RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM49B-211ENST00000519070 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.49■■□□□ 1.83
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FAM49B-211ENST00000519070 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
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FAM49B-211ENST00000519070 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
FAM49B-211ENST00000519070 DIP2BQ9P265 1576 aa26.43■■□□□ 1.82
FAM49B-211ENST00000519070 ASXL2Q76L83 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
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FAM49B-211ENST00000519070 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
FAM49B-211ENST00000519070 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.32■■□□□ 1.8
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FAM49B-211ENST00000519070 FMN1Q68DA7 1419 aa26.23■■□□□ 1.79
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FAM49B-211ENST00000519070 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.11■■□□□ 1.77
FAM49B-211ENST00000519070 KCNH8Q96L42 1107 aa26.08■■□□□ 1.77
FAM49B-211ENST00000519070 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.06■■□□□ 1.76
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FAM49B-211ENST00000519070 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM49B-211ENST00000519070 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM49B-211ENST00000519070 CD109Q6YHK3 1445 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM49B-211ENST00000519070 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26■■□□□ 1.75
FAM49B-211ENST00000519070 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
FAM49B-211ENST00000519070 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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FAM49B-211ENST00000519070 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.93■■□□□ 1.74
FAM49B-211ENST00000519070 KDM6BO15054 1643 aa25.92■■□□□ 1.74
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FAM49B-211ENST00000519070 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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FAM49B-211ENST00000519070 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.68■■□□□ 1.7
FAM49B-211ENST00000519070 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.66■■□□□ 1.7
FAM49B-211ENST00000519070 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.66■■□□□ 1.7
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FAM49B-211ENST00000519070 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.63■■□□□ 1.69
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