RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548971.5

TARBP2-209, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-209	ENST00000548971	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.78	■■■■□ 3
TARBP2-209	ENST00000548971	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.76	■■■□□ 2.99
TARBP2-209	ENST00000548971	KIF21B	O75037	1637 aa		33.7	■■■□□ 2.99
TARBP2-209	ENST00000548971	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TARBP2-209	ENST00000548971	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TARBP2-209	ENST00000548971	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TARBP2-209	ENST00000548971	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TARBP2-209	ENST00000548971	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TARBP2-209	ENST00000548971	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TARBP2-209	ENST00000548971	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
TARBP2-209	ENST00000548971	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TARBP2-209	ENST00000548971	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TARBP2-209	ENST00000548971	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TARBP2-209	ENST00000548971	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TARBP2-209	ENST00000548971	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TARBP2-209	ENST00000548971	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
TARBP2-209	ENST00000548971	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TARBP2-209	ENST00000548971	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TARBP2-209	ENST00000548971	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
TARBP2-209	ENST00000548971	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
TARBP2-209	ENST00000548971	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TARBP2-209	ENST00000548971	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TARBP2-209	ENST00000548971	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TARBP2-209	ENST00000548971	PTPRG	P23470	1445 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TARBP2-209	ENST00000548971	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TARBP2-209	ENST00000548971	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TARBP2-209	ENST00000548971	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TARBP2-209	ENST00000548971	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TARBP2-209	ENST00000548971	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TARBP2-209	ENST00000548971	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TARBP2-209	ENST00000548971	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TARBP2-209	ENST00000548971	CLIP1	P30622	1438 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TARBP2-209	ENST00000548971	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TARBP2-209	ENST00000548971	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TARBP2-209	ENST00000548971	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.87	■■■□□ 2.85
TARBP2-209	ENST00000548971	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TARBP2-209	ENST00000548971	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TARBP2-209	ENST00000548971	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
TARBP2-209	ENST00000548971	ABCA8	O94911	1581 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TARBP2-209	ENST00000548971	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TARBP2-209	ENST00000548971	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TARBP2-209	ENST00000548971	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
TARBP2-209	ENST00000548971	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TARBP2-209	ENST00000548971	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TARBP2-209	ENST00000548971	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TARBP2-209	ENST00000548971	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
TARBP2-209	ENST00000548971	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TARBP2-209	ENST00000548971	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TARBP2-209	ENST00000548971	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TARBP2-209	ENST00000548971	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TARBP2-209	ENST00000548971	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TARBP2-209	ENST00000548971	ATP10B	O94823	1461 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TARBP2-209	ENST00000548971	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.51	■■■□□ 2.8
TARBP2-209	ENST00000548971	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TARBP2-209	ENST00000548971	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TARBP2-209	ENST00000548971	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TARBP2-209	ENST00000548971	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TARBP2-209	ENST00000548971	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TARBP2-209	ENST00000548971	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TARBP2-209	ENST00000548971	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TARBP2-209	ENST00000548971	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TARBP2-209	ENST00000548971	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TARBP2-209	ENST00000548971	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TARBP2-209	ENST00000548971	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TARBP2-209	ENST00000548971	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
TARBP2-209	ENST00000548971	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TARBP2-209	ENST00000548971	GLI2	P10070	1586 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TARBP2-209	ENST00000548971	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TARBP2-209	ENST00000548971	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TARBP2-209	ENST00000548971	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TARBP2-209	ENST00000548971	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TARBP2-209	ENST00000548971	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
TARBP2-209	ENST00000548971	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TARBP2-209	ENST00000548971	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.73
TARBP2-209	ENST00000548971	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.14	■■■□□ 2.73
TARBP2-209	ENST00000548971	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TARBP2-209	ENST00000548971	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TARBP2-209	ENST00000548971	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TARBP2-209	ENST00000548971	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TARBP2-209	ENST00000548971	KIF14	Q15058	1648 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TARBP2-209	ENST00000548971	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TARBP2-209	ENST00000548971	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72
TARBP2-209	ENST00000548971	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TARBP2-209	ENST00000548971	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
TARBP2-209	ENST00000548971	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TARBP2-209	ENST00000548971	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TARBP2-209	ENST00000548971	KDM6B	O15054	1643 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TARBP2-209	ENST00000548971	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TARBP2-209	ENST00000548971	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TARBP2-209	ENST00000548971	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TARBP2-209	ENST00000548971	APLP2	Q06481	763 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TARBP2-209	ENST00000548971	FANCA	O15360	1455 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TARBP2-209	ENST00000548971	PLCH2	O75038	1416 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TARBP2-209	ENST00000548971	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TARBP2-209	ENST00000548971	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TARBP2-209	ENST00000548971	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
TARBP2-209	ENST00000548971	NEO1	Q92859	1461 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TARBP2-209	ENST00000548971	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
TARBP2-209	ENST00000548971	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TARBP2-209	ENST00000548971	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.78	■■■□□ 2.68

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