RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534240.5

ACAD8-216, Transcript of acyl-CoA dehydrogenase family member 8, human

TSL 4

Gene ACAD8, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACAD8-216	ENST00000534240	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.21	■■■■□ 3.07
ACAD8-216	ENST00000534240	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.18	■■■■□ 3.06
ACAD8-216	ENST00000534240	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		34.18	■■■■□ 3.06
ACAD8-216	ENST00000534240	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	34.15	■■■■□ 3.06
ACAD8-216	ENST00000534240	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.14	■■■■□ 3.06
ACAD8-216	ENST00000534240	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.98	■■■■□ 3.03
ACAD8-216	ENST00000534240	EEA1	Q15075	1411 aa		33.95	■■■■□ 3.02
ACAD8-216	ENST00000534240	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.95	■■■■□ 3.02
ACAD8-216	ENST00000534240	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.91	■■■■□ 3.02
ACAD8-216	ENST00000534240	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.85	■■■■□ 3.01
ACAD8-216	ENST00000534240	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.81	■■■■□ 3
ACAD8-216	ENST00000534240	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.8	■■■■□ 3
ACAD8-216	ENST00000534240	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.78	■■■■□ 3
ACAD8-216	ENST00000534240	PTPRG	P23470	1445 aa		33.77	■■■■□ 3
ACAD8-216	ENST00000534240	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ACAD8-216	ENST00000534240	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ACAD8-216	ENST00000534240	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.67	■■■□□ 2.98
ACAD8-216	ENST00000534240	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ACAD8-216	ENST00000534240	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ACAD8-216	ENST00000534240	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ACAD8-216	ENST00000534240	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
ACAD8-216	ENST00000534240	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
ACAD8-216	ENST00000534240	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ACAD8-216	ENST00000534240	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ACAD8-216	ENST00000534240	KIF21B	O75037	1637 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ACAD8-216	ENST00000534240	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ACAD8-216	ENST00000534240	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ACAD8-216	ENST00000534240	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ACAD8-216	ENST00000534240	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ACAD8-216	ENST00000534240	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ACAD8-216	ENST00000534240	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ACAD8-216	ENST00000534240	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ACAD8-216	ENST00000534240	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ACAD8-216	ENST00000534240	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ACAD8-216	ENST00000534240	ABCA8	O94911	1581 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ACAD8-216	ENST00000534240	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ACAD8-216	ENST00000534240	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
ACAD8-216	ENST00000534240	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ACAD8-216	ENST00000534240	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
ACAD8-216	ENST00000534240	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ACAD8-216	ENST00000534240	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
ACAD8-216	ENST00000534240	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
ACAD8-216	ENST00000534240	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ACAD8-216	ENST00000534240	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ACAD8-216	ENST00000534240	GLI2	P10070	1586 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ACAD8-216	ENST00000534240	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ACAD8-216	ENST00000534240	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
ACAD8-216	ENST00000534240	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ACAD8-216	ENST00000534240	ATP10B	O94823	1461 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ACAD8-216	ENST00000534240	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
ACAD8-216	ENST00000534240	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ACAD8-216	ENST00000534240	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ACAD8-216	ENST00000534240	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ACAD8-216	ENST00000534240	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ACAD8-216	ENST00000534240	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ACAD8-216	ENST00000534240	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.9	■■■□□ 2.86
ACAD8-216	ENST00000534240	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
ACAD8-216	ENST00000534240	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
ACAD8-216	ENST00000534240	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ACAD8-216	ENST00000534240	KDM6B	O15054	1643 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACAD8-216	ENST00000534240	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
ACAD8-216	ENST00000534240	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ACAD8-216	ENST00000534240	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ACAD8-216	ENST00000534240	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ACAD8-216	ENST00000534240	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ACAD8-216	ENST00000534240	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ACAD8-216	ENST00000534240	CLIP1	P30622	1438 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ACAD8-216	ENST00000534240	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ACAD8-216	ENST00000534240	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
ACAD8-216	ENST00000534240	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
ACAD8-216	ENST00000534240	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
ACAD8-216	ENST00000534240	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ACAD8-216	ENST00000534240	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ACAD8-216	ENST00000534240	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
ACAD8-216	ENST00000534240	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
ACAD8-216	ENST00000534240	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ACAD8-216	ENST00000534240	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ACAD8-216	ENST00000534240	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ACAD8-216	ENST00000534240	NEO1	Q92859	1461 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ACAD8-216	ENST00000534240	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ACAD8-216	ENST00000534240	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.5	■■■□□ 2.79
ACAD8-216	ENST00000534240	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.49	■■■□□ 2.79
ACAD8-216	ENST00000534240	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ACAD8-216	ENST00000534240	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.45	■■■□□ 2.78
ACAD8-216	ENST00000534240	KIF14	Q15058	1648 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ACAD8-216	ENST00000534240	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ACAD8-216	ENST00000534240	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ACAD8-216	ENST00000534240	FANCA	O15360	1455 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ACAD8-216	ENST00000534240	PLCH2	O75038	1416 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ACAD8-216	ENST00000534240	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ACAD8-216	ENST00000534240	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ACAD8-216	ENST00000534240	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
ACAD8-216	ENST00000534240	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ACAD8-216	ENST00000534240	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ACAD8-216	ENST00000534240	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ACAD8-216	ENST00000534240	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ACAD8-216	ENST00000534240	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ACAD8-216	ENST00000534240	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.2	■■■□□ 2.74
ACAD8-216	ENST00000534240	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ACAD8-216	ENST00000534240	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.16	■■■□□ 2.74

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