RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 SHROOM2Q13796 1616 aa28.28■■■□□ 2.12
RABGGTA-203ENST00000543002 JPH4Q96JJ6 628 aa28.27■■■□□ 2.12
RABGGTA-203ENST00000543002 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.27■■■□□ 2.12
RABGGTA-203ENST00000543002 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.27■■■□□ 2.12
RABGGTA-203ENST00000543002 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.27■■■□□ 2.12
RABGGTA-203ENST00000543002 KIF21BO75037 1637 aa28.25■■■□□ 2.11
RABGGTA-203ENST00000543002 IQGAP2Q13576 1575 aa28.21■■■□□ 2.11
RABGGTA-203ENST00000543002 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
RABGGTA-203ENST00000543002 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.16■■■□□ 2.1
RABGGTA-203ENST00000543002 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.14■■■□□ 2.1
RABGGTA-203ENST00000543002 GOLGA3Q08378 1498 aa28.11■■■□□ 2.09
RABGGTA-203ENST00000543002 ARAP1Q96P48 1450 aa28.11■■■□□ 2.09
RABGGTA-203ENST00000543002 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.09■■■□□ 2.09
RABGGTA-203ENST00000543002 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.05■■■□□ 2.08
RABGGTA-203ENST00000543002 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.05■■■□□ 2.08
RABGGTA-203ENST00000543002 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.03■■■□□ 2.08
RABGGTA-203ENST00000543002 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RABGGTA-203ENST00000543002 DISP1Q96F81 1524 aa28■■■□□ 2.07
RABGGTA-203ENST00000543002 KIAA0556O60303 1618 aa27.94■■■□□ 2.06
RABGGTA-203ENST00000543002 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.93■■■□□ 2.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PTPRGP23470 1445 aa27.89■■■□□ 2.05
RABGGTA-203ENST00000543002 SAMD9Q5K651 1589 aa27.85■■■□□ 2.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
RABGGTA-203ENST00000543002 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
RABGGTA-203ENST00000543002 P3H3Q8IVL6 736 aa27.8■■■□□ 2.04
RABGGTA-203ENST00000543002 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.78■■■□□ 2.04
RABGGTA-203ENST00000543002 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-203ENST00000543002 UACAQ9BZF9 1416 aa27.71■■■□□ 2.03
RABGGTA-203ENST00000543002 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.7■■■□□ 2.02
RABGGTA-203ENST00000543002 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.7■■■□□ 2.02
RABGGTA-203ENST00000543002 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.69■■■□□ 2.02
RABGGTA-203ENST00000543002 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCC2Q92887 1545 aa27.64■■■□□ 2.02
RABGGTA-203ENST00000543002 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.64■■■□□ 2.02
RABGGTA-203ENST00000543002 CLIP1P30622 1438 aa27.63■■■□□ 2.01
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCA8O94911 1581 aa27.62■■■□□ 2.01
RABGGTA-203ENST00000543002 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
RABGGTA-203ENST00000543002 CEP162Q5TB80 1403 aa27.56■■■□□ 2
RABGGTA-203ENST00000543002 FMN1Q68DA7 1419 aa27.53■■■□□ 2
RABGGTA-203ENST00000543002 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.53■■■□□ 2
RABGGTA-203ENST00000543002 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.52■■■□□ 2
RABGGTA-203ENST00000543002 MAPKBP1O60336 1514 aa27.47■■□□□ 1.99
RABGGTA-203ENST00000543002 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
RABGGTA-203ENST00000543002 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP10BO94823 1461 aa27.41■■□□□ 1.98
RABGGTA-203ENST00000543002 ASXL2Q76L83 1435 aa27.39■■□□□ 1.97
RABGGTA-203ENST00000543002 ARID3CA6NKF2 412 aa27.39■■□□□ 1.97
RABGGTA-203ENST00000543002 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
RABGGTA-203ENST00000543002 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.35■■□□□ 1.97
RABGGTA-203ENST00000543002 HECW1Q76N89 1606 aa27.35■■□□□ 1.97
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.32■■□□□ 1.96
RABGGTA-203ENST00000543002 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
RABGGTA-203ENST00000543002 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
RABGGTA-203ENST00000543002 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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RABGGTA-203ENST00000543002 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.29■■□□□ 1.96
RABGGTA-203ENST00000543002 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RABGGTA-203ENST00000543002 DIP2BQ9P265 1576 aa27.26■■□□□ 1.96
RABGGTA-203ENST00000543002 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
RABGGTA-203ENST00000543002 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.25■■□□□ 1.95
RABGGTA-203ENST00000543002 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.23■■□□□ 1.95
RABGGTA-203ENST00000543002 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.22■■□□□ 1.95
RABGGTA-203ENST00000543002 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-203ENST00000543002 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-203ENST00000543002 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.2■■□□□ 1.94
RABGGTA-203ENST00000543002 GLI2P10070 1586 aa27.19■■□□□ 1.94
RABGGTA-203ENST00000543002 KCNH8Q96L42 1107 aa27.17■■□□□ 1.94
RABGGTA-203ENST00000543002 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
RABGGTA-203ENST00000543002 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
RABGGTA-203ENST00000543002 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.06■■□□□ 1.92
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.03■■□□□ 1.92
RABGGTA-203ENST00000543002 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.03■■□□□ 1.92
RABGGTA-203ENST00000543002 CD109Q6YHK3 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
RABGGTA-203ENST00000543002 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.02■■□□□ 1.92
RABGGTA-203ENST00000543002 TSPOAP1O95153 1857 aa26.99■■□□□ 1.91
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RABGGTA-203ENST00000543002 TIAM1Q13009 1591 aa26.97■■□□□ 1.91
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RABGGTA-203ENST00000543002 KIF14Q15058 1648 aa26.96■■□□□ 1.91
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RABGGTA-203ENST00000543002 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-203ENST00000543002 APLP2Q06481 763 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-203ENST00000543002 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-203ENST00000543002 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-203ENST00000543002 PLCH2O75038 1416 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-203ENST00000543002 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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RABGGTA-203ENST00000543002 NEO1Q92859 1461 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-203ENST00000543002 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-203ENST00000543002 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-203ENST00000543002 FANCAO15360 1455 aa26.78■■□□□ 1.88
RABGGTA-203ENST00000543002 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
RABGGTA-203ENST00000543002 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 NCOA2Q15596 1464 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 KDM6BO15054 1643 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.74■■□□□ 1.87
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