RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.35■■■■■ 5.81
ACER3-202ENST00000525194 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.19■■■■■ 4.82
ACER3-202ENST00000525194 ABCC9O60706 1549 aa43.08■■■■■ 4.49
ACER3-202ENST00000525194 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
ACER3-202ENST00000525194 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.57■■■■■ 4.41
ACER3-202ENST00000525194 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.5■■■■■ 4.39
ACER3-202ENST00000525194 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.35■■■■■ 4.37
ACER3-202ENST00000525194 NACADO15069 1562 aa42.22■■■■■ 4.35
ACER3-202ENST00000525194 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42■■■■■ 4.31
ACER3-202ENST00000525194 SCRIBQ14160 1630 aa41.27■■■■■ 4.2
ACER3-202ENST00000525194 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.23■■■■■ 4.19
ACER3-202ENST00000525194 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.97■■■■■ 4.15
ACER3-202ENST00000525194 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.6■■■■■ 4.09
ACER3-202ENST00000525194 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.45■■■■■ 4.07
ACER3-202ENST00000525194 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.82■■■■□ 3.97
ACER3-202ENST00000525194 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.95
ACER3-202ENST00000525194 SMARCA4P51532 1647 aa39.6■■■■□ 3.93
ACER3-202ENST00000525194 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.56■■■■□ 3.92
ACER3-202ENST00000525194 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
ACER3-202ENST00000525194 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
ACER3-202ENST00000525194 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
ACER3-202ENST00000525194 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.21■■■■□ 3.87
ACER3-202ENST00000525194 WIZO95785 1651 aa39.19■■■■□ 3.86
ACER3-202ENST00000525194 SMARCA2P51531 1590 aa39.16■■■■□ 3.86
ACER3-202ENST00000525194 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.1■■■■□ 3.85
ACER3-202ENST00000525194 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.03■■■■□ 3.84
ACER3-202ENST00000525194 NCAPD3P42695 1498 aa38.93■■■■□ 3.82
ACER3-202ENST00000525194 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
ACER3-202ENST00000525194 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
ACER3-202ENST00000525194 HMGXB3Q12766 1538 aa38.84■■■■□ 3.81
ACER3-202ENST00000525194 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.46■■■■□ 3.75
ACER3-202ENST00000525194 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.41■■■■□ 3.74
ACER3-202ENST00000525194 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.87■■■■□ 3.65
ACER3-202ENST00000525194 CFTRP13569 1480 aa37.86■■■■□ 3.65
ACER3-202ENST00000525194 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.74■■■■□ 3.63
ACER3-202ENST00000525194 PRDM2Q13029 1718 aa37.67■■■■□ 3.62
ACER3-202ENST00000525194 NESP48681 1621 aa37.58■■■■□ 3.61
ACER3-202ENST00000525194 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.48■■■■□ 3.59
ACER3-202ENST00000525194 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.45■■■■□ 3.59
ACER3-202ENST00000525194 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.42■■■■□ 3.58
ACER3-202ENST00000525194 ABCC8Q09428 1581 aa37.31■■■■□ 3.56
ACER3-202ENST00000525194 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.28■■■■□ 3.56
ACER3-202ENST00000525194 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.28■■■■□ 3.56
ACER3-202ENST00000525194 TRIM41Q8WV44 630 aa37.23■■■■□ 3.55
ACER3-202ENST00000525194 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.19■■■■□ 3.54
ACER3-202ENST00000525194 ERCC6Q03468 1493 aa37.11■■■■□ 3.53
ACER3-202ENST00000525194 SYNJ1O43426 1573 aa37.08■■■■□ 3.53
ACER3-202ENST00000525194 TOP2BQ02880 1626 aa37.07■■■■□ 3.52
ACER3-202ENST00000525194 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.05■■■■□ 3.52
ACER3-202ENST00000525194 CUX1P39880 1505 aa37.05■■■■□ 3.52
ACER3-202ENST00000525194 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37■■■■□ 3.51
ACER3-202ENST00000525194 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.99■■■■□ 3.51
ACER3-202ENST00000525194 TOPBP1Q92547 1522 aa36.94■■■■□ 3.5
ACER3-202ENST00000525194 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
ACER3-202ENST00000525194 WDR62O43379 1518 aa36.8■■■■□ 3.48
ACER3-202ENST00000525194 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ACER3-202ENST00000525194 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.77■■■■□ 3.48
ACER3-202ENST00000525194 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
ACER3-202ENST00000525194 SOGA1O94964 1423 aa36.6■■■■□ 3.45
ACER3-202ENST00000525194 EEA1Q15075 1411 aa36.54■■■■□ 3.44
ACER3-202ENST00000525194 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.5■■■■□ 3.43
ACER3-202ENST00000525194 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.49■■■■□ 3.43
ACER3-202ENST00000525194 CUX2O14529 1486 aa36.47■■■■□ 3.43
ACER3-202ENST00000525194 IFT140Q96RY7 1462 aa36.46■■■■□ 3.43
ACER3-202ENST00000525194 KIF27Q86VH2 1401 aa36.45■■■■□ 3.43
ACER3-202ENST00000525194 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
ACER3-202ENST00000525194 WDR97A6NE52 1622 aa36.39■■■■□ 3.42
ACER3-202ENST00000525194 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
ACER3-202ENST00000525194 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.35■■■■□ 3.41
ACER3-202ENST00000525194 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.29■■■■□ 3.4
ACER3-202ENST00000525194 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
ACER3-202ENST00000525194 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.22■■■■□ 3.39
ACER3-202ENST00000525194 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.19■■■■□ 3.38
ACER3-202ENST00000525194 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
ACER3-202ENST00000525194 IGF1RP08069 1367 aa36.11■■■■□ 3.37
ACER3-202ENST00000525194 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.09■■■■□ 3.37
ACER3-202ENST00000525194 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.09■■■■□ 3.37
ACER3-202ENST00000525194 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
ACER3-202ENST00000525194 GRIN2BQ13224 1484 aa36.04■■■■□ 3.36
ACER3-202ENST00000525194 KIF21BO75037 1637 aa36.01■■■■□ 3.36
ACER3-202ENST00000525194 PBRM1Q86U86 1689 aa36.01■■■■□ 3.36
ACER3-202ENST00000525194 CUL7Q14999 1698 aa36■■■■□ 3.35
ACER3-202ENST00000525194 PRXQ9BXM0 1461 aa35.99■■■■□ 3.35
ACER3-202ENST00000525194 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.95■■■■□ 3.35
ACER3-202ENST00000525194 GOLGA3Q08378 1498 aa35.92■■■■□ 3.34
ACER3-202ENST00000525194 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.89■■■■□ 3.34
ACER3-202ENST00000525194 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.87■■■■□ 3.33
ACER3-202ENST00000525194 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
ACER3-202ENST00000525194 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
ACER3-202ENST00000525194 ADAMTS12P58397 1594 aa35.8■■■■□ 3.32
ACER3-202ENST00000525194 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.8■■■■□ 3.32
ACER3-202ENST00000525194 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.78■■■■□ 3.32
ACER3-202ENST00000525194 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ACER3-202ENST00000525194 SYNJ2O15056 1496 aa35.67■■■■□ 3.3
ACER3-202ENST00000525194 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.67■■■■□ 3.3
ACER3-202ENST00000525194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
ACER3-202ENST00000525194 GRIN2AQ12879 1464 aa35.56■■■■□ 3.28
ACER3-202ENST00000525194 FBLN2P98095 1184 aa35.5■■■■□ 3.27
ACER3-202ENST00000525194 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.45■■■■□ 3.27
ACER3-202ENST00000525194 CHD1O14646 1710 aa35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms