RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 JPH4Q96JJ6 628 aa38.05■■■■□ 3.68
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.05■■■■□ 3.68
CCDC189-211ENST00000545825 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
CCDC189-211ENST00000545825 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38■■■■□ 3.67
CCDC189-211ENST00000545825 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.88■■■■□ 3.65
CCDC189-211ENST00000545825 PRXQ9BXM0 1461 aa37.87■■■■□ 3.65
CCDC189-211ENST00000545825 IQGAP2Q13576 1575 aa37.81■■■■□ 3.64
CCDC189-211ENST00000545825 EEA1Q15075 1411 aa37.78■■■■□ 3.64
CCDC189-211ENST00000545825 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.76■■■■□ 3.64
CCDC189-211ENST00000545825 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.63■■■■□ 3.62
CCDC189-211ENST00000545825 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.62■■■■□ 3.61
CCDC189-211ENST00000545825 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.62■■■■□ 3.61
CCDC189-211ENST00000545825 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
CCDC189-211ENST00000545825 DISP1Q96F81 1524 aa37.58■■■■□ 3.61
CCDC189-211ENST00000545825 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.53■■■■□ 3.6
CCDC189-211ENST00000545825 PTPRGP23470 1445 aa37.52■■■■□ 3.6
CCDC189-211ENST00000545825 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA0556O60303 1618 aa37.47■■■■□ 3.59
CCDC189-211ENST00000545825 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.45■■■■□ 3.59
CCDC189-211ENST00000545825 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
CCDC189-211ENST00000545825 KIF21BO75037 1637 aa37.41■■■■□ 3.58
CCDC189-211ENST00000545825 GOLGA3Q08378 1498 aa37.37■■■■□ 3.57
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CCDC189-211ENST00000545825 UACAQ9BZF9 1416 aa37.27■■■■□ 3.56
CCDC189-211ENST00000545825 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.26■■■■□ 3.55
CCDC189-211ENST00000545825 MAPKBP1O60336 1514 aa37.24■■■■□ 3.55
CCDC189-211ENST00000545825 ABCC2Q92887 1545 aa37.21■■■■□ 3.55
CCDC189-211ENST00000545825 SAMD9Q5K651 1589 aa37.18■■■■□ 3.54
CCDC189-211ENST00000545825 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.13■■■■□ 3.53
CCDC189-211ENST00000545825 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.13■■■■□ 3.53
CCDC189-211ENST00000545825 P3H3Q8IVL6 736 aa37.12■■■■□ 3.53
CCDC189-211ENST00000545825 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.08■■■■□ 3.53
CCDC189-211ENST00000545825 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.08■■■■□ 3.53
CCDC189-211ENST00000545825 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.08■■■■□ 3.53
CCDC189-211ENST00000545825 ABCA8O94911 1581 aa37.08■■■■□ 3.53
CCDC189-211ENST00000545825 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
CCDC189-211ENST00000545825 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
CCDC189-211ENST00000545825 DIP2BQ9P265 1576 aa37.02■■■■□ 3.52
CCDC189-211ENST00000545825 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
CCDC189-211ENST00000545825 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.99■■■■□ 3.51
CCDC189-211ENST00000545825 ASXL2Q76L83 1435 aa36.99■■■■□ 3.51
CCDC189-211ENST00000545825 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.97■■■■□ 3.51
CCDC189-211ENST00000545825 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.95■■■■□ 3.51
CCDC189-211ENST00000545825 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.83■■■■□ 3.49
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.79■■■■□ 3.48
CCDC189-211ENST00000545825 GLI2P10070 1586 aa36.78■■■■□ 3.48
CCDC189-211ENST00000545825 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.78■■■■□ 3.48
CCDC189-211ENST00000545825 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
CCDC189-211ENST00000545825 ATP10BO94823 1461 aa36.76■■■■□ 3.48
CCDC189-211ENST00000545825 ARID3CA6NKF2 412 aa36.75■■■■□ 3.47
CCDC189-211ENST00000545825 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
CCDC189-211ENST00000545825 TSPOAP1O95153 1857 aa36.66■■■■□ 3.46
CCDC189-211ENST00000545825 FMN1Q68DA7 1419 aa36.62■■■■□ 3.45
CCDC189-211ENST00000545825 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.62■■■■□ 3.45
CCDC189-211ENST00000545825 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
CCDC189-211ENST00000545825 KCNH8Q96L42 1107 aa36.58■■■■□ 3.45
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CCDC189-211ENST00000545825 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.47■■■■□ 3.43
CCDC189-211ENST00000545825 HECW1Q76N89 1606 aa36.46■■■■□ 3.43
CCDC189-211ENST00000545825 KDM6BO15054 1643 aa36.45■■■■□ 3.42
CCDC189-211ENST00000545825 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CCDC189-211ENST00000545825 CD109Q6YHK3 1445 aa36.44■■■■□ 3.42
CCDC189-211ENST00000545825 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.43■■■■□ 3.42
CCDC189-211ENST00000545825 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CCDC189-211ENST00000545825 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.39■■■■□ 3.42
CCDC189-211ENST00000545825 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.39■■■■□ 3.42
CCDC189-211ENST00000545825 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.38■■■■□ 3.41
CCDC189-211ENST00000545825 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.34■■■■□ 3.41
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CCDC189-211ENST00000545825 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.33■■■■□ 3.41
CCDC189-211ENST00000545825 CEP162Q5TB80 1403 aa36.32■■■■□ 3.4
CCDC189-211ENST00000545825 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.29■■■■□ 3.4
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CCDC189-211ENST00000545825 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.24■■■■□ 3.39
CCDC189-211ENST00000545825 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.21■■■■□ 3.39
CCDC189-211ENST00000545825 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
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CCDC189-211ENST00000545825 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
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CCDC189-211ENST00000545825 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.09■■■■□ 3.37
CCDC189-211ENST00000545825 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.09■■■■□ 3.37
CCDC189-211ENST00000545825 KIF14Q15058 1648 aa36.08■■■■□ 3.37
CCDC189-211ENST00000545825 FANCAO15360 1455 aa36■■■■□ 3.35
CCDC189-211ENST00000545825 PLCH2O75038 1416 aa36■■■■□ 3.35
CCDC189-211ENST00000545825 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.96■■■■□ 3.35
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CCDC189-211ENST00000545825 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.93■■■■□ 3.34
CCDC189-211ENST00000545825 RAPGEF3O95398 923 aa35.89■■■■□ 3.34
CCDC189-211ENST00000545825 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.89■■■■□ 3.34
CCDC189-211ENST00000545825 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.87■■■■□ 3.33
CCDC189-211ENST00000545825 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.83■■■■□ 3.33
CCDC189-211ENST00000545825 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.81■■■■□ 3.32
CCDC189-211ENST00000545825 ADGRL1O94910 1474 aa35.8■■■■□ 3.32
CCDC189-211ENST00000545825 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.8■■■■□ 3.32
CCDC189-211ENST00000545825 RICTORQ6R327 1708 aa35.78■■■■□ 3.32
CCDC189-211ENST00000545825 PREX2Q70Z35 1606 aa35.78■■■■□ 3.32
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