RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.11■■■■■ 7.53
TCP1-217ENST00000546023 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.41■■■■■ 6.46
TCP1-217ENST00000546023 ABCC9O60706 1549 aa54.29■■■■■ 6.28
TCP1-217ENST00000546023 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.2■■■■■ 5.95
TCP1-217ENST00000546023 NACADO15069 1562 aa52.07■■■■■ 5.93
TCP1-217ENST00000546023 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.8■■■■■ 5.88
TCP1-217ENST00000546023 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.75■■■■■ 5.88
TCP1-217ENST00000546023 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.69■■■■■ 5.87
TCP1-217ENST00000546023 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.41■■■■■ 5.82
TCP1-217ENST00000546023 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.03■■■■■ 5.76
TCP1-217ENST00000546023 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.6■■■■■ 5.69
TCP1-217ENST00000546023 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.59■■■■■ 5.69
TCP1-217ENST00000546023 SCRIBQ14160 1630 aa50.51■■■■■ 5.68
TCP1-217ENST00000546023 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.13■■■■■ 5.62
TCP1-217ENST00000546023 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.84■■■■■ 5.57
TCP1-217ENST00000546023 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
TCP1-217ENST00000546023 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.13■■■■■ 5.46
TCP1-217ENST00000546023 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.81■■■■■ 5.4
TCP1-217ENST00000546023 SMARCA4P51532 1647 aa48.29■■■■■ 5.32
TCP1-217ENST00000546023 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.19■■■■■ 5.31
TCP1-217ENST00000546023 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48■■■■■ 5.27
TCP1-217ENST00000546023 SMARCA2P51531 1590 aa48■■■■■ 5.27
TCP1-217ENST00000546023 NCAPD3P42695 1498 aa47.99■■■■■ 5.27
TCP1-217ENST00000546023 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.86■■■■■ 5.25
TCP1-217ENST00000546023 HMGXB3Q12766 1538 aa47.84■■■■■ 5.25
TCP1-217ENST00000546023 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.81■■■■■ 5.24
TCP1-217ENST00000546023 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
TCP1-217ENST00000546023 WIZO95785 1651 aa47.35■■■■■ 5.17
TCP1-217ENST00000546023 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
TCP1-217ENST00000546023 NESP48681 1621 aa46.92■■■■■ 5.1
TCP1-217ENST00000546023 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
TCP1-217ENST00000546023 ERCC6Q03468 1493 aa46.85■■■■■ 5.09
TCP1-217ENST00000546023 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.84■■■■■ 5.09
TCP1-217ENST00000546023 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.56■■■■■ 5.04
TCP1-217ENST00000546023 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.46■■■■■ 5.03
TCP1-217ENST00000546023 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.44■■■■■ 5.02
TCP1-217ENST00000546023 CUX2O14529 1486 aa46.43■■■■■ 5.02
TCP1-217ENST00000546023 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
TCP1-217ENST00000546023 CFTRP13569 1480 aa46.29■■■■■ 5
TCP1-217ENST00000546023 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.24■■■■■ 4.99
TCP1-217ENST00000546023 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.09■■■■■ 4.97
TCP1-217ENST00000546023 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.09■■■■■ 4.97
TCP1-217ENST00000546023 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.06■■■■■ 4.96
TCP1-217ENST00000546023 PRDM2Q13029 1718 aa46.06■■■■■ 4.96
TCP1-217ENST00000546023 WDR62O43379 1518 aa45.93■■■■■ 4.94
TCP1-217ENST00000546023 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
TCP1-217ENST00000546023 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
TCP1-217ENST00000546023 TOPBP1Q92547 1522 aa45.34■■■■■ 4.85
TCP1-217ENST00000546023 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.32■■■■■ 4.85
TCP1-217ENST00000546023 ABCC8Q09428 1581 aa45.29■■■■■ 4.84
TCP1-217ENST00000546023 IFT140Q96RY7 1462 aa45.1■■■■■ 4.81
TCP1-217ENST00000546023 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.06■■■■■ 4.8
TCP1-217ENST00000546023 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
TCP1-217ENST00000546023 CUX1P39880 1505 aa44.93■■■■■ 4.78
TCP1-217ENST00000546023 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
TCP1-217ENST00000546023 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
TCP1-217ENST00000546023 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.76
TCP1-217ENST00000546023 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.81■■■■■ 4.76
TCP1-217ENST00000546023 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.71■■■■■ 4.75
TCP1-217ENST00000546023 SOGA1O94964 1423 aa44.68■■■■■ 4.74
TCP1-217ENST00000546023 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.57■■■■■ 4.736e-9■■■□□ 17.4
TCP1-217ENST00000546023 WDR97A6NE52 1622 aa44.57■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.56■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.54■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 TOP2BQ02880 1626 aa44.52■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 SYNJ1O43426 1573 aa44.5■■■■■ 4.71
TCP1-217ENST00000546023 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
TCP1-217ENST00000546023 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.36■■■■■ 4.69
TCP1-217ENST00000546023 OSCARQ8IYS5 282 aa44.31■■■■■ 4.68
TCP1-217ENST00000546023 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.27■■■■■ 4.68
TCP1-217ENST00000546023 CHD1O14646 1710 aa44.26■■■■■ 4.68
TCP1-217ENST00000546023 GRIN2BQ13224 1484 aa44.25■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.25■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 PBRM1Q86U86 1689 aa44.23■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.21■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
TCP1-217ENST00000546023 FBLN2P98095 1184 aa44.03■■■■■ 4.64
TCP1-217ENST00000546023 SYNJ2O15056 1496 aa44■■■■■ 4.63
TCP1-217ENST00000546023 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
TCP1-217ENST00000546023 ADAMTS12P58397 1594 aa43.88■■■■■ 4.61
TCP1-217ENST00000546023 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
TCP1-217ENST00000546023 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.79■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.79■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.79■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.77■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 ARHGEF11O15085 1522 aa43.76■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 GRIN2AQ12879 1464 aa43.7■■■■■ 4.59
TCP1-217ENST00000546023 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.69■■■■■ 4.58
TCP1-217ENST00000546023 KIF27Q86VH2 1401 aa43.63■■■■■ 4.57
TCP1-217ENST00000546023 TRIM41Q8WV44 630 aa43.55■■■■■ 4.56
TCP1-217ENST00000546023 CEP170Q5SW79 1584 aa43.52■■■■■ 4.56
TCP1-217ENST00000546023 NUP160Q12769 1436 aa43.49■■■■■ 4.55
TCP1-217ENST00000546023 CUL7Q14999 1698 aa43.46■■■■■ 4.55
TCP1-217ENST00000546023 IGF1RP08069 1367 aa43.39■■■■■ 4.54
TCP1-217ENST00000546023 ARAP1Q96P48 1450 aa43.38■■■■■ 4.54
TCP1-217ENST00000546023 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.25■■■■■ 4.51
TCP1-217ENST00000546023 SHROOM2Q13796 1616 aa43.24■■■■■ 4.51
TCP1-217ENST00000546023 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.2■■■■■ 4.51
TCP1-217ENST00000546023 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.15■■■■■ 4.5
TCP1-217ENST00000546023 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.11■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms