RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548465.1

TPCN1-211, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 3

Gene TPCN1, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-211ENST00000548465 JPH4Q96JJ6 628 aa22.45■■□□□ 1.18
TPCN1-211ENST00000548465 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TPCN1-211ENST00000548465 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-211ENST00000548465 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-211ENST00000548465 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.35■■□□□ 1.17
TPCN1-211ENST00000548465 PRXQ9BXM0 1461 aa22.32■■□□□ 1.16
TPCN1-211ENST00000548465 IQGAP2Q13576 1575 aa22.3■■□□□ 1.16
TPCN1-211ENST00000548465 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.26■■□□□ 1.15
TPCN1-211ENST00000548465 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TPCN1-211ENST00000548465 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.2■■□□□ 1.15
TPCN1-211ENST00000548465 EEA1Q15075 1411 aa22.19■■□□□ 1.14
TPCN1-211ENST00000548465 DISP1Q96F81 1524 aa22.19■■□□□ 1.14
TPCN1-211ENST00000548465 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.18■■□□□ 1.14
TPCN1-211ENST00000548465 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TPCN1-211ENST00000548465 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TPCN1-211ENST00000548465 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
TPCN1-211ENST00000548465 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.14■■□□□ 1.14
TPCN1-211ENST00000548465 PTPRGP23470 1445 aa22.13■■□□□ 1.13
TPCN1-211ENST00000548465 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.12■■□□□ 1.13
TPCN1-211ENST00000548465 KIAA0556O60303 1618 aa22.11■■□□□ 1.13
TPCN1-211ENST00000548465 KIF21BO75037 1637 aa22.04■■□□□ 1.12
TPCN1-211ENST00000548465 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.02■■□□□ 1.12
TPCN1-211ENST00000548465 GOLGA3Q08378 1498 aa21.99■■□□□ 1.11
TPCN1-211ENST00000548465 UACAQ9BZF9 1416 aa21.98■■□□□ 1.11
TPCN1-211ENST00000548465 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
TPCN1-211ENST00000548465 P3H3Q8IVL6 736 aa21.97■■□□□ 1.11
TPCN1-211ENST00000548465 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.96■■□□□ 1.11
TPCN1-211ENST00000548465 MAPKBP1O60336 1514 aa21.96■■□□□ 1.11
TPCN1-211ENST00000548465 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TPCN1-211ENST00000548465 ABCC2Q92887 1545 aa21.95■■□□□ 1.1
TPCN1-211ENST00000548465 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.94■■□□□ 1.1
TPCN1-211ENST00000548465 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.94■■□□□ 1.1
TPCN1-211ENST00000548465 SAMD9Q5K651 1589 aa21.92■■□□□ 1.1
TPCN1-211ENST00000548465 ABCA8O94911 1581 aa21.88■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.88■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 DIP2BQ9P265 1576 aa21.87■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.86■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.85■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 ASXL2Q76L83 1435 aa21.84■■□□□ 1.09
TPCN1-211ENST00000548465 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.82■■□□□ 1.08
TPCN1-211ENST00000548465 ARID3CA6NKF2 412 aa21.77■■□□□ 1.08
TPCN1-211ENST00000548465 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.75■■□□□ 1.07
TPCN1-211ENST00000548465 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-211ENST00000548465 TSPOAP1O95153 1857 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-211ENST00000548465 ATP10BO94823 1461 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-211ENST00000548465 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-211ENST00000548465 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
TPCN1-211ENST00000548465 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-211ENST00000548465 GLI2P10070 1586 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-211ENST00000548465 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-211ENST00000548465 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TPCN1-211ENST00000548465 KCNH8Q96L42 1107 aa21.63■■□□□ 1.05
TPCN1-211ENST00000548465 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.62■■□□□ 1.05
TPCN1-211ENST00000548465 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TPCN1-211ENST00000548465 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TPCN1-211ENST00000548465 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TPCN1-211ENST00000548465 FMN1Q68DA7 1419 aa21.55■■□□□ 1.04
TPCN1-211ENST00000548465 KDM6BO15054 1643 aa21.53■■□□□ 1.04
TPCN1-211ENST00000548465 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.51■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 CLIP1P30622 1438 aa21.51■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 CD109Q6YHK3 1445 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 HECW1Q76N89 1606 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.45■■□□□ 1.03
TPCN1-211ENST00000548465 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-211ENST00000548465 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-211ENST00000548465 CEP162Q5TB80 1403 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-211ENST00000548465 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-211ENST00000548465 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
TPCN1-211ENST00000548465 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.37■■□□□ 1.01
TPCN1-211ENST00000548465 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.34■■□□□ 1.01
TPCN1-211ENST00000548465 KIF14Q15058 1648 aa21.32■■□□□ 1
TPCN1-211ENST00000548465 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
TPCN1-211ENST00000548465 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.29■■□□□ 1
TPCN1-211ENST00000548465 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
TPCN1-211ENST00000548465 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.28■■□□□ 1
TPCN1-211ENST00000548465 NEO1Q92859 1461 aa21.26■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 FANCAO15360 1455 aa21.24■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 RAPGEF3O95398 923 aa21.22■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.22■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 PLCH2O75038 1416 aa21.21■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.21■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.21■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 AKNAQ7Z591 1439 aa21.21■□□□□ 0.99
TPCN1-211ENST00000548465 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.18■□□□□ 0.98
TPCN1-211ENST00000548465 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.14■□□□□ 0.97
TPCN1-211ENST00000548465 RICTORQ6R327 1708 aa21.14■□□□□ 0.97
TPCN1-211ENST00000548465 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TPCN1-211ENST00000548465 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.13■□□□□ 0.97
TPCN1-211ENST00000548465 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.13■□□□□ 0.97
TPCN1-211ENST00000548465 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.13■□□□□ 0.97
TPCN1-211ENST00000548465 ADGRL1O94910 1474 aa21.12■□□□□ 0.97
TPCN1-211ENST00000548465 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.11■□□□□ 0.97
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