RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527527.1

PITPNM1-210, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, humanhuman

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 459 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1-210ENST00000527527 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.1■■■■■ 6.73
PITPNM1-210ENST00000527527 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.05■■■■■ 5.76
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCC9O60706 1549 aa50.82■■■■■ 5.73
PITPNM1-210ENST00000527527 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.43■■■■■ 5.34
PITPNM1-210ENST00000527527 NACADO15069 1562 aa48.17■■■■■ 5.3
PITPNM1-210ENST00000527527 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.07■■■■■ 5.29
PITPNM1-210ENST00000527527 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.61■■■■■ 5.21
PITPNM1-210ENST00000527527 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
PITPNM1-210ENST00000527527 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.4■■■■■ 5.18
PITPNM1-210ENST00000527527 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.38■■■■■ 5.18
PITPNM1-210ENST00000527527 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.37■■■■■ 5.17
PITPNM1-210ENST00000527527 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.14■■■■■ 5.14
PITPNM1-210ENST00000527527 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.08■■■■■ 5.13
PITPNM1-210ENST00000527527 SCRIBQ14160 1630 aa46.63■■■■■ 5.06
PITPNM1-210ENST00000527527 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.37■■■■■ 5.01
PITPNM1-210ENST00000527527 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.89■■■■■ 4.94
PITPNM1-210ENST00000527527 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.93
PITPNM1-210ENST00000527527 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.7■■■■■ 4.91
PITPNM1-210ENST00000527527 NCAPD3P42695 1498 aa44.49■■■■■ 4.71
PITPNM1-210ENST00000527527 SMARCA4P51532 1647 aa44.48■■■■■ 4.71
PITPNM1-210ENST00000527527 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.43■■■■■ 4.7
PITPNM1-210ENST00000527527 SMARCA2P51531 1590 aa44.3■■■■■ 4.68
PITPNM1-210ENST00000527527 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
PITPNM1-210ENST00000527527 HMGXB3Q12766 1538 aa44.19■■■■■ 4.67
PITPNM1-210ENST00000527527 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
PITPNM1-210ENST00000527527 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
PITPNM1-210ENST00000527527 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.01■■■■■ 4.64
PITPNM1-210ENST00000527527 ERCC6Q03468 1493 aa43.81■■■■■ 4.6
PITPNM1-210ENST00000527527 NESP48681 1621 aa43.77■■■■■ 4.6
PITPNM1-210ENST00000527527 CUX2O14529 1486 aa43.57■■■■■ 4.57
PITPNM1-210ENST00000527527 WIZO95785 1651 aa43.53■■■■■ 4.56
PITPNM1-210ENST00000527527 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.43■■■■■ 4.54
PITPNM1-210ENST00000527527 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
PITPNM1-210ENST00000527527 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
PITPNM1-210ENST00000527527 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
PITPNM1-210ENST00000527527 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.17■■■■■ 4.5
PITPNM1-210ENST00000527527 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.16■■■■■ 4.5
PITPNM1-210ENST00000527527 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.15■■■■■ 4.5
PITPNM1-210ENST00000527527 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
PITPNM1-210ENST00000527527 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.81■■■■■ 4.44
PITPNM1-210ENST00000527527 CFTRP13569 1480 aa42.75■■■■■ 4.43
PITPNM1-210ENST00000527527 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.7■■■■■ 4.43
PITPNM1-210ENST00000527527 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.69■■■■■ 4.42
PITPNM1-210ENST00000527527 WDR62O43379 1518 aa42.69■■■■■ 4.42
PITPNM1-210ENST00000527527 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.49■■■■■ 4.39
PITPNM1-210ENST00000527527 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
PITPNM1-210ENST00000527527 PRDM2Q13029 1718 aa42.34■■■■■ 4.37
PITPNM1-210ENST00000527527 TOPBP1Q92547 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
PITPNM1-210ENST00000527527 IFT140Q96RY7 1462 aa41.82■■■■■ 4.29
PITPNM1-210ENST00000527527 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
PITPNM1-210ENST00000527527 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCC8Q09428 1581 aa41.78■■■■■ 4.28
PITPNM1-210ENST00000527527 OSCARQ8IYS5 282 aa41.64■■■■■ 4.26
PITPNM1-210ENST00000527527 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
PITPNM1-210ENST00000527527 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
PITPNM1-210ENST00000527527 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
PITPNM1-210ENST00000527527 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
PITPNM1-210ENST00000527527 TRIM41Q8WV44 630 aa41.49■■■■■ 4.23
PITPNM1-210ENST00000527527 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.221e-9■■□□□ 11.8
PITPNM1-210ENST00000527527 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.41■■■■■ 4.22
PITPNM1-210ENST00000527527 CUX1P39880 1505 aa41.36■■■■■ 4.21
PITPNM1-210ENST00000527527 SOGA1O94964 1423 aa41.33■■■■■ 4.21
PITPNM1-210ENST00000527527 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.33■■■■■ 4.21
PITPNM1-210ENST00000527527 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
PITPNM1-210ENST00000527527 CHD1O14646 1710 aa41.18■■■■■ 4.18
PITPNM1-210ENST00000527527 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.12■■■■■ 4.17
PITPNM1-210ENST00000527527 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.12■■■■■ 4.17
PITPNM1-210ENST00000527527 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.12■■■■■ 4.17
PITPNM1-210ENST00000527527 FBLN2P98095 1184 aa41.08■■■■■ 4.17
PITPNM1-210ENST00000527527 WDR97A6NE52 1622 aa41.06■■■■■ 4.16
PITPNM1-210ENST00000527527 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.02■■■■■ 4.16
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGEF11O15085 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
PITPNM1-210ENST00000527527 GRIN2BQ13224 1484 aa40.92■■■■■ 4.14
PITPNM1-210ENST00000527527 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.85■■■■■ 4.13
PITPNM1-210ENST00000527527 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
PITPNM1-210ENST00000527527 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
PITPNM1-210ENST00000527527 PBRM1Q86U86 1689 aa40.81■■■■■ 4.12
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.78■■■■■ 4.12
PITPNM1-210ENST00000527527 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
PITPNM1-210ENST00000527527 SYNJ1O43426 1573 aa40.76■■■■■ 4.12
PITPNM1-210ENST00000527527 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.75■■■■■ 4.11
PITPNM1-210ENST00000527527 SYNJ2O15056 1496 aa40.75■■■■■ 4.11
PITPNM1-210ENST00000527527 TOP2BQ02880 1626 aa40.75■■■■■ 4.11
PITPNM1-210ENST00000527527 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.71■■■■■ 4.11
PITPNM1-210ENST00000527527 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.69■■■■■ 4.1
PITPNM1-210ENST00000527527 ARAP1Q96P48 1450 aa40.67■■■■■ 4.1
PITPNM1-210ENST00000527527 ADAMTS12P58397 1594 aa40.45■■■■■ 4.07
PITPNM1-210ENST00000527527 GRIN2AQ12879 1464 aa40.42■■■■■ 4.06
PITPNM1-210ENST00000527527 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.33■■■■■ 4.05
PITPNM1-210ENST00000527527 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.32■■■■■ 4.05
PITPNM1-210ENST00000527527 CEP170Q5SW79 1584 aa40.29■■■■■ 4.04
PITPNM1-210ENST00000527527 NUP160Q12769 1436 aa40.26■■■■■ 4.04
PITPNM1-210ENST00000527527 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.16■■■■■ 4.02
PITPNM1-210ENST00000527527 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
PITPNM1-210ENST00000527527 SHROOM2Q13796 1616 aa40.05■■■■■ 4
PITPNM1-210ENST00000527527 KIF27Q86VH2 1401 aa39.95■■■■□ 3.99
PITPNM1-210ENST00000527527 IGF1RP08069 1367 aa39.91■■■■□ 3.98
PITPNM1-210ENST00000527527 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.88■■■■□ 3.97
PITPNM1-210ENST00000527527 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
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