■■■■■ 5.04
PXN-217ENST00000550795 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.46■■■■■ 5.03
PXN-217ENST00000550795 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
PXN-217ENST00000550795 NESP48681 1621 aa46.23■■■■■ 4.99
PXN-217ENST00000550795 ERCC6Q03468 1493 aa46.21■■■■■ 4.99
PXN-217ENST00000550795 CUX2O14529 1486 aa46.12■■■■■ 4.97
PXN-217ENST00000550795 WIZO95785 1651 aa45.96■■■■■ 4.95
PXN-217ENST00000550795 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.92■■■■■ 4.94
PXN-217ENST00000550795 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
PXN-217ENST00000550795 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.76■■■■■ 4.92
PXN-217ENST00000550795 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.67■■■■■ 4.9
PXN-217ENST00000550795 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
PXN-217ENST00000550795 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.49■■■■■ 4.87
PXN-217ENST00000550795 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.48■■■■■ 4.87
PXN-217ENST00000550795 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
PXN-217ENST00000550795 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.21■■■■■ 4.83
PXN-217ENST00000550795 WDR62O43379 1518 aa45.17■■■■■ 4.82
PXN-217ENST00000550795 CFTRP13569 1480 aa45.1■■■■■ 4.81
PXN-217ENST00000550795 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.06■■■■■ 4.8
PXN-217ENST00000550795 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.04■■■■■ 4.8
PXN-217ENST00000550795 PRDM2Q13029 1718 aa44.92■■■■■ 4.78
PXN-217ENST00000550795 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.76■■■■■ 4.76
PXN-217ENST00000550795 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
PXN-217ENST00000550795 TOPBP1Q92547 1522 aa44.26■■■■■ 4.68
PXN-217ENST00000550795 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.15■■■■■ 4.66
PXN-217ENST00000550795 IFT140Q96RY7 1462 aa44.14■■■■■ 4.66
PXN-217ENST00000550795 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
PXN-217ENST00000550795 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
PXN-217ENST00000550795 ABCC8Q09428 1581 aa44.05■■■■■ 4.64
PXN-217ENST00000550795 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
PXN-217ENST00000550795 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
PXN-217ENST00000550795 OSCARQ8IYS5 282 aa43.84■■■■■ 4.61
PXN-217ENST00000550795 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
PXN-217ENST00000550795 TRIM41Q8WV44 630 aa43.71■■■■■ 4.59
PXN-217ENST00000550795 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.583e-6■■□□□ 13.8
PXN-217ENST00000550795 CHD1O14646 1710 aa43.65■■■■■ 4.58
PXN-217ENST00000550795 CUX1P39880 1505 aa43.64■■■■■ 4.58
PXN-217ENST00000550795 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.64■■■■■ 4.58
PXN-217ENST00000550795 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.59■■■■■ 4.57
PXN-217ENST00000550795 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.58■■■■■ 4.57
PXN-217ENST00000550795 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.58■■■■■ 4.57
PXN-217ENST00000550795 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.58■■■■■ 4.57
PXN-217ENST00000550795 SOGA1O94964 1423 aa43.49■■■■■ 4.55
PXN-217ENST00000550795 WDR97A6NE52 1622 aa43.47■■■■■ 4.55
PXN-217ENST00000550795 ARHGEF11O15085 1522 aa43.41■■■■■ 4.54
PXN-217ENST00000550795 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
PXN-217ENST00000550795 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.3■■■■■ 4.52
PXN-217ENST00000550795 PBRM1Q86U86 1689 aa43.22■■■■■ 4.51
PXN-217ENST00000550795 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
PXN-217ENST00000550795 GRIN2BQ13224 1484 aa43.15■■■■■ 4.5
PXN-217ENST00000550795 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.15■■■■■ 4.5
PXN-217ENST00000550795 FBLN2P98095 1184 aa43.11■■■■■ 4.49
PXN-217ENST00000550795 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.1■■■■■ 4.49
PXN-217ENST00000550795 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.1■■■■■ 4.49
PXN-217ENST00000550795 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.08■■■■■ 4.49
PXN-217ENST00000550795 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.03■■■■■ 4.48
PXN-217ENST00000550795 ARAP1Q96P48 1450 aa43.02■■■■■ 4.48
PXN-217ENST00000550795 SYNJ1O43426 1573 aa43.02■■■■■ 4.48
PXN-217ENST00000550795 TOP2BQ02880 1626 aa43.01■■■■■ 4.48
PXN-217ENST00000550795 SYNJ2O15056 1496 aa43■■■■■ 4.47
PXN-217ENST00000550795 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.9■■■■■ 4.46
PXN-217ENST00000550795 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
PXN-217ENST00000550795 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.82■■■■■ 4.45
PXN-217ENST00000550795 ADAMTS12P58397 1594 aa42.78■■■■■ 4.44
PXN-217ENST00000550795 GRIN2AQ12879 1464 aa42.65■■■■■ 4.42
PXN-217ENST00000550795 CEP170Q5SW79 1584 aa42.59■■■■■ 4.41
PXN-217ENST00000550795 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.56■■■■■ 4.4
PXN-217ENST00000550795 NUP160Q12769 1436 aa42.52■■■■■ 4.4
PXN-217ENST00000550795 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.48■■■■■ 4.39
PXN-217ENST00000550795 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.47■■■■■ 4.39
PXN-217ENST00000550795 SHROOM2Q13796 1616 aa42.41■■■■■ 4.38
PXN-217ENST00000550795 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.2■■■■■ 4.35
PXN-217ENST00000550795 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
PXN-217ENST00000550795 CUL7Q14999 1698 aa42.06■■■■■ 4.32
PXN-217ENST00000550795 KIF27Q86VH2 1401 aa42.02■■■■■ 4.32
PXN-217ENST00000550795 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
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