RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538410.5

COPS7A-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, human

TSL 3 BASIC

Gene COPS7A, Length 1,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7A-208	ENST00000538410	NUP160	Q12769	1436 aa		33.51	■■■□□ 2.95
COPS7A-208	ENST00000538410	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.5	■■■□□ 2.95
COPS7A-208	ENST00000538410	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.5	■■■□□ 2.95
COPS7A-208	ENST00000538410	CUL7	Q14999	1698 aa		33.49	■■■□□ 2.95
COPS7A-208	ENST00000538410	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.44	■■■□□ 2.94
COPS7A-208	ENST00000538410	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.44	■■■□□ 2.94
COPS7A-208	ENST00000538410	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.41	■■■□□ 2.94
COPS7A-208	ENST00000538410	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.4	■■■□□ 2.94
COPS7A-208	ENST00000538410	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.32	■■■□□ 2.92
COPS7A-208	ENST00000538410	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.29	■■■□□ 2.92
COPS7A-208	ENST00000538410	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
COPS7A-208	ENST00000538410	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.23	■■■□□ 2.91
COPS7A-208	ENST00000538410	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.2	■■■□□ 2.91
COPS7A-208	ENST00000538410	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
COPS7A-208	ENST00000538410	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
COPS7A-208	ENST00000538410	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.11	■■■□□ 2.89
COPS7A-208	ENST00000538410	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.09	■■■□□ 2.89
COPS7A-208	ENST00000538410	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33	■■■□□ 2.87
COPS7A-208	ENST00000538410	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.87	■■■□□ 2.85
COPS7A-208	ENST00000538410	CLIP1	P30622	1438 aa		32.86	■■■□□ 2.85
COPS7A-208	ENST00000538410	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
COPS7A-208	ENST00000538410	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.78	■■■□□ 2.84
COPS7A-208	ENST00000538410	PTPRG	P23470	1445 aa		32.72	■■■□□ 2.83
COPS7A-208	ENST00000538410	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.72	■■■□□ 2.83
COPS7A-208	ENST00000538410	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.71	■■■□□ 2.83
COPS7A-208	ENST00000538410	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.71	■■■□□ 2.83
COPS7A-208	ENST00000538410	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.69	■■■□□ 2.82
COPS7A-208	ENST00000538410	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
COPS7A-208	ENST00000538410	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.67	■■■□□ 2.82
COPS7A-208	ENST00000538410	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.66	■■■□□ 2.82
COPS7A-208	ENST00000538410	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.66	■■■□□ 2.82
COPS7A-208	ENST00000538410	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.58	■■■□□ 2.81
COPS7A-208	ENST00000538410	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.58	■■■□□ 2.81
COPS7A-208	ENST00000538410	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.56	■■■□□ 2.8
COPS7A-208	ENST00000538410	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.52	■■■□□ 2.8
COPS7A-208	ENST00000538410	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.49	■■■□□ 2.79
COPS7A-208	ENST00000538410	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.49	■■■□□ 2.79
COPS7A-208	ENST00000538410	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.48	■■■□□ 2.79
COPS7A-208	ENST00000538410	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.48	■■■□□ 2.79
COPS7A-208	ENST00000538410	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.47	■■■□□ 2.79
COPS7A-208	ENST00000538410	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.46	■■■□□ 2.79
COPS7A-208	ENST00000538410	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.46	■■■□□ 2.79
COPS7A-208	ENST00000538410	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.43	■■■□□ 2.78
COPS7A-208	ENST00000538410	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.35	■■■□□ 2.77
COPS7A-208	ENST00000538410	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.31	■■■□□ 2.76
COPS7A-208	ENST00000538410	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.31	■■■□□ 2.76
COPS7A-208	ENST00000538410	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.3	■■■□□ 2.76
COPS7A-208	ENST00000538410	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
COPS7A-208	ENST00000538410	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
COPS7A-208	ENST00000538410	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.24	■■■□□ 2.75
COPS7A-208	ENST00000538410	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.23	■■■□□ 2.75
COPS7A-208	ENST00000538410	ABCA8	O94911	1581 aa		32.23	■■■□□ 2.75
COPS7A-208	ENST00000538410	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.22	■■■□□ 2.75
COPS7A-208	ENST00000538410	GLI2	P10070	1586 aa		32.17	■■■□□ 2.74
COPS7A-208	ENST00000538410	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.13	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	APLP2	Q06481	763 aa		32.13	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.12	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.12	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.1	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.08	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
COPS7A-208	ENST00000538410	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.07	■■■□□ 2.72
COPS7A-208	ENST00000538410	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.07	■■■□□ 2.72
COPS7A-208	ENST00000538410	KDM6B	O15054	1643 aa		32.04	■■■□□ 2.72
COPS7A-208	ENST00000538410	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
COPS7A-208	ENST00000538410	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.02	■■■□□ 2.72
COPS7A-208	ENST00000538410	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
COPS7A-208	ENST00000538410	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.98	■■■□□ 2.71
COPS7A-208	ENST00000538410	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
COPS7A-208	ENST00000538410	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.98	■■■□□ 2.71
COPS7A-208	ENST00000538410	ATP10B	O94823	1461 aa		31.96	■■■□□ 2.71
COPS7A-208	ENST00000538410	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.96	■■■□□ 2.71
COPS7A-208	ENST00000538410	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.9	■■■□□ 2.7
COPS7A-208	ENST00000538410	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
COPS7A-208	ENST00000538410	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
COPS7A-208	ENST00000538410	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.89	■■■□□ 2.7
COPS7A-208	ENST00000538410	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
COPS7A-208	ENST00000538410	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
COPS7A-208	ENST00000538410	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.84	■■■□□ 2.69
COPS7A-208	ENST00000538410	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
COPS7A-208	ENST00000538410	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.78	■■■□□ 2.68
COPS7A-208	ENST00000538410	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.77	■■■□□ 2.68
COPS7A-208	ENST00000538410	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.76	■■■□□ 2.67
COPS7A-208	ENST00000538410	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
COPS7A-208	ENST00000538410	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.71	■■■□□ 2.67
COPS7A-208	ENST00000538410	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
COPS7A-208	ENST00000538410	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.66
COPS7A-208	ENST00000538410	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.69	■■■□□ 2.66
COPS7A-208	ENST00000538410	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
COPS7A-208	ENST00000538410	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
COPS7A-208	ENST00000538410	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.59	■■■□□ 2.65
COPS7A-208	ENST00000538410	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.54	■■■□□ 2.64
COPS7A-208	ENST00000538410	KIF14	Q15058	1648 aa		31.53	■■■□□ 2.64
COPS7A-208	ENST00000538410	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.52	■■■□□ 2.64
COPS7A-208	ENST00000538410	NEO1	Q92859	1461 aa		31.49	■■■□□ 2.63
COPS7A-208	ENST00000538410	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.49	■■■□□ 2.63
COPS7A-208	ENST00000538410	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.48	■■■□□ 2.63
COPS7A-208	ENST00000538410	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.47	■■■□□ 2.63
COPS7A-208	ENST00000538410	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63

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