RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527527.1

PITPNM1-210, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, humanhuman

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 459 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1-210ENST00000527527 JPH4Q96JJ6 628 aa39.84■■■■□ 3.97
PITPNM1-210ENST00000527527 CUL7Q14999 1698 aa39.81■■■■□ 3.96
PITPNM1-210ENST00000527527 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.66■■■■□ 3.94
PITPNM1-210ENST00000527527 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.65■■■■□ 3.94
PITPNM1-210ENST00000527527 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.37■■■■□ 3.89
PITPNM1-210ENST00000527527 IQGAP2Q13576 1575 aa39.34■■■■□ 3.89
PITPNM1-210ENST00000527527 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.31■■■■□ 3.88
PITPNM1-210ENST00000527527 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.3■■■■□ 3.88
PITPNM1-210ENST00000527527 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
PITPNM1-210ENST00000527527 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.88
PITPNM1-210ENST00000527527 PTPRGP23470 1445 aa39.25■■■■□ 3.87
PITPNM1-210ENST00000527527 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.23■■■■□ 3.87
PITPNM1-210ENST00000527527 MAPKBP1O60336 1514 aa39.22■■■■□ 3.87
PITPNM1-210ENST00000527527 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.21■■■■□ 3.87
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.17■■■■□ 3.86
PITPNM1-210ENST00000527527 DISP1Q96F81 1524 aa39.16■■■■□ 3.86
PITPNM1-210ENST00000527527 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.13■■■■□ 3.85
PITPNM1-210ENST00000527527 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.1■■■■□ 3.85
PITPNM1-210ENST00000527527 DIP2BQ9P265 1576 aa39.1■■■■□ 3.85
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCC2Q92887 1545 aa39.01■■■■□ 3.84
PITPNM1-210ENST00000527527 PRXQ9BXM0 1461 aa39.01■■■■□ 3.84
PITPNM1-210ENST00000527527 KIAA0556O60303 1618 aa39■■■■□ 3.83
PITPNM1-210ENST00000527527 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39■■■■□ 3.83
PITPNM1-210ENST00000527527 UACAQ9BZF9 1416 aa38.97■■■■□ 3.83
PITPNM1-210ENST00000527527 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.95■■■■□ 3.83
PITPNM1-210ENST00000527527 ASXL2Q76L83 1435 aa38.87■■■■□ 3.81
PITPNM1-210ENST00000527527 TSPOAP1O95153 1857 aa38.83■■■■□ 3.81
PITPNM1-210ENST00000527527 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.79■■■■□ 3.8
PITPNM1-210ENST00000527527 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.79■■■■□ 3.8
PITPNM1-210ENST00000527527 GOLGA3Q08378 1498 aa38.77■■■■□ 3.8
PITPNM1-210ENST00000527527 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.76■■■■□ 3.8
PITPNM1-210ENST00000527527 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
PITPNM1-210ENST00000527527 GLI2P10070 1586 aa38.69■■■■□ 3.78
PITPNM1-210ENST00000527527 KDM6BO15054 1643 aa38.67■■■■□ 3.78
PITPNM1-210ENST00000527527 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCA8O94911 1581 aa38.63■■■■□ 3.77
PITPNM1-210ENST00000527527 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
PITPNM1-210ENST00000527527 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
PITPNM1-210ENST00000527527 EEA1Q15075 1411 aa38.61■■■■□ 3.77
PITPNM1-210ENST00000527527 P3H3Q8IVL6 736 aa38.56■■■■□ 3.76
PITPNM1-210ENST00000527527 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
PITPNM1-210ENST00000527527 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.53■■■■□ 3.76
PITPNM1-210ENST00000527527 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.52■■■■□ 3.76
PITPNM1-210ENST00000527527 SAMD9Q5K651 1589 aa38.47■■■■□ 3.75
PITPNM1-210ENST00000527527 ARID3CA6NKF2 412 aa38.39■■■■□ 3.74
PITPNM1-210ENST00000527527 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
PITPNM1-210ENST00000527527 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
PITPNM1-210ENST00000527527 KCNH8Q96L42 1107 aa38.34■■■■□ 3.73
PITPNM1-210ENST00000527527 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.34■■■■□ 3.73
PITPNM1-210ENST00000527527 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.33■■■■□ 3.73
PITPNM1-210ENST00000527527 KIF21BO75037 1637 aa38.33■■■■□ 3.73
PITPNM1-210ENST00000527527 ATP10BO94823 1461 aa38.31■■■■□ 3.72
PITPNM1-210ENST00000527527 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.26■■■■□ 3.72
PITPNM1-210ENST00000527527 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.26■■■■□ 3.71
PITPNM1-210ENST00000527527 CD109Q6YHK3 1445 aa38.25■■■■□ 3.71
PITPNM1-210ENST00000527527 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.24■■■■□ 3.71
PITPNM1-210ENST00000527527 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.19■■■■□ 3.7
PITPNM1-210ENST00000527527 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.19■■■■□ 3.7
PITPNM1-210ENST00000527527 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.18■■■■□ 3.7
PITPNM1-210ENST00000527527 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
PITPNM1-210ENST00000527527 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.1■■■■□ 3.69
PITPNM1-210ENST00000527527 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
PITPNM1-210ENST00000527527 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
PITPNM1-210ENST00000527527 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.03■■■■□ 3.68
PITPNM1-210ENST00000527527 ADGRL1O94910 1474 aa37.95■■■■□ 3.67
PITPNM1-210ENST00000527527 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.88■■■■□ 3.65
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.87■■■■□ 3.65
PITPNM1-210ENST00000527527 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.85■■■■□ 3.65
PITPNM1-210ENST00000527527 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
PITPNM1-210ENST00000527527 NEO1Q92859 1461 aa37.77■■■■□ 3.64
PITPNM1-210ENST00000527527 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.77■■■■□ 3.64
PITPNM1-210ENST00000527527 FMN1Q68DA7 1419 aa37.75■■■■□ 3.63
PITPNM1-210ENST00000527527 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.73■■■■□ 3.63
PITPNM1-210ENST00000527527 RAPGEF3O95398 923 aa37.72■■■■□ 3.63
PITPNM1-210ENST00000527527 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
PITPNM1-210ENST00000527527 HECW1Q76N89 1606 aa37.7■■■■□ 3.63
PITPNM1-210ENST00000527527 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.7■■■■□ 3.63
PITPNM1-210ENST00000527527 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.67■■■■□ 3.62
PITPNM1-210ENST00000527527 FANCAO15360 1455 aa37.6■■■■□ 3.61
PITPNM1-210ENST00000527527 AKNAQ7Z591 1439 aa37.58■■■■□ 3.61
PITPNM1-210ENST00000527527 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.55■■■■□ 3.6
PITPNM1-210ENST00000527527 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.53■■■■□ 3.6
PITPNM1-210ENST00000527527 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
PITPNM1-210ENST00000527527 RICTORQ6R327 1708 aa37.51■■■■□ 3.6
PITPNM1-210ENST00000527527 KIF14Q15058 1648 aa37.47■■■■□ 3.59
PITPNM1-210ENST00000527527 PLCH2O75038 1416 aa37.47■■■■□ 3.59
PITPNM1-210ENST00000527527 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
PITPNM1-210ENST00000527527 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
PITPNM1-210ENST00000527527 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.41■■■■□ 3.58
PITPNM1-210ENST00000527527 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.4■■■■□ 3.58
PITPNM1-210ENST00000527527 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.39■■■■□ 3.58
PITPNM1-210ENST00000527527 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.36■■■■□ 3.57
PITPNM1-210ENST00000527527 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.36■■■■□ 3.57
PITPNM1-210ENST00000527527 CLIP1P30622 1438 aa37.36■■■■□ 3.57
PITPNM1-210ENST00000527527 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.36■■■■□ 3.57
PITPNM1-210ENST00000527527 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
PITPNM1-210ENST00000527527 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.34■■■■□ 3.57
PITPNM1-210ENST00000527527 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.32■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms