RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517910.1

AP003356.1-202, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AP003356.1, Length 2,770 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003356.1-202ENST00000517910 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
AP003356.1-202ENST00000517910 ARAP1Q96P48 1450 aa27.19■■□□□ 1.94
AP003356.1-202ENST00000517910 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
AP003356.1-202ENST00000517910 NBR1Q14596 966 aa27.1■■□□□ 1.93
AP003356.1-202ENST00000517910 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.04■■□□□ 1.92
AP003356.1-202ENST00000517910 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
AP003356.1-202ENST00000517910 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.01■■□□□ 1.91
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AP003356.1-202ENST00000517910 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
AP003356.1-202ENST00000517910 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
AP003356.1-202ENST00000517910 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.93■■□□□ 1.9
AP003356.1-202ENST00000517910 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.91■■□□□ 1.9
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AP003356.1-202ENST00000517910 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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AP003356.1-202ENST00000517910 TONSLQ96HA7 1378 aa26.73■■□□□ 1.87
AP003356.1-202ENST00000517910 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
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AP003356.1-202ENST00000517910 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.67■■□□□ 1.86
AP003356.1-202ENST00000517910 CCDC184Q52MB2 194 aa26.64■■□□□ 1.86
AP003356.1-202ENST00000517910 TIAM1Q13009 1591 aa26.63■■□□□ 1.85
AP003356.1-202ENST00000517910 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.61■■□□□ 1.85
AP003356.1-202ENST00000517910 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
AP003356.1-202ENST00000517910 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.59■■□□□ 1.85
AP003356.1-202ENST00000517910 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.58■■□□□ 1.85
AP003356.1-202ENST00000517910 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.56■■□□□ 1.84
AP003356.1-202ENST00000517910 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.55■■□□□ 1.84
AP003356.1-202ENST00000517910 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.55■■□□□ 1.84
AP003356.1-202ENST00000517910 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.55■■□□□ 1.84
AP003356.1-202ENST00000517910 MAP3K1Q13233 1512 aa26.54■■□□□ 1.84
AP003356.1-202ENST00000517910 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.52■■□□□ 1.84
AP003356.1-202ENST00000517910 KIF27Q86VH2 1401 aa26.51■■□□□ 1.83
AP003356.1-202ENST00000517910 MRS2Q9HD23 443 aa26.49■■□□□ 1.83
AP003356.1-202ENST00000517910 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
AP003356.1-202ENST00000517910 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
AP003356.1-202ENST00000517910 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.45■■□□□ 1.82
AP003356.1-202ENST00000517910 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
AP003356.1-202ENST00000517910 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
AP003356.1-202ENST00000517910 NEFMP07197 916 aa26.4■■□□□ 1.82
AP003356.1-202ENST00000517910 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.4■■□□□ 1.82
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AP003356.1-202ENST00000517910 AKNAQ7Z591 1439 aa26.39■■□□□ 1.81
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AP003356.1-202ENST00000517910 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.29■■□□□ 1.8
AP003356.1-202ENST00000517910 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
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AP003356.1-202ENST00000517910 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.16■■□□□ 1.78
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AP003356.1-202ENST00000517910 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.16■■□□□ 1.78
AP003356.1-202ENST00000517910 IGF1RP08069 1367 aa26.15■■□□□ 1.78
AP003356.1-202ENST00000517910 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.13■■□□□ 1.77
AP003356.1-202ENST00000517910 PDE4AP27815 886 aa26.13■■□□□ 1.77
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AP003356.1-202ENST00000517910 GSE1Q14687 1217 aa26.1■■□□□ 1.77
AP003356.1-202ENST00000517910 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.09■■□□□ 1.77
AP003356.1-202ENST00000517910 FMN1Q68DA7 1419 aa26.07■■□□□ 1.76
AP003356.1-202ENST00000517910 BACH2Q9BYV9 841 aa26.07■■□□□ 1.76
AP003356.1-202ENST00000517910 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.04■■□□□ 1.76
AP003356.1-202ENST00000517910 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.04■■□□□ 1.76
AP003356.1-202ENST00000517910 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.03■■□□□ 1.76
AP003356.1-202ENST00000517910 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.01■■□□□ 1.75
AP003356.1-202ENST00000517910 EXOC6Q8TAG9 804 aa26■■□□□ 1.75
AP003356.1-202ENST00000517910 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
AP003356.1-202ENST00000517910 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.97■■□□□ 1.75
AP003356.1-202ENST00000517910 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.96■■□□□ 1.75
AP003356.1-202ENST00000517910 NFKBIBQ15653 356 aa25.96■■□□□ 1.75
AP003356.1-202ENST00000517910 MS4A1P11836 297 aa25.96■■□□□ 1.75
AP003356.1-202ENST00000517910 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.95■■□□□ 1.74
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