RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523985.5

CCNC-217, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCNC, Length 958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-217ENST00000523985 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNC-217ENST00000523985 EEA1Q15075 1411 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNC-217ENST00000523985 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.2■■□□□ 1.47
CCNC-217ENST00000523985 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNC-217ENST00000523985 ARAP1Q96P48 1450 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNC-217ENST00000523985 SHROOM2Q13796 1616 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNC-217ENST00000523985 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCNC-217ENST00000523985 PRXQ9BXM0 1461 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNC-217ENST00000523985 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNC-217ENST00000523985 IQGAP2Q13576 1575 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNC-217ENST00000523985 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNC-217ENST00000523985 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CCNC-217ENST00000523985 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNC-217ENST00000523985 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.9■■□□□ 1.42
CCNC-217ENST00000523985 PTPRGP23470 1445 aa23.89■■□□□ 1.41
CCNC-217ENST00000523985 GOLGA3Q08378 1498 aa23.85■■□□□ 1.41
CCNC-217ENST00000523985 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
CCNC-217ENST00000523985 DISP1Q96F81 1524 aa23.82■■□□□ 1.4
CCNC-217ENST00000523985 KIF21BO75037 1637 aa23.79■■□□□ 1.4
CCNC-217ENST00000523985 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.77■■□□□ 1.4
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CCNC-217ENST00000523985 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.7■■□□□ 1.38
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CCNC-217ENST00000523985 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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CCNC-217ENST00000523985 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.62■■□□□ 1.37
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CCNC-217ENST00000523985 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNC-217ENST00000523985 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNC-217ENST00000523985 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.52■■□□□ 1.36
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CCNC-217ENST00000523985 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.51■■□□□ 1.35
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CCNC-217ENST00000523985 ABCA8O94911 1581 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNC-217ENST00000523985 ASXL2Q76L83 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNC-217ENST00000523985 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNC-217ENST00000523985 FMN1Q68DA7 1419 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNC-217ENST00000523985 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNC-217ENST00000523985 ATP10BO94823 1461 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNC-217ENST00000523985 DIP2BQ9P265 1576 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNC-217ENST00000523985 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CCNC-217ENST00000523985 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNC-217ENST00000523985 GLI2P10070 1586 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNC-217ENST00000523985 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNC-217ENST00000523985 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNC-217ENST00000523985 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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CCNC-217ENST00000523985 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCNC-217ENST00000523985 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNC-217ENST00000523985 CLIP1P30622 1438 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNC-217ENST00000523985 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNC-217ENST00000523985 KCNH8Q96L42 1107 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNC-217ENST00000523985 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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CCNC-217ENST00000523985 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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CCNC-217ENST00000523985 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNC-217ENST00000523985 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNC-217ENST00000523985 CD109Q6YHK3 1445 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNC-217ENST00000523985 HECW1Q76N89 1606 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNC-217ENST00000523985 CEP162Q5TB80 1403 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNC-217ENST00000523985 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNC-217ENST00000523985 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNC-217ENST00000523985 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNC-217ENST00000523985 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNC-217ENST00000523985 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNC-217ENST00000523985 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNC-217ENST00000523985 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNC-217ENST00000523985 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNC-217ENST00000523985 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCNC-217ENST00000523985 TSPOAP1O95153 1857 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNC-217ENST00000523985 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCNC-217ENST00000523985 KDM6BO15054 1643 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNC-217ENST00000523985 NEO1Q92859 1461 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNC-217ENST00000523985 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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CCNC-217ENST00000523985 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNC-217ENST00000523985 PLCH2O75038 1416 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNC-217ENST00000523985 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CCNC-217ENST00000523985 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNC-217ENST00000523985 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNC-217ENST00000523985 KIF14Q15058 1648 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNC-217ENST00000523985 FANCAO15360 1455 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNC-217ENST00000523985 AKNAQ7Z591 1439 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNC-217ENST00000523985 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNC-217ENST00000523985 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNC-217ENST00000523985 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNC-217ENST00000523985 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNC-217ENST00000523985 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNC-217ENST00000523985 MAP3K1Q13233 1512 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNC-217ENST00000523985 APLP2Q06481 763 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNC-217ENST00000523985 RAPGEF3O95398 923 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNC-217ENST00000523985 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNC-217ENST00000523985 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNC-217ENST00000523985 ADGRL1O94910 1474 aa22.73■■□□□ 1.23
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