RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535601.5

HTATSF1-204, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 3,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-204ENST00000535601 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.83■■■□□ 2.05
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HTATSF1-204ENST00000535601 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.72■■■□□ 2.03
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HTATSF1-204ENST00000535601 WDR62O43379 1518 aa27.66■■■□□ 2.02
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HTATSF1-204ENST00000535601 TIAM1Q13009 1591 aa27.56■■■□□ 2
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HTATSF1-204ENST00000535601 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.53■■■□□ 2
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HTATSF1-204ENST00000535601 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1-204ENST00000535601 CEP170Q5SW79 1584 aa27.17■■□□□ 1.94
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HTATSF1-204ENST00000535601 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.17■■□□□ 1.94
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HTATSF1-204ENST00000535601 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1-204ENST00000535601 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1-204ENST00000535601 SYNJ2O15056 1496 aa27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1-204ENST00000535601 DISP1Q96F81 1524 aa27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1-204ENST00000535601 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1-204ENST00000535601 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.1■■□□□ 1.93
HTATSF1-204ENST00000535601 KIAA0556O60303 1618 aa27.09■■□□□ 1.93
HTATSF1-204ENST00000535601 NCOA2Q15596 1464 aa27.08■■□□□ 1.93
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HTATSF1-204ENST00000535601 HECW1Q76N89 1606 aa27.03■■□□□ 1.92
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HTATSF1-204ENST00000535601 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.96■■□□□ 1.91
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HTATSF1-204ENST00000535601 NUP160Q12769 1436 aa26.95■■□□□ 1.9
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HTATSF1-204ENST00000535601 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.94■■□□□ 1.9
HTATSF1-204ENST00000535601 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
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HTATSF1-204ENST00000535601 CHD1O14646 1710 aa26.88■■□□□ 1.89
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HTATSF1-204ENST00000535601 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.85■■□□□ 1.89
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HTATSF1-204ENST00000535601 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-204ENST00000535601 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-204ENST00000535601 NEUROD1Q13562 356 aa26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-204ENST00000535601 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-204ENST00000535601 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-204ENST00000535601 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-204ENST00000535601 ARHGEF11O15085 1522 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-204ENST00000535601 MAPKBP1O60336 1514 aa26.81■■□□□ 1.88
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HTATSF1-204ENST00000535601 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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HTATSF1-204ENST00000535601 KIF14Q15058 1648 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-204ENST00000535601 NAIPQ13075 1403 aa26.67■■□□□ 1.86
HTATSF1-204ENST00000535601 PTPRGP23470 1445 aa26.65■■□□□ 1.86
HTATSF1-204ENST00000535601 HFM1A2PYH4 1435 aa26.64■■□□□ 1.86
HTATSF1-204ENST00000535601 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1-204ENST00000535601 KDM6BO15054 1643 aa26.62■■□□□ 1.85
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HTATSF1-204ENST00000535601 ATP10BO94823 1461 aa26.61■■□□□ 1.85
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HTATSF1-204ENST00000535601 ABCA8O94911 1581 aa26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1-204ENST00000535601 TRIM52Q96A61 297 aa26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1-204ENST00000535601 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-204ENST00000535601 MIA2Q96PC5 1412 aa26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1-204ENST00000535601 FOXD1Q16676 465 aa26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-204ENST00000535601 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-204ENST00000535601 DAPK1P53355 1430 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-204ENST00000535601 ABCC5O15440 1437 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-204ENST00000535601 UACAQ9BZF9 1416 aa26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1-204ENST00000535601 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1-204ENST00000535601 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.48■■□□□ 1.83
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