RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519020.5

FAM49B-210, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM49B, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-210ENST00000519020 JPH4Q96JJ6 628 aa27.47■■□□□ 1.99
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FAM49B-210ENST00000519020 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.47■■□□□ 1.99
FAM49B-210ENST00000519020 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
FAM49B-210ENST00000519020 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.32■■□□□ 1.96
FAM49B-210ENST00000519020 IQGAP2Q13576 1575 aa27.31■■□□□ 1.96
FAM49B-210ENST00000519020 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.22■■□□□ 1.95
FAM49B-210ENST00000519020 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.21■■□□□ 1.95
FAM49B-210ENST00000519020 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.16■■□□□ 1.94
FAM49B-210ENST00000519020 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.13■■□□□ 1.93
FAM49B-210ENST00000519020 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.13■■□□□ 1.93
FAM49B-210ENST00000519020 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.12■■□□□ 1.93
FAM49B-210ENST00000519020 MAPKBP1O60336 1514 aa27.12■■□□□ 1.93
FAM49B-210ENST00000519020 PRXQ9BXM0 1461 aa27.11■■□□□ 1.93
FAM49B-210ENST00000519020 PTPRGP23470 1445 aa27.1■■□□□ 1.93
FAM49B-210ENST00000519020 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
FAM49B-210ENST00000519020 DISP1Q96F81 1524 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM49B-210ENST00000519020 EEA1Q15075 1411 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM49B-210ENST00000519020 KIAA0556O60303 1618 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM49B-210ENST00000519020 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.99■■□□□ 1.91
FAM49B-210ENST00000519020 GOLGA3Q08378 1498 aa26.99■■□□□ 1.91
FAM49B-210ENST00000519020 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.99■■□□□ 1.91
FAM49B-210ENST00000519020 ABCC2Q92887 1545 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM49B-210ENST00000519020 DIP2BQ9P265 1576 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM49B-210ENST00000519020 UACAQ9BZF9 1416 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM49B-210ENST00000519020 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.93■■□□□ 1.9
FAM49B-210ENST00000519020 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
FAM49B-210ENST00000519020 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.85■■□□□ 1.89
FAM49B-210ENST00000519020 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.84■■□□□ 1.89
FAM49B-210ENST00000519020 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.84■■□□□ 1.89
FAM49B-210ENST00000519020 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
FAM49B-210ENST00000519020 KIF21BO75037 1637 aa26.79■■□□□ 1.88
FAM49B-210ENST00000519020 GLI2P10070 1586 aa26.78■■□□□ 1.88
FAM49B-210ENST00000519020 TSPOAP1O95153 1857 aa26.78■■□□□ 1.88
FAM49B-210ENST00000519020 ASXL2Q76L83 1435 aa26.77■■□□□ 1.88
FAM49B-210ENST00000519020 ABCA8O94911 1581 aa26.75■■□□□ 1.87
FAM49B-210ENST00000519020 SAMD9Q5K651 1589 aa26.75■■□□□ 1.87
FAM49B-210ENST00000519020 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FAM49B-210ENST00000519020 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.71■■□□□ 1.87
FAM49B-210ENST00000519020 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
FAM49B-210ENST00000519020 KDM6BO15054 1643 aa26.64■■□□□ 1.85
FAM49B-210ENST00000519020 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.64■■□□□ 1.85
FAM49B-210ENST00000519020 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
FAM49B-210ENST00000519020 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.62■■□□□ 1.85
FAM49B-210ENST00000519020 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.6■■□□□ 1.85
FAM49B-210ENST00000519020 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.58■■□□□ 1.85
FAM49B-210ENST00000519020 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.56■■□□□ 1.84
FAM49B-210ENST00000519020 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.55■■□□□ 1.84
FAM49B-210ENST00000519020 P3H3Q8IVL6 736 aa26.52■■□□□ 1.84
FAM49B-210ENST00000519020 ATP10BO94823 1461 aa26.47■■□□□ 1.83
FAM49B-210ENST00000519020 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.45■■□□□ 1.82
FAM49B-210ENST00000519020 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.42■■□□□ 1.82
FAM49B-210ENST00000519020 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
FAM49B-210ENST00000519020 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
FAM49B-210ENST00000519020 CD109Q6YHK3 1445 aa26.39■■□□□ 1.81
FAM49B-210ENST00000519020 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
FAM49B-210ENST00000519020 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.37■■□□□ 1.81
FAM49B-210ENST00000519020 KCNH8Q96L42 1107 aa26.35■■□□□ 1.81
FAM49B-210ENST00000519020 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
FAM49B-210ENST00000519020 FMN1Q68DA7 1419 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM49B-210ENST00000519020 ARID3CA6NKF2 412 aa26.29■■□□□ 1.8
FAM49B-210ENST00000519020 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.29■■□□□ 1.8
FAM49B-210ENST00000519020 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
FAM49B-210ENST00000519020 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
FAM49B-210ENST00000519020 HECW1Q76N89 1606 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM49B-210ENST00000519020 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FAM49B-210ENST00000519020 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM49B-210ENST00000519020 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.23■■□□□ 1.79
FAM49B-210ENST00000519020 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM49B-210ENST00000519020 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.2■■□□□ 1.79
FAM49B-210ENST00000519020 NEO1Q92859 1461 aa26.17■■□□□ 1.78
FAM49B-210ENST00000519020 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.16■■□□□ 1.78
FAM49B-210ENST00000519020 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
FAM49B-210ENST00000519020 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.771e-6■■■■□ 22.1
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FAM49B-210ENST00000519020 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
FAM49B-210ENST00000519020 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.07■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.04■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.04■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.03■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.03■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 KIF14Q15058 1648 aa26.02■■□□□ 1.76
FAM49B-210ENST00000519020 FANCAO15360 1455 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 ADGRL1O94910 1474 aa26.01■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 CLIP1P30622 1438 aa26■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 RICTORQ6R327 1708 aa25.99■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.98■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 AKNAQ7Z591 1439 aa25.97■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.97■■□□□ 1.75
FAM49B-210ENST00000519020 PLCH2O75038 1416 aa25.95■■□□□ 1.74
FAM49B-210ENST00000519020 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
FAM49B-210ENST00000519020 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM49B-210ENST00000519020 RAPGEF3O95398 923 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM49B-210ENST00000519020 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM49B-210ENST00000519020 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.84■■□□□ 1.73
FAM49B-210ENST00000519020 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.84■■□□□ 1.73
FAM49B-210ENST00000519020 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.83■■□□□ 1.73
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