RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 CEP162Q5TB80 1403 aa35.38■■■■□ 3.25
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ACER3-202ENST00000525194 CEP170Q5SW79 1584 aa35.3■■■■□ 3.24
ACER3-202ENST00000525194 CLIP1P30622 1438 aa35.29■■■■□ 3.24
ACER3-202ENST00000525194 IQGAP2Q13576 1575 aa35.27■■■■□ 3.24
ACER3-202ENST00000525194 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
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ACER3-202ENST00000525194 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.11■■■■□ 3.21
ACER3-202ENST00000525194 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.09■■■■□ 3.21
ACER3-202ENST00000525194 OSCARQ8IYS5 282 aa35.04■■■■□ 3.2
ACER3-202ENST00000525194 SAMD9Q5K651 1589 aa35.04■■■■□ 3.2
ACER3-202ENST00000525194 JPH4Q96JJ6 628 aa35.03■■■■□ 3.2
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ACER3-202ENST00000525194 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.96■■■■□ 3.19
ACER3-202ENST00000525194 ARAP1Q96P48 1450 aa34.96■■■■□ 3.19
ACER3-202ENST00000525194 SHROOM2Q13796 1616 aa34.94■■■■□ 3.18
ACER3-202ENST00000525194 P3H3Q8IVL6 736 aa34.9■■■■□ 3.18
ACER3-202ENST00000525194 KIAA0556O60303 1618 aa34.9■■■■□ 3.18
ACER3-202ENST00000525194 DISP1Q96F81 1524 aa34.9■■■■□ 3.18
ACER3-202ENST00000525194 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.89■■■■□ 3.18
ACER3-202ENST00000525194 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.88■■■■□ 3.17
ACER3-202ENST00000525194 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
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ACER3-202ENST00000525194 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.64■■■■□ 3.14
ACER3-202ENST00000525194 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.63■■■■□ 3.13
ACER3-202ENST00000525194 APLP2Q06481 763 aa34.62■■■■□ 3.13
ACER3-202ENST00000525194 PTPRGP23470 1445 aa34.61■■■■□ 3.13
ACER3-202ENST00000525194 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
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ACER3-202ENST00000525194 HECW1Q76N89 1606 aa34.52■■■■□ 3.12
ACER3-202ENST00000525194 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.5■■■■□ 3.11
ACER3-202ENST00000525194 MAP3K1Q13233 1512 aa34.47■■■■□ 3.11
ACER3-202ENST00000525194 ABCA8O94911 1581 aa34.45■■■■□ 3.1
ACER3-202ENST00000525194 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.44■■■■□ 3.1
ACER3-202ENST00000525194 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.42■■■■□ 3.1
ACER3-202ENST00000525194 UACAQ9BZF9 1416 aa34.4■■■■□ 3.1
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF11O15085 1522 aa34.39■■■■□ 3.1
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ACER3-202ENST00000525194 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
ACER3-202ENST00000525194 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.35■■■■□ 3.09
ACER3-202ENST00000525194 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
ACER3-202ENST00000525194 ABCC2Q92887 1545 aa34.31■■■■□ 3.08
ACER3-202ENST00000525194 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.31■■■■□ 3.08
ACER3-202ENST00000525194 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.3■■■■□ 3.08
ACER3-202ENST00000525194 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.26■■■■□ 3.08
ACER3-202ENST00000525194 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.26■■■■□ 3.08
ACER3-202ENST00000525194 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.26■■■■□ 3.08
ACER3-202ENST00000525194 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
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ACER3-202ENST00000525194 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
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ACER3-202ENST00000525194 ARID3CA6NKF2 412 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-202ENST00000525194 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.16■■■■□ 3.06
ACER3-202ENST00000525194 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.13■■■■□ 3.05
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ACER3-202ENST00000525194 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-202ENST00000525194 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.07■■■■□ 3.04
ACER3-202ENST00000525194 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
ACER3-202ENST00000525194 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.04
ACER3-202ENST00000525194 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.04■■■■□ 3.04
ACER3-202ENST00000525194 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.03■■■■□ 3.04
ACER3-202ENST00000525194 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
ACER3-202ENST00000525194 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
ACER3-202ENST00000525194 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
ACER3-202ENST00000525194 NCOA2Q15596 1464 aa33.91■■■■□ 3.02
ACER3-202ENST00000525194 KIF14Q15058 1648 aa33.87■■■■□ 3.01
ACER3-202ENST00000525194 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.85■■■■□ 3.01
ACER3-202ENST00000525194 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.82■■■■□ 3
ACER3-202ENST00000525194 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.81■■■■□ 3
ACER3-202ENST00000525194 ASXL2Q76L83 1435 aa33.79■■■■□ 3
ACER3-202ENST00000525194 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.77■■■■□ 3
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ACER3-202ENST00000525194 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.72■■■□□ 2.99
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ACER3-202ENST00000525194 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.68■■■□□ 2.98
ACER3-202ENST00000525194 MIA2Q96PC5 1412 aa33.68■■■□□ 2.98
ACER3-202ENST00000525194 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.98
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ACER3-202ENST00000525194 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.6■■■□□ 2.97
ACER3-202ENST00000525194 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.59■■■□□ 2.97
ACER3-202ENST00000525194 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
ACER3-202ENST00000525194 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.57■■■□□ 2.97
ACER3-202ENST00000525194 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.56■■■□□ 2.96
ACER3-202ENST00000525194 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.56■■■□□ 2.96
ACER3-202ENST00000525194 PREX2Q70Z35 1606 aa33.54■■■□□ 2.96
ACER3-202ENST00000525194 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
ACER3-202ENST00000525194 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
ACER3-202ENST00000525194 PLCH2O75038 1416 aa33.51■■■□□ 2.95
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