RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.01■■■■■ 4.48
TCP1-217ENST00000546023 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
TCP1-217ENST00000546023 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.94■■■■■ 4.46
TCP1-217ENST00000546023 JPH4Q96JJ6 628 aa42.91■■■■■ 4.46
TCP1-217ENST00000546023 IQGAP2Q13576 1575 aa42.81■■■■■ 4.44
TCP1-217ENST00000546023 PRXQ9BXM0 1461 aa42.74■■■■■ 4.43
TCP1-217ENST00000546023 EEA1Q15075 1411 aa42.67■■■■■ 4.42
TCP1-217ENST00000546023 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.65■■■■■ 4.42
TCP1-217ENST00000546023 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.58■■■■■ 4.41
TCP1-217ENST00000546023 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.55■■■■■ 4.4
TCP1-217ENST00000546023 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.54■■■■■ 4.4
TCP1-217ENST00000546023 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.52■■■■■ 4.4
TCP1-217ENST00000546023 DISP1Q96F81 1524 aa42.47■■■■■ 4.39
TCP1-217ENST00000546023 KIAA0556O60303 1618 aa42.42■■■■■ 4.38
TCP1-217ENST00000546023 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
TCP1-217ENST00000546023 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.41■■■■■ 4.38
TCP1-217ENST00000546023 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.41■■■■■ 4.38
TCP1-217ENST00000546023 PTPRGP23470 1445 aa42.38■■■■■ 4.38
TCP1-217ENST00000546023 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
TCP1-217ENST00000546023 KIF21BO75037 1637 aa42.31■■■■■ 4.36
TCP1-217ENST00000546023 GOLGA3Q08378 1498 aa42.28■■■■■ 4.36
TCP1-217ENST00000546023 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
TCP1-217ENST00000546023 MAPKBP1O60336 1514 aa42.19■■■■■ 4.34
TCP1-217ENST00000546023 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.34
TCP1-217ENST00000546023 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.13■■■■■ 4.34
TCP1-217ENST00000546023 UACAQ9BZF9 1416 aa42.12■■■■■ 4.33
TCP1-217ENST00000546023 ABCC2Q92887 1545 aa42.12■■■■■ 4.33
TCP1-217ENST00000546023 SAMD9Q5K651 1589 aa42.06■■■■■ 4.32
TCP1-217ENST00000546023 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.04■■■■■ 4.32
TCP1-217ENST00000546023 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.97■■■■■ 4.31
TCP1-217ENST00000546023 DIP2BQ9P265 1576 aa41.97■■■■■ 4.31
TCP1-217ENST00000546023 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.95■■■■■ 4.31
TCP1-217ENST00000546023 ABCA8O94911 1581 aa41.93■■■■■ 4.3
TCP1-217ENST00000546023 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.93■■■■■ 4.3
TCP1-217ENST00000546023 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
TCP1-217ENST00000546023 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.85■■■■■ 4.29
TCP1-217ENST00000546023 P3H3Q8IVL6 736 aa41.84■■■■■ 4.29
TCP1-217ENST00000546023 ASXL2Q76L83 1435 aa41.84■■■■■ 4.29
TCP1-217ENST00000546023 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.82■■■■■ 4.29
TCP1-217ENST00000546023 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
TCP1-217ENST00000546023 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.79■■■■■ 4.28
TCP1-217ENST00000546023 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
TCP1-217ENST00000546023 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.75■■■■■ 4.27
TCP1-217ENST00000546023 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.69■■■■■ 4.27
TCP1-217ENST00000546023 GLI2P10070 1586 aa41.65■■■■■ 4.26
TCP1-217ENST00000546023 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.63■■■■■ 4.25
TCP1-217ENST00000546023 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
TCP1-217ENST00000546023 TSPOAP1O95153 1857 aa41.55■■■■■ 4.24
TCP1-217ENST00000546023 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.53■■■■■ 4.24
TCP1-217ENST00000546023 ATP10BO94823 1461 aa41.51■■■■■ 4.24
TCP1-217ENST00000546023 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
TCP1-217ENST00000546023 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.48■■■■■ 4.23
TCP1-217ENST00000546023 ARID3CA6NKF2 412 aa41.47■■■■■ 4.23
TCP1-217ENST00000546023 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
TCP1-217ENST00000546023 FMN1Q68DA7 1419 aa41.39■■■■■ 4.22
TCP1-217ENST00000546023 KDM6BO15054 1643 aa41.35■■■■■ 4.21
TCP1-217ENST00000546023 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.34■■■■■ 4.21
TCP1-217ENST00000546023 HECW1Q76N89 1606 aa41.31■■■■■ 4.2
TCP1-217ENST00000546023 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.28■■■■■ 4.2
TCP1-217ENST00000546023 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
TCP1-217ENST00000546023 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
TCP1-217ENST00000546023 KCNH8Q96L42 1107 aa41.27■■■■■ 4.2
TCP1-217ENST00000546023 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
TCP1-217ENST00000546023 CLIP1P30622 1438 aa41.2■■■■■ 4.19
TCP1-217ENST00000546023 CD109Q6YHK3 1445 aa41.2■■■■■ 4.19
TCP1-217ENST00000546023 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.19■■■■■ 4.18
TCP1-217ENST00000546023 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.18■■■■■ 4.18
TCP1-217ENST00000546023 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
TCP1-217ENST00000546023 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
TCP1-217ENST00000546023 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.06■■■■■ 4.16
TCP1-217ENST00000546023 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.04■■■■■ 4.16
TCP1-217ENST00000546023 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.03■■■■■ 4.16
TCP1-217ENST00000546023 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.99■■■■■ 4.15
TCP1-217ENST00000546023 CEP162Q5TB80 1403 aa40.99■■■■■ 4.15
TCP1-217ENST00000546023 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
TCP1-217ENST00000546023 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.96■■■■■ 4.15
TCP1-217ENST00000546023 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.95■■■■■ 4.15
TCP1-217ENST00000546023 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.144e-8■■□□□ 12.2
TCP1-217ENST00000546023 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
TCP1-217ENST00000546023 KIF14Q15058 1648 aa40.85■■■■■ 4.13
TCP1-217ENST00000546023 NEO1Q92859 1461 aa40.84■■■■■ 4.13
TCP1-217ENST00000546023 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
TCP1-217ENST00000546023 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.81■■■■■ 4.12
TCP1-217ENST00000546023 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.81■■■■■ 4.12
TCP1-217ENST00000546023 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.79■■■■■ 4.12
TCP1-217ENST00000546023 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.78■■■■■ 4.12
TCP1-217ENST00000546023 FANCAO15360 1455 aa40.73■■■■■ 4.11
TCP1-217ENST00000546023 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.73■■■■■ 4.11
TCP1-217ENST00000546023 PLCH2O75038 1416 aa40.65■■■■■ 4.1
TCP1-217ENST00000546023 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.62■■■■■ 4.09
TCP1-217ENST00000546023 AKNAQ7Z591 1439 aa40.61■■■■■ 4.09
TCP1-217ENST00000546023 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
TCP1-217ENST00000546023 RICTORQ6R327 1708 aa40.53■■■■■ 4.08
TCP1-217ENST00000546023 PREX2Q70Z35 1606 aa40.53■■■■■ 4.08
TCP1-217ENST00000546023 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.52■■■■■ 4.08
TCP1-217ENST00000546023 ADGRL1O94910 1474 aa40.51■■■■■ 4.08
TCP1-217ENST00000546023 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.5■■■■■ 4.07
TCP1-217ENST00000546023 RAPGEF3O95398 923 aa40.5■■■■■ 4.07
TCP1-217ENST00000546023 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.46■■■■■ 4.07
TCP1-217ENST00000546023 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.46■■■■■ 4.07
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