RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.05■■■■■ 4.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.34■■■■□ 3.41
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCC9O60706 1549 aa35.29■■■■□ 3.24
RABGGTA-203ENST00000543002 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
RABGGTA-203ENST00000543002 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.17■■■■□ 3.06
RABGGTA-203ENST00000543002 NACADO15069 1562 aa34.12■■■■□ 3.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.07■■■■□ 3.04
RABGGTA-203ENST00000543002 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.03■■■■□ 3.04
RABGGTA-203ENST00000543002 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.98■■■■□ 3.03
RABGGTA-203ENST00000543002 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.26■■■□□ 2.92
RABGGTA-203ENST00000543002 SCRIBQ14160 1630 aa33.17■■■□□ 2.9
RABGGTA-203ENST00000543002 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.04■■■□□ 2.88
RABGGTA-203ENST00000543002 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.03■■■□□ 2.88
RABGGTA-203ENST00000543002 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.73■■■□□ 2.83
RABGGTA-203ENST00000543002 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.15■■■□□ 2.74
RABGGTA-203ENST00000543002 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
RABGGTA-203ENST00000543002 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.94■■■□□ 2.7
RABGGTA-203ENST00000543002 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.92■■■□□ 2.7
RABGGTA-203ENST00000543002 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
RABGGTA-203ENST00000543002 SMARCA4P51532 1647 aa31.77■■■□□ 2.68
RABGGTA-203ENST00000543002 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.63■■■□□ 2.65
RABGGTA-203ENST00000543002 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.54■■■□□ 2.64
RABGGTA-203ENST00000543002 SMARCA2P51531 1590 aa31.51■■■□□ 2.63
RABGGTA-203ENST00000543002 NCAPD3P42695 1498 aa31.5■■■□□ 2.63
RABGGTA-203ENST00000543002 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.47■■■□□ 2.63
RABGGTA-203ENST00000543002 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
RABGGTA-203ENST00000543002 HMGXB3Q12766 1538 aa31.34■■■□□ 2.61
RABGGTA-203ENST00000543002 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
RABGGTA-203ENST00000543002 WIZO95785 1651 aa31.29■■■□□ 2.6
RABGGTA-203ENST00000543002 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
RABGGTA-203ENST00000543002 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
RABGGTA-203ENST00000543002 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.63■■■□□ 2.49
RABGGTA-203ENST00000543002 NESP48681 1621 aa30.62■■■□□ 2.49
RABGGTA-203ENST00000543002 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.6■■■□□ 2.49
RABGGTA-203ENST00000543002 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.59■■■□□ 2.49
RABGGTA-203ENST00000543002 CFTRP13569 1480 aa30.47■■■□□ 2.47
RABGGTA-203ENST00000543002 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.39■■■□□ 2.46
RABGGTA-203ENST00000543002 ERCC6Q03468 1493 aa30.39■■■□□ 2.45
RABGGTA-203ENST00000543002 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.24■■■□□ 2.43
RABGGTA-203ENST00000543002 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.23■■■□□ 2.43
RABGGTA-203ENST00000543002 PRDM2Q13029 1718 aa30.21■■■□□ 2.43
RABGGTA-203ENST00000543002 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.16■■■□□ 2.42
RABGGTA-203ENST00000543002 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
RABGGTA-203ENST00000543002 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.06■■■□□ 2.4
RABGGTA-203ENST00000543002 CUX2O14529 1486 aa29.98■■■□□ 2.39
RABGGTA-203ENST00000543002 WDR62O43379 1518 aa29.94■■■□□ 2.38
RABGGTA-203ENST00000543002 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCC8Q09428 1581 aa29.8■■■□□ 2.36
RABGGTA-203ENST00000543002 TOPBP1Q92547 1522 aa29.78■■■□□ 2.36
RABGGTA-203ENST00000543002 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.76■■■□□ 2.35
RABGGTA-203ENST00000543002 CUX1P39880 1505 aa29.65■■■□□ 2.34
RABGGTA-203ENST00000543002 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
RABGGTA-203ENST00000543002 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
RABGGTA-203ENST00000543002 IFT140Q96RY7 1462 aa29.52■■■□□ 2.32
RABGGTA-203ENST00000543002 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.51■■■□□ 2.31
RABGGTA-203ENST00000543002 TOP2BQ02880 1626 aa29.48■■■□□ 2.31
RABGGTA-203ENST00000543002 SYNJ1O43426 1573 aa29.47■■■□□ 2.31
RABGGTA-203ENST00000543002 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-203ENST00000543002 SOGA1O94964 1423 aa29.44■■■□□ 2.3
RABGGTA-203ENST00000543002 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-203ENST00000543002 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.24■■■□□ 2.27
RABGGTA-203ENST00000543002 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
RABGGTA-203ENST00000543002 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.272e-7■■■■□ 21.1
RABGGTA-203ENST00000543002 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
RABGGTA-203ENST00000543002 WDR97A6NE52 1622 aa29.23■■■□□ 2.27
RABGGTA-203ENST00000543002 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.1■■■□□ 2.25
RABGGTA-203ENST00000543002 TRIM41Q8WV44 630 aa29.09■■■□□ 2.25
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.08■■■□□ 2.25
RABGGTA-203ENST00000543002 GRIN2BQ13224 1484 aa29.05■■■□□ 2.24
RABGGTA-203ENST00000543002 PBRM1Q86U86 1689 aa28.98■■■□□ 2.23
RABGGTA-203ENST00000543002 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.96■■■□□ 2.23
RABGGTA-203ENST00000543002 KIF27Q86VH2 1401 aa28.95■■■□□ 2.23
RABGGTA-203ENST00000543002 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
RABGGTA-203ENST00000543002 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.94■■■□□ 2.22
RABGGTA-203ENST00000543002 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.9■■■□□ 2.22
RABGGTA-203ENST00000543002 SYNJ2O15056 1496 aa28.83■■■□□ 2.21
RABGGTA-203ENST00000543002 FBLN2P98095 1184 aa28.82■■■□□ 2.2
RABGGTA-203ENST00000543002 OSCARQ8IYS5 282 aa28.81■■■□□ 2.2
RABGGTA-203ENST00000543002 IGF1RP08069 1367 aa28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-203ENST00000543002 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-203ENST00000543002 CHD1O14646 1710 aa28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-203ENST00000543002 ADAMTS12P58397 1594 aa28.79■■■□□ 2.2
RABGGTA-203ENST00000543002 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-203ENST00000543002 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.76■■■□□ 2.19
RABGGTA-203ENST00000543002 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.73■■■□□ 2.19
RABGGTA-203ENST00000543002 GRIN2AQ12879 1464 aa28.68■■■□□ 2.18
RABGGTA-203ENST00000543002 CUL7Q14999 1698 aa28.68■■■□□ 2.18
RABGGTA-203ENST00000543002 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.64■■■□□ 2.18
RABGGTA-203ENST00000543002 EEA1Q15075 1411 aa28.6■■■□□ 2.17
RABGGTA-203ENST00000543002 NUP160Q12769 1436 aa28.55■■■□□ 2.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.53■■■□□ 2.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.52■■■□□ 2.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CEP170Q5SW79 1584 aa28.51■■■□□ 2.15
RABGGTA-203ENST00000543002 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.49■■■□□ 2.15
RABGGTA-203ENST00000543002 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
RABGGTA-203ENST00000543002 PRXQ9BXM0 1461 aa28.47■■■□□ 2.15
RABGGTA-203ENST00000543002 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.35■■■□□ 2.13
RABGGTA-203ENST00000543002 ARHGEF11O15085 1522 aa28.31■■■□□ 2.12
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