RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521545.6

LAPTM4B-203, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAPTM4B, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-203ENST00000521545 CUL7Q14999 1698 aa44.7■■■■■ 4.75
LAPTM4B-203ENST00000521545 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.65■■■■■ 4.74
LAPTM4B-203ENST00000521545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.58■■■■■ 4.73
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.55■■■■■ 4.72
LAPTM4B-203ENST00000521545 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.27■■■■■ 4.68
LAPTM4B-203ENST00000521545 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.2■■■■■ 4.67
LAPTM4B-203ENST00000521545 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.16■■■■■ 4.66
LAPTM4B-203ENST00000521545 IQGAP2Q13576 1575 aa44.15■■■■■ 4.66
LAPTM4B-203ENST00000521545 PTPRGP23470 1445 aa44.11■■■■■ 4.65
LAPTM4B-203ENST00000521545 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
LAPTM4B-203ENST00000521545 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.08■■■■■ 4.65
LAPTM4B-203ENST00000521545 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.05■■■■■ 4.64
LAPTM4B-203ENST00000521545 MAPKBP1O60336 1514 aa43.98■■■■■ 4.63
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.96■■■■■ 4.63
LAPTM4B-203ENST00000521545 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.95■■■■■ 4.63
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.92■■■■■ 4.62
LAPTM4B-203ENST00000521545 DISP1Q96F81 1524 aa43.89■■■■■ 4.62
LAPTM4B-203ENST00000521545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.89■■■■■ 4.62
LAPTM4B-203ENST00000521545 PRXQ9BXM0 1461 aa43.8■■■■■ 4.6
LAPTM4B-203ENST00000521545 DIP2BQ9P265 1576 aa43.77■■■■■ 4.6
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCC2Q92887 1545 aa43.77■■■■■ 4.6
LAPTM4B-203ENST00000521545 UACAQ9BZF9 1416 aa43.76■■■■■ 4.6
LAPTM4B-203ENST00000521545 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.75■■■■■ 4.59
LAPTM4B-203ENST00000521545 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.73■■■■■ 4.59
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIAA0556O60303 1618 aa43.72■■■■■ 4.59
LAPTM4B-203ENST00000521545 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.66■■■■■ 4.58
LAPTM4B-203ENST00000521545 GOLGA3Q08378 1498 aa43.64■■■■■ 4.58
LAPTM4B-203ENST00000521545 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.6■■■■■ 4.57
LAPTM4B-203ENST00000521545 ASXL2Q76L83 1435 aa43.59■■■■■ 4.57
LAPTM4B-203ENST00000521545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.52■■■■■ 4.56
LAPTM4B-203ENST00000521545 EEA1Q15075 1411 aa43.51■■■■■ 4.56
LAPTM4B-203ENST00000521545 TSPOAP1O95153 1857 aa43.48■■■■■ 4.55
LAPTM4B-203ENST00000521545 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
LAPTM4B-203ENST00000521545 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
LAPTM4B-203ENST00000521545 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
LAPTM4B-203ENST00000521545 GLI2P10070 1586 aa43.4■■■■■ 4.54
LAPTM4B-203ENST00000521545 KDM6BO15054 1643 aa43.33■■■■■ 4.53
LAPTM4B-203ENST00000521545 P3H3Q8IVL6 736 aa43.32■■■■■ 4.53
LAPTM4B-203ENST00000521545 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCA8O94911 1581 aa43.3■■■■■ 4.52
LAPTM4B-203ENST00000521545 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.23■■■■■ 4.51
LAPTM4B-203ENST00000521545 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
LAPTM4B-203ENST00000521545 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.16■■■■■ 4.5
LAPTM4B-203ENST00000521545 SAMD9Q5K651 1589 aa43.14■■■■■ 4.5
LAPTM4B-203ENST00000521545 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.14■■■■■ 4.5
LAPTM4B-203ENST00000521545 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
LAPTM4B-203ENST00000521545 KCNH8Q96L42 1107 aa43.11■■■■■ 4.49
LAPTM4B-203ENST00000521545 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.1■■■■■ 4.49
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIF21BO75037 1637 aa43.06■■■■■ 4.48
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARID3CA6NKF2 412 aa43.05■■■■■ 4.48
LAPTM4B-203ENST00000521545 ATP10BO94823 1461 aa42.99■■■■■ 4.47
LAPTM4B-203ENST00000521545 CD109Q6YHK3 1445 aa42.97■■■■■ 4.47
LAPTM4B-203ENST00000521545 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.93■■■■■ 4.46
LAPTM4B-203ENST00000521545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.92■■■■■ 4.46
LAPTM4B-203ENST00000521545 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.91■■■■■ 4.46
LAPTM4B-203ENST00000521545 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
LAPTM4B-203ENST00000521545 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
LAPTM4B-203ENST00000521545 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
LAPTM4B-203ENST00000521545 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
LAPTM4B-203ENST00000521545 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.88■■■■■ 4.45
LAPTM4B-203ENST00000521545 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.87■■■■■ 4.45
LAPTM4B-203ENST00000521545 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.83■■■■■ 4.45
LAPTM4B-203ENST00000521545 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
LAPTM4B-203ENST00000521545 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.76■■■■■ 4.44
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.65■■■■■ 4.42
LAPTM4B-203ENST00000521545 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.65■■■■■ 4.42
LAPTM4B-203ENST00000521545 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.56■■■■■ 4.4
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.52■■■■■ 4.4
LAPTM4B-203ENST00000521545 FMN1Q68DA7 1419 aa42.51■■■■■ 4.4
LAPTM4B-203ENST00000521545 ADGRL1O94910 1474 aa42.49■■■■■ 4.39
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.49■■■■■ 4.39
LAPTM4B-203ENST00000521545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
LAPTM4B-203ENST00000521545 NEO1Q92859 1461 aa42.44■■■■■ 4.38
LAPTM4B-203ENST00000521545 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
LAPTM4B-203ENST00000521545 HECW1Q76N89 1606 aa42.35■■■■■ 4.37
LAPTM4B-203ENST00000521545 RAPGEF3O95398 923 aa42.33■■■■■ 4.37
LAPTM4B-203ENST00000521545 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.361e-8■■□□□ 11.6
LAPTM4B-203ENST00000521545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
LAPTM4B-203ENST00000521545 FANCAO15360 1455 aa42.23■■■■■ 4.35
LAPTM4B-203ENST00000521545 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.22■■■■■ 4.35
LAPTM4B-203ENST00000521545 AKNAQ7Z591 1439 aa42.21■■■■■ 4.35
LAPTM4B-203ENST00000521545 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.2■■■■■ 4.35
LAPTM4B-203ENST00000521545 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
LAPTM4B-203ENST00000521545 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.12■■■■■ 4.33
LAPTM4B-203ENST00000521545 PLCH2O75038 1416 aa42.1■■■■■ 4.33
LAPTM4B-203ENST00000521545 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
LAPTM4B-203ENST00000521545 CLIP1P30622 1438 aa42.06■■■■■ 4.32
LAPTM4B-203ENST00000521545 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.05■■■■■ 4.32
LAPTM4B-203ENST00000521545 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.02■■■■■ 4.32
LAPTM4B-203ENST00000521545 RICTORQ6R327 1708 aa42.02■■■■■ 4.32
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIF14Q15058 1648 aa42.01■■■■■ 4.32
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
LAPTM4B-203ENST00000521545 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.99■■■■■ 4.31
LAPTM4B-203ENST00000521545 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.98■■■■■ 4.31
LAPTM4B-203ENST00000521545 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
LAPTM4B-203ENST00000521545 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.97■■■■■ 4.31
LAPTM4B-203ENST00000521545 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.95■■■■■ 4.31
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.91■■■■■ 4.3
LAPTM4B-203ENST00000521545 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.9■■■■■ 4.3
LAPTM4B-203ENST00000521545 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.89■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms