RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.73■■■■□ 3.79
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.68■■■■□ 3.14
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC9O60706 1549 aa34.39■■■■□ 3.1
RBBP4-218ENST00000527118 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.84■■■□□ 2.85
RBBP4-218ENST00000527118 NACADO15069 1562 aa32.67■■■□□ 2.82
RBBP4-218ENST00000527118 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.6■■■□□ 2.81
RBBP4-218ENST00000527118 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.26■■■□□ 2.76
RBBP4-218ENST00000527118 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.24■■■□□ 2.75
RBBP4-218ENST00000527118 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
RBBP4-218ENST00000527118 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.04■■■□□ 2.72
RBBP4-218ENST00000527118 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.98■■■□□ 2.71
RBBP4-218ENST00000527118 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.96■■■□□ 2.71
RBBP4-218ENST00000527118 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.9■■■□□ 2.7
RBBP4-218ENST00000527118 SCRIBQ14160 1630 aa31.66■■■□□ 2.66
RBBP4-218ENST00000527118 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.4■■■□□ 2.62
RBBP4-218ENST00000527118 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.1■■■□□ 2.57
RBBP4-218ENST00000527118 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
RBBP4-218ENST00000527118 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.91■■■□□ 2.54
RBBP4-218ENST00000527118 SMARCA4P51532 1647 aa30.2■■■□□ 2.43
RBBP4-218ENST00000527118 NCAPD3P42695 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
RBBP4-218ENST00000527118 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.11■■■□□ 2.41
RBBP4-218ENST00000527118 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
RBBP4-218ENST00000527118 SMARCA2P51531 1590 aa30.04■■■□□ 2.4
RBBP4-218ENST00000527118 HMGXB3Q12766 1538 aa29.96■■■□□ 2.39
RBBP4-218ENST00000527118 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.88■■■□□ 2.37
RBBP4-218ENST00000527118 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.86■■■□□ 2.37
RBBP4-218ENST00000527118 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
RBBP4-218ENST00000527118 ERCC6Q03468 1493 aa29.65■■■□□ 2.34
RBBP4-218ENST00000527118 NESP48681 1621 aa29.63■■■□□ 2.33
RBBP4-218ENST00000527118 WIZO95785 1651 aa29.6■■■□□ 2.33
RBBP4-218ENST00000527118 CUX2O14529 1486 aa29.47■■■□□ 2.31
RBBP4-218ENST00000527118 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.44■■■□□ 2.3
RBBP4-218ENST00000527118 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
RBBP4-218ENST00000527118 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.33■■■□□ 2.29
RBBP4-218ENST00000527118 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
RBBP4-218ENST00000527118 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.23■■■□□ 2.27
RBBP4-218ENST00000527118 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.22■■■□□ 2.27
RBBP4-218ENST00000527118 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
RBBP4-218ENST00000527118 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.09■■■□□ 2.25
RBBP4-218ENST00000527118 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.98■■■□□ 2.23
RBBP4-218ENST00000527118 CFTRP13569 1480 aa28.97■■■□□ 2.23
RBBP4-218ENST00000527118 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.94■■■□□ 2.22
RBBP4-218ENST00000527118 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.93■■■□□ 2.22
RBBP4-218ENST00000527118 WDR62O43379 1518 aa28.92■■■□□ 2.22
RBBP4-218ENST00000527118 PRDM2Q13029 1718 aa28.86■■■□□ 2.21
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.84■■■□□ 2.21
RBBP4-218ENST00000527118 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
RBBP4-218ENST00000527118 TOPBP1Q92547 1522 aa28.43■■■□□ 2.14
RBBP4-218ENST00000527118 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.36■■■□□ 2.13
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC8Q09428 1581 aa28.33■■■□□ 2.13
RBBP4-218ENST00000527118 IFT140Q96RY7 1462 aa28.32■■■□□ 2.12
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
RBBP4-218ENST00000527118 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
RBBP4-218ENST00000527118 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
RBBP4-218ENST00000527118 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RBBP4-218ENST00000527118 OSCARQ8IYS5 282 aa28.15■■■□□ 2.1
RBBP4-218ENST00000527118 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
RBBP4-218ENST00000527118 CUX1P39880 1505 aa28.07■■■□□ 2.08
RBBP4-218ENST00000527118 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.084e-7■■■■■ 40.1
RBBP4-218ENST00000527118 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.06■■■□□ 2.08
RBBP4-218ENST00000527118 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.03■■■□□ 2.08
RBBP4-218ENST00000527118 TRIM41Q8WV44 630 aa28.01■■■□□ 2.07
RBBP4-218ENST00000527118 SOGA1O94964 1423 aa28.01■■■□□ 2.07
RBBP4-218ENST00000527118 CHD1O14646 1710 aa27.98■■■□□ 2.07
RBBP4-218ENST00000527118 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RBBP4-218ENST00000527118 WDR97A6NE52 1622 aa27.87■■■□□ 2.05
RBBP4-218ENST00000527118 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.85■■■□□ 2.05
RBBP4-218ENST00000527118 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.85■■■□□ 2.05
RBBP4-218ENST00000527118 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.85■■■□□ 2.05
RBBP4-218ENST00000527118 FBLN2P98095 1184 aa27.82■■■□□ 2.04
RBBP4-218ENST00000527118 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.8■■■□□ 2.04
RBBP4-218ENST00000527118 PBRM1Q86U86 1689 aa27.76■■■□□ 2.03
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGEF11O15085 1522 aa27.75■■■□□ 2.03
RBBP4-218ENST00000527118 GRIN2BQ13224 1484 aa27.73■■■□□ 2.03
RBBP4-218ENST00000527118 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.71■■■□□ 2.03
RBBP4-218ENST00000527118 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.7■■■□□ 2.02
RBBP4-218ENST00000527118 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
RBBP4-218ENST00000527118 SYNJ1O43426 1573 aa27.69■■■□□ 2.02
RBBP4-218ENST00000527118 TOP2BQ02880 1626 aa27.69■■■□□ 2.02
RBBP4-218ENST00000527118 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.69■■■□□ 2.02
RBBP4-218ENST00000527118 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.68■■■□□ 2.02
RBBP4-218ENST00000527118 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
RBBP4-218ENST00000527118 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
RBBP4-218ENST00000527118 SYNJ2O15056 1496 aa27.61■■■□□ 2.01
RBBP4-218ENST00000527118 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.57■■■□□ 2
RBBP4-218ENST00000527118 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.51■■□□□ 1.99
RBBP4-218ENST00000527118 ARAP1Q96P48 1450 aa27.5■■□□□ 1.99
RBBP4-218ENST00000527118 ADAMTS12P58397 1594 aa27.45■■□□□ 1.99
RBBP4-218ENST00000527118 GRIN2AQ12879 1464 aa27.39■■□□□ 1.98
RBBP4-218ENST00000527118 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.36■■□□□ 1.97
RBBP4-218ENST00000527118 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.33■■□□□ 1.96
RBBP4-218ENST00000527118 CEP170Q5SW79 1584 aa27.31■■□□□ 1.96
RBBP4-218ENST00000527118 NUP160Q12769 1436 aa27.26■■□□□ 1.95
RBBP4-218ENST00000527118 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.21■■□□□ 1.95
RBBP4-218ENST00000527118 SHROOM2Q13796 1616 aa27.16■■□□□ 1.94
RBBP4-218ENST00000527118 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
RBBP4-218ENST00000527118 KIF27Q86VH2 1401 aa27.11■■□□□ 1.93
RBBP4-218ENST00000527118 CUL7Q14999 1698 aa27.07■■□□□ 1.92
RBBP4-218ENST00000527118 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.06■■□□□ 1.92
RBBP4-218ENST00000527118 IGF1RP08069 1367 aa27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms