RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523985.5

CCNC-217, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCNC, Length 958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-217ENST00000523985 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.9■■■■□ 3.18
CCNC-217ENST00000523985 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.96■■■□□ 2.55
CCNC-217ENST00000523985 ABCC9O60706 1549 aa30.27■■■□□ 2.44
CCNC-217ENST00000523985 NACADO15069 1562 aa29.22■■■□□ 2.27
CCNC-217ENST00000523985 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.21■■■□□ 2.27
CCNC-217ENST00000523985 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.2■■■□□ 2.26
CCNC-217ENST00000523985 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.14■■■□□ 2.25
CCNC-217ENST00000523985 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CCNC-217ENST00000523985 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.97■■■□□ 2.23
CCNC-217ENST00000523985 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
CCNC-217ENST00000523985 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.27■■■□□ 2.12
CCNC-217ENST00000523985 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.21■■■□□ 2.11
CCNC-217ENST00000523985 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.15■■■□□ 2.1
CCNC-217ENST00000523985 SCRIBQ14160 1630 aa28.14■■■□□ 2.1
CCNC-217ENST00000523985 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.83■■■□□ 2.05
CCNC-217ENST00000523985 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CCNC-217ENST00000523985 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.37■■□□□ 1.97
CCNC-217ENST00000523985 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.27■■□□□ 1.96
CCNC-217ENST00000523985 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CCNC-217ENST00000523985 NCAPD3P42695 1498 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNC-217ENST00000523985 SMARCA4P51532 1647 aa27■■□□□ 1.91
CCNC-217ENST00000523985 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNC-217ENST00000523985 SMARCA2P51531 1590 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNC-217ENST00000523985 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNC-217ENST00000523985 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNC-217ENST00000523985 HMGXB3Q12766 1538 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNC-217ENST00000523985 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CCNC-217ENST00000523985 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CCNC-217ENST00000523985 WIZO95785 1651 aa26.45■■□□□ 1.82
CCNC-217ENST00000523985 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CCNC-217ENST00000523985 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.23■■□□□ 1.79
CCNC-217ENST00000523985 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNC-217ENST00000523985 ERCC6Q03468 1493 aa26.17■■□□□ 1.78
CCNC-217ENST00000523985 NESP48681 1621 aa26.16■■□□□ 1.78
CCNC-217ENST00000523985 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNC-217ENST00000523985 CFTRP13569 1480 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNC-217ENST00000523985 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.01■■□□□ 1.75
CCNC-217ENST00000523985 CUX2O14529 1486 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNC-217ENST00000523985 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CCNC-217ENST00000523985 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.84■■□□□ 1.73
CCNC-217ENST00000523985 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CCNC-217ENST00000523985 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.79■■□□□ 1.72
CCNC-217ENST00000523985 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.77■■□□□ 1.72
CCNC-217ENST00000523985 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.76■■□□□ 1.71
CCNC-217ENST00000523985 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CCNC-217ENST00000523985 WDR62O43379 1518 aa25.65■■□□□ 1.7
CCNC-217ENST00000523985 PRDM2Q13029 1718 aa25.6■■□□□ 1.69
CCNC-217ENST00000523985 ABCC8Q09428 1581 aa25.56■■□□□ 1.68
CCNC-217ENST00000523985 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CCNC-217ENST00000523985 TOPBP1Q92547 1522 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNC-217ENST00000523985 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNC-217ENST00000523985 IFT140Q96RY7 1462 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNC-217ENST00000523985 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNC-217ENST00000523985 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CCNC-217ENST00000523985 SOGA1O94964 1423 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNC-217ENST00000523985 CUX1P39880 1505 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNC-217ENST00000523985 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNC-217ENST00000523985 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CCNC-217ENST00000523985 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCNC-217ENST00000523985 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CCNC-217ENST00000523985 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.03■■□□□ 1.6
CCNC-217ENST00000523985 WDR97A6NE52 1622 aa25■■□□□ 1.59
CCNC-217ENST00000523985 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
CCNC-217ENST00000523985 TOP2BQ02880 1626 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNC-217ENST00000523985 OSCARQ8IYS5 282 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNC-217ENST00000523985 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNC-217ENST00000523985 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNC-217ENST00000523985 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNC-217ENST00000523985 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCNC-217ENST00000523985 SYNJ1O43426 1573 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNC-217ENST00000523985 GRIN2BQ13224 1484 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNC-217ENST00000523985 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNC-217ENST00000523985 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CCNC-217ENST00000523985 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CCNC-217ENST00000523985 FBLN2P98095 1184 aa24.74■■□□□ 1.55
CCNC-217ENST00000523985 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNC-217ENST00000523985 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNC-217ENST00000523985 SYNJ2O15056 1496 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNC-217ENST00000523985 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNC-217ENST00000523985 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.64■■□□□ 1.53
CCNC-217ENST00000523985 KIF27Q86VH2 1401 aa24.62■■□□□ 1.53
CCNC-217ENST00000523985 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNC-217ENST00000523985 TRIM41Q8WV44 630 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNC-217ENST00000523985 PBRM1Q86U86 1689 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNC-217ENST00000523985 IGF1RP08069 1367 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNC-217ENST00000523985 CHD1O14646 1710 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNC-217ENST00000523985 GRIN2AQ12879 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNC-217ENST00000523985 ADAMTS12P58397 1594 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNC-217ENST00000523985 NUP160Q12769 1436 aa24.42■■□□□ 1.5
CCNC-217ENST00000523985 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNC-217ENST00000523985 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNC-217ENST00000523985 ARHGEF11O15085 1522 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNC-217ENST00000523985 CUL7Q14999 1698 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNC-217ENST00000523985 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNC-217ENST00000523985 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNC-217ENST00000523985 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNC-217ENST00000523985 CEP170Q5SW79 1584 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNC-217ENST00000523985 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.25■■□□□ 1.47
CCNC-217ENST00000523985 JPH4Q96JJ6 628 aa24.25■■□□□ 1.47
CCNC-217ENST00000523985 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms