RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548465.1

TPCN1-211, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 3

Gene TPCN1, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-211ENST00000548465 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.42■■■□□ 2.78
TPCN1-211ENST00000548465 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.82■■■□□ 2.2
TPCN1-211ENST00000548465 ABCC9O60706 1549 aa28.38■■■□□ 2.13
TPCN1-211ENST00000548465 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.18■■□□□ 1.94
TPCN1-211ENST00000548465 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.16■■□□□ 1.94
TPCN1-211ENST00000548465 NACADO15069 1562 aa27.11■■□□□ 1.93
TPCN1-211ENST00000548465 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TPCN1-211ENST00000548465 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.88■■□□□ 1.89
TPCN1-211ENST00000548465 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.75■■□□□ 1.87
TPCN1-211ENST00000548465 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.65■■□□□ 1.86
TPCN1-211ENST00000548465 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
TPCN1-211ENST00000548465 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.45■■□□□ 1.82
TPCN1-211ENST00000548465 SCRIBQ14160 1630 aa26.38■■□□□ 1.81
TPCN1-211ENST00000548465 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.21■■□□□ 1.79
TPCN1-211ENST00000548465 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.99■■□□□ 1.75
TPCN1-211ENST00000548465 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TPCN1-211ENST00000548465 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.65■■□□□ 1.7
TPCN1-211ENST00000548465 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.47■■□□□ 1.67
TPCN1-211ENST00000548465 SMARCA4P51532 1647 aa25.19■■□□□ 1.62
TPCN1-211ENST00000548465 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TPCN1-211ENST00000548465 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.07■■□□□ 1.6
TPCN1-211ENST00000548465 NCAPD3P42695 1498 aa25.04■■□□□ 1.6
TPCN1-211ENST00000548465 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.04■■□□□ 1.6
TPCN1-211ENST00000548465 SMARCA2P51531 1590 aa24.98■■□□□ 1.59
TPCN1-211ENST00000548465 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.9■■□□□ 1.58
TPCN1-211ENST00000548465 HMGXB3Q12766 1538 aa24.89■■□□□ 1.57
TPCN1-211ENST00000548465 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TPCN1-211ENST00000548465 WIZO95785 1651 aa24.77■■□□□ 1.56
TPCN1-211ENST00000548465 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TPCN1-211ENST00000548465 NESP48681 1621 aa24.57■■□□□ 1.52
TPCN1-211ENST00000548465 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TPCN1-211ENST00000548465 ERCC6Q03468 1493 aa24.41■■□□□ 1.5
TPCN1-211ENST00000548465 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.37■■□□□ 1.49
TPCN1-211ENST00000548465 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.3■■□□□ 1.48
TPCN1-211ENST00000548465 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.24■■□□□ 1.47
TPCN1-211ENST00000548465 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.2■■□□□ 1.46
TPCN1-211ENST00000548465 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.19■■□□□ 1.46
TPCN1-211ENST00000548465 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TPCN1-211ENST00000548465 CUX2O14529 1486 aa24.15■■□□□ 1.46
TPCN1-211ENST00000548465 CFTRP13569 1480 aa24.15■■□□□ 1.46
TPCN1-211ENST00000548465 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.05■■□□□ 1.44
TPCN1-211ENST00000548465 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TPCN1-211ENST00000548465 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.01■■□□□ 1.43
TPCN1-211ENST00000548465 MRC2Q9UBG0 1479 aa24■■□□□ 1.43
TPCN1-211ENST00000548465 PRDM2Q13029 1718 aa23.95■■□□□ 1.42
TPCN1-211ENST00000548465 WDR62O43379 1518 aa23.93■■□□□ 1.42
TPCN1-211ENST00000548465 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TPCN1-211ENST00000548465 TOPBP1Q92547 1522 aa23.67■■□□□ 1.38
TPCN1-211ENST00000548465 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.61■■□□□ 1.37
TPCN1-211ENST00000548465 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.58■■□□□ 1.37
TPCN1-211ENST00000548465 ABCC8Q09428 1581 aa23.56■■□□□ 1.36
TPCN1-211ENST00000548465 IFT140Q96RY7 1462 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-211ENST00000548465 CUX1P39880 1505 aa23.49■■□□□ 1.35
TPCN1-211ENST00000548465 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TPCN1-211ENST00000548465 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TPCN1-211ENST00000548465 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.4■■□□□ 1.34
TPCN1-211ENST00000548465 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.4■■□□□ 1.34
TPCN1-211ENST00000548465 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TPCN1-211ENST00000548465 SOGA1O94964 1423 aa23.35■■□□□ 1.33
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TPCN1-211ENST00000548465 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TPCN1-211ENST00000548465 SYNJ1O43426 1573 aa23.25■■□□□ 1.31
TPCN1-211ENST00000548465 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
TPCN1-211ENST00000548465 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.22■■□□□ 1.31
TPCN1-211ENST00000548465 WDR97A6NE52 1622 aa23.21■■□□□ 1.31
TPCN1-211ENST00000548465 TOP2BQ02880 1626 aa23.21■■□□□ 1.31
TPCN1-211ENST00000548465 OSCARQ8IYS5 282 aa23.16■■□□□ 1.3
TPCN1-211ENST00000548465 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.13■■□□□ 1.29
TPCN1-211ENST00000548465 CHD1O14646 1710 aa23.1■■□□□ 1.29
TPCN1-211ENST00000548465 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.09■■□□□ 1.29
TPCN1-211ENST00000548465 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.08■■□□□ 1.28
TPCN1-211ENST00000548465 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.07■■□□□ 1.28
TPCN1-211ENST00000548465 GRIN2BQ13224 1484 aa23.06■■□□□ 1.28
TPCN1-211ENST00000548465 PBRM1Q86U86 1689 aa23.05■■□□□ 1.28
TPCN1-211ENST00000548465 FBLN2P98095 1184 aa23.04■■□□□ 1.28
TPCN1-211ENST00000548465 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TPCN1-211ENST00000548465 SYNJ2O15056 1496 aa22.93■■□□□ 1.26
TPCN1-211ENST00000548465 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TPCN1-211ENST00000548465 ADAMTS12P58397 1594 aa22.86■■□□□ 1.25
TPCN1-211ENST00000548465 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
TPCN1-211ENST00000548465 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
TPCN1-211ENST00000548465 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
TPCN1-211ENST00000548465 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.83■■□□□ 1.25
TPCN1-211ENST00000548465 ARHGEF11O15085 1522 aa22.82■■□□□ 1.24
TPCN1-211ENST00000548465 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.82■■□□□ 1.24
TPCN1-211ENST00000548465 TRIM41Q8WV44 630 aa22.8■■□□□ 1.24
TPCN1-211ENST00000548465 GRIN2AQ12879 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
TPCN1-211ENST00000548465 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.78■■□□□ 1.24
TPCN1-211ENST00000548465 KIF27Q86VH2 1401 aa22.74■■□□□ 1.23
TPCN1-211ENST00000548465 CEP170Q5SW79 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
TPCN1-211ENST00000548465 IGF1RP08069 1367 aa22.71■■□□□ 1.23
TPCN1-211ENST00000548465 NUP160Q12769 1436 aa22.69■■□□□ 1.22
TPCN1-211ENST00000548465 ARAP1Q96P48 1450 aa22.66■■□□□ 1.22
TPCN1-211ENST00000548465 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
TPCN1-211ENST00000548465 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.63■■□□□ 1.21
TPCN1-211ENST00000548465 CUL7Q14999 1698 aa22.61■■□□□ 1.21
TPCN1-211ENST00000548465 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.58■■□□□ 1.2
TPCN1-211ENST00000548465 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.55■■□□□ 1.2
TPCN1-211ENST00000548465 SHROOM2Q13796 1616 aa22.54■■□□□ 1.2
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