RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541013.2

GOLGA3-206, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 498 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-206ENST00000541013 CUL7Q14999 1698 aa26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3-206ENST00000541013 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3-206ENST00000541013 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3-206ENST00000541013 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3-206ENST00000541013 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.69■■□□□ 1.86
GOLGA3-206ENST00000541013 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.58■■□□□ 1.85
GOLGA3-206ENST00000541013 PRXQ9BXM0 1461 aa26.52■■□□□ 1.84
GOLGA3-206ENST00000541013 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.5■■□□□ 1.83
GOLGA3-206ENST00000541013 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
GOLGA3-206ENST00000541013 IQGAP2Q13576 1575 aa26.47■■□□□ 1.83
GOLGA3-206ENST00000541013 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.46■■□□□ 1.83
GOLGA3-206ENST00000541013 PTPRGP23470 1445 aa26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 MAPKBP1O60336 1514 aa26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 EEA1Q15075 1411 aa26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 DISP1Q96F81 1524 aa26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.4■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.39■■□□□ 1.82
GOLGA3-206ENST00000541013 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
GOLGA3-206ENST00000541013 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.38■■□□□ 1.81
GOLGA3-206ENST00000541013 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.31■■□□□ 1.8
GOLGA3-206ENST00000541013 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
GOLGA3-206ENST00000541013 DIP2BQ9P265 1576 aa26.3■■□□□ 1.8
GOLGA3-206ENST00000541013 ABCC2Q92887 1545 aa26.28■■□□□ 1.8
GOLGA3-206ENST00000541013 UACAQ9BZF9 1416 aa26.26■■□□□ 1.79
GOLGA3-206ENST00000541013 KIAA0556O60303 1618 aa26.25■■□□□ 1.79
GOLGA3-206ENST00000541013 KIF21BO75037 1637 aa26.25■■□□□ 1.79
GOLGA3-206ENST00000541013 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
GOLGA3-206ENST00000541013 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.2■■□□□ 1.78
GOLGA3-206ENST00000541013 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.18■■□□□ 1.78
GOLGA3-206ENST00000541013 ASXL2Q76L83 1435 aa26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3-206ENST00000541013 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3-206ENST00000541013 GOLGA3Q08378 1498 aa26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3-206ENST00000541013 GLI2P10070 1586 aa26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3-206ENST00000541013 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GOLGA3-206ENST00000541013 ABCA8O94911 1581 aa26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3-206ENST00000541013 P3H3Q8IVL6 736 aa26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3-206ENST00000541013 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GOLGA3-206ENST00000541013 SAMD9Q5K651 1589 aa26.04■■□□□ 1.76
GOLGA3-206ENST00000541013 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GOLGA3-206ENST00000541013 TSPOAP1O95153 1857 aa26.02■■□□□ 1.76
GOLGA3-206ENST00000541013 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GOLGA3-206ENST00000541013 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GOLGA3-206ENST00000541013 KDM6BO15054 1643 aa25.95■■□□□ 1.74
GOLGA3-206ENST00000541013 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.93■■□□□ 1.74
GOLGA3-206ENST00000541013 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.92■■□□□ 1.74
GOLGA3-206ENST00000541013 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.92■■□□□ 1.74
GOLGA3-206ENST00000541013 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.86■■□□□ 1.73
GOLGA3-206ENST00000541013 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
GOLGA3-206ENST00000541013 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
GOLGA3-206ENST00000541013 ATP10BO94823 1461 aa25.85■■□□□ 1.73
GOLGA3-206ENST00000541013 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.82■■□□□ 1.72
GOLGA3-206ENST00000541013 ARID3CA6NKF2 412 aa25.79■■□□□ 1.72
GOLGA3-206ENST00000541013 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.79■■□□□ 1.72
GOLGA3-206ENST00000541013 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.77■■□□□ 1.72
GOLGA3-206ENST00000541013 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.77■■□□□ 1.72
GOLGA3-206ENST00000541013 KCNH8Q96L42 1107 aa25.76■■□□□ 1.71
GOLGA3-206ENST00000541013 CD109Q6YHK3 1445 aa25.75■■□□□ 1.71
GOLGA3-206ENST00000541013 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.74■■□□□ 1.71
GOLGA3-206ENST00000541013 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3-206ENST00000541013 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3-206ENST00000541013 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3-206ENST00000541013 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3-206ENST00000541013 CLIP1P30622 1438 aa25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3-206ENST00000541013 FMN1Q68DA7 1419 aa25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3-206ENST00000541013 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 CEP162Q5TB80 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 HECW1Q76N89 1606 aa25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3-206ENST00000541013 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3-206ENST00000541013 ADGRL1O94910 1474 aa25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3-206ENST00000541013 NEO1Q92859 1461 aa25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3-206ENST00000541013 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3-206ENST00000541013 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
GOLGA3-206ENST00000541013 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.39■■□□□ 1.65
GOLGA3-206ENST00000541013 RAPGEF3O95398 923 aa25.37■■□□□ 1.65
GOLGA3-206ENST00000541013 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3-206ENST00000541013 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3-206ENST00000541013 AKNAQ7Z591 1439 aa25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3-206ENST00000541013 KIF14Q15058 1648 aa25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3-206ENST00000541013 FANCAO15360 1455 aa25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3-206ENST00000541013 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3-206ENST00000541013 PLCH2O75038 1416 aa25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3-206ENST00000541013 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3-206ENST00000541013 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3-206ENST00000541013 RICTORQ6R327 1708 aa25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3-206ENST00000541013 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3-206ENST00000541013 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3-206ENST00000541013 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3-206ENST00000541013 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3-206ENST00000541013 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3-206ENST00000541013 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.15■■□□□ 1.62
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