RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539594.5

ESRRA-206, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-206ENST00000539594 JPH4Q96JJ6 628 aa47.33■■■■■ 5.17
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ESRRA-206ENST00000539594 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.27■■■■■ 5.16
ESRRA-206ENST00000539594 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
ESRRA-206ENST00000539594 EEA1Q15075 1411 aa47.06■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 PRXQ9BXM0 1461 aa47.05■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 IQGAP2Q13576 1575 aa47.05■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.04■■■■■ 5.12
ESRRA-206ENST00000539594 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.97■■■■■ 5.11
ESRRA-206ENST00000539594 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.88■■■■■ 5.09
ESRRA-206ENST00000539594 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.85■■■■■ 5.09
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ESRRA-206ENST00000539594 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.69■■■■■ 4.91
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ESRRA-206ENST00000539594 CLIP1P30622 1438 aa45.38■■■■■ 4.86
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ESRRA-206ENST00000539594 CD109Q6YHK3 1445 aa45.35■■■■■ 4.85
ESRRA-206ENST00000539594 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.34■■■■■ 4.85
ESRRA-206ENST00000539594 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.3■■■■■ 4.84
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ESRRA-206ENST00000539594 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.26■■■■■ 4.84
ESRRA-206ENST00000539594 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
ESRRA-206ENST00000539594 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.2■■■■■ 4.83
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ESRRA-206ENST00000539594 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
ESRRA-206ENST00000539594 CEP162Q5TB80 1403 aa45.12■■■■■ 4.81
ESRRA-206ENST00000539594 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.1■■■■■ 4.81
ESRRA-206ENST00000539594 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.08■■■■■ 4.81
ESRRA-206ENST00000539594 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.06■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.04■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.03■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
ESRRA-206ENST00000539594 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.81e-6■■■■□ 24.7
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ESRRA-206ENST00000539594 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.91■■■■■ 4.78
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ESRRA-206ENST00000539594 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.83■■■■■ 4.77
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ESRRA-206ENST00000539594 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.56■■■■■ 4.72
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.55■■■■■ 4.72
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ESRRA-206ENST00000539594 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.53■■■■■ 4.72
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