RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RBBP4-218ENST00000527118 JPH4Q96JJ6 628 aa26.97■■□□□ 1.91
RBBP4-218ENST00000527118 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.89■■□□□ 1.9
RBBP4-218ENST00000527118 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.89■■□□□ 1.89
RBBP4-218ENST00000527118 IQGAP2Q13576 1575 aa26.72■■□□□ 1.87
RBBP4-218ENST00000527118 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.7■■□□□ 1.86
RBBP4-218ENST00000527118 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.69■■□□□ 1.86
RBBP4-218ENST00000527118 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.69■■□□□ 1.86
RBBP4-218ENST00000527118 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
RBBP4-218ENST00000527118 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.61■■□□□ 1.85
RBBP4-218ENST00000527118 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
RBBP4-218ENST00000527118 PTPRGP23470 1445 aa26.58■■□□□ 1.85
RBBP4-218ENST00000527118 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.57■■□□□ 1.84
RBBP4-218ENST00000527118 MAPKBP1O60336 1514 aa26.57■■□□□ 1.84
RBBP4-218ENST00000527118 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.56■■□□□ 1.84
RBBP4-218ENST00000527118 DISP1Q96F81 1524 aa26.55■■□□□ 1.84
RBBP4-218ENST00000527118 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.53■■□□□ 1.84
RBBP4-218ENST00000527118 DIP2BQ9P265 1576 aa26.5■■□□□ 1.83
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.49■■□□□ 1.83
RBBP4-218ENST00000527118 KIAA0556O60303 1618 aa26.48■■□□□ 1.83
RBBP4-218ENST00000527118 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.47■■□□□ 1.83
RBBP4-218ENST00000527118 PRXQ9BXM0 1461 aa26.47■■□□□ 1.83
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC2Q92887 1545 aa26.43■■□□□ 1.82
RBBP4-218ENST00000527118 TSPOAP1O95153 1857 aa26.4■■□□□ 1.82
RBBP4-218ENST00000527118 UACAQ9BZF9 1416 aa26.39■■□□□ 1.82
RBBP4-218ENST00000527118 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.39■■□□□ 1.82
RBBP4-218ENST00000527118 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.32■■□□□ 1.8
RBBP4-218ENST00000527118 ASXL2Q76L83 1435 aa26.31■■□□□ 1.8
RBBP4-218ENST00000527118 GOLGA3Q08378 1498 aa26.31■■□□□ 1.8
RBBP4-218ENST00000527118 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
RBBP4-218ENST00000527118 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.29■■□□□ 1.8
RBBP4-218ENST00000527118 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.27■■□□□ 1.8
RBBP4-218ENST00000527118 EEA1Q15075 1411 aa26.24■■□□□ 1.79
RBBP4-218ENST00000527118 GLI2P10070 1586 aa26.21■■□□□ 1.79
RBBP4-218ENST00000527118 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
RBBP4-218ENST00000527118 KDM6BO15054 1643 aa26.21■■□□□ 1.79
RBBP4-218ENST00000527118 ABCA8O94911 1581 aa26.2■■□□□ 1.79
RBBP4-218ENST00000527118 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
RBBP4-218ENST00000527118 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
RBBP4-218ENST00000527118 P3H3Q8IVL6 736 aa26.16■■□□□ 1.78
RBBP4-218ENST00000527118 SAMD9Q5K651 1589 aa26.14■■□□□ 1.78
RBBP4-218ENST00000527118 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.14■■□□□ 1.77
RBBP4-218ENST00000527118 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.1■■□□□ 1.77
RBBP4-218ENST00000527118 KIF21BO75037 1637 aa26.1■■□□□ 1.77
RBBP4-218ENST00000527118 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
RBBP4-218ENST00000527118 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.08■■□□□ 1.77
RBBP4-218ENST00000527118 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
RBBP4-218ENST00000527118 ARID3CA6NKF2 412 aa26.02■■□□□ 1.76
RBBP4-218ENST00000527118 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.01■■□□□ 1.75
RBBP4-218ENST00000527118 KCNH8Q96L42 1107 aa25.99■■□□□ 1.75
RBBP4-218ENST00000527118 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.98■■□□□ 1.75
RBBP4-218ENST00000527118 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.98■■□□□ 1.75
RBBP4-218ENST00000527118 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.97■■□□□ 1.75
RBBP4-218ENST00000527118 ATP10BO94823 1461 aa25.97■■□□□ 1.75
RBBP4-218ENST00000527118 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.97■■□□□ 1.75
RBBP4-218ENST00000527118 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
RBBP4-218ENST00000527118 CD109Q6YHK3 1445 aa25.9■■□□□ 1.74
RBBP4-218ENST00000527118 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.9■■□□□ 1.74
RBBP4-218ENST00000527118 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RBBP4-218ENST00000527118 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.87■■□□□ 1.73
RBBP4-218ENST00000527118 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RBBP4-218ENST00000527118 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
RBBP4-218ENST00000527118 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
RBBP4-218ENST00000527118 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.81■■□□□ 1.72
RBBP4-218ENST00000527118 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.78■■□□□ 1.72
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.72■■□□□ 1.71
RBBP4-218ENST00000527118 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RBBP4-218ENST00000527118 ADGRL1O94910 1474 aa25.67■■□□□ 1.7
RBBP4-218ENST00000527118 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.67■■□□□ 1.7
RBBP4-218ENST00000527118 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.66■■□□□ 1.7
RBBP4-218ENST00000527118 FMN1Q68DA7 1419 aa25.64■■□□□ 1.7
RBBP4-218ENST00000527118 HECW1Q76N89 1606 aa25.63■■□□□ 1.69
RBBP4-218ENST00000527118 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
RBBP4-218ENST00000527118 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
RBBP4-218ENST00000527118 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.6■■□□□ 1.69
RBBP4-218ENST00000527118 NEO1Q92859 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
RBBP4-218ENST00000527118 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.58■■□□□ 1.69
RBBP4-218ENST00000527118 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.58■■□□□ 1.69
RBBP4-218ENST00000527118 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.53■■□□□ 1.68
RBBP4-218ENST00000527118 RAPGEF3O95398 923 aa25.53■■□□□ 1.68
RBBP4-218ENST00000527118 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
RBBP4-218ENST00000527118 FANCAO15360 1455 aa25.5■■□□□ 1.67
RBBP4-218ENST00000527118 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RBBP4-218ENST00000527118 RICTORQ6R327 1708 aa25.48■■□□□ 1.67
RBBP4-218ENST00000527118 AKNAQ7Z591 1439 aa25.47■■□□□ 1.67
RBBP4-218ENST00000527118 KIF14Q15058 1648 aa25.47■■□□□ 1.67
RBBP4-218ENST00000527118 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.46■■□□□ 1.67
RBBP4-218ENST00000527118 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RBBP4-218ENST00000527118 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RBBP4-218ENST00000527118 PLCH2O75038 1416 aa25.4■■□□□ 1.66
RBBP4-218ENST00000527118 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RBBP4-218ENST00000527118 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.4■■□□□ 1.66
RBBP4-218ENST00000527118 CLIP1P30622 1438 aa25.39■■□□□ 1.66
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.37■■□□□ 1.65
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.35■■□□□ 1.65
RBBP4-218ENST00000527118 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.33■■□□□ 1.65
RBBP4-218ENST00000527118 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.32■■□□□ 1.64
RBBP4-218ENST00000527118 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.32■■□□□ 1.64
RBBP4-218ENST00000527118 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.32■■□□□ 1.64
RBBP4-218ENST00000527118 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117 ms