RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514449.5

TMCO6-212, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 6, humanhuman

TSL 5

Gene TMCO6, Length 760 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6-212ENST00000514449 JPH4Q96JJ6 628 aa42.2■■■■■ 4.35
TMCO6-212ENST00000514449 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.19■■■■■ 4.34
TMCO6-212ENST00000514449 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
TMCO6-212ENST00000514449 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.1■■■■■ 4.33
TMCO6-212ENST00000514449 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.08■■■■■ 4.33
TMCO6-212ENST00000514449 EEA1Q15075 1411 aa42.05■■■■■ 4.32
TMCO6-212ENST00000514449 PRXQ9BXM0 1461 aa41.98■■■■■ 4.31
TMCO6-212ENST00000514449 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.97■■■■■ 4.31
TMCO6-212ENST00000514449 IQGAP2Q13576 1575 aa41.96■■■■■ 4.31
TMCO6-212ENST00000514449 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.82■■■■■ 4.29
TMCO6-212ENST00000514449 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.8■■■■■ 4.28
TMCO6-212ENST00000514449 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
TMCO6-212ENST00000514449 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.72■■■■■ 4.27
TMCO6-212ENST00000514449 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.64■■■■■ 4.26
TMCO6-212ENST00000514449 PTPRGP23470 1445 aa41.62■■■■■ 4.25
TMCO6-212ENST00000514449 DISP1Q96F81 1524 aa41.61■■■■■ 4.25
TMCO6-212ENST00000514449 KIF21BO75037 1637 aa41.56■■■■■ 4.24
TMCO6-212ENST00000514449 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
TMCO6-212ENST00000514449 GOLGA3Q08378 1498 aa41.55■■■■■ 4.24
TMCO6-212ENST00000514449 KIAA0556O60303 1618 aa41.54■■■■■ 4.24
TMCO6-212ENST00000514449 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
TMCO6-212ENST00000514449 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
TMCO6-212ENST00000514449 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.45■■■■■ 4.23
TMCO6-212ENST00000514449 UACAQ9BZF9 1416 aa41.34■■■■■ 4.21
TMCO6-212ENST00000514449 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.31■■■■■ 4.2
TMCO6-212ENST00000514449 MAPKBP1O60336 1514 aa41.26■■■■■ 4.2
TMCO6-212ENST00000514449 ABCC2Q92887 1545 aa41.25■■■■■ 4.19
TMCO6-212ENST00000514449 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
TMCO6-212ENST00000514449 SAMD9Q5K651 1589 aa41.23■■■■■ 4.19
TMCO6-212ENST00000514449 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.18■■■■■ 4.18
TMCO6-212ENST00000514449 P3H3Q8IVL6 736 aa41.17■■■■■ 4.18
TMCO6-212ENST00000514449 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
TMCO6-212ENST00000514449 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.1■■■■■ 4.17
TMCO6-212ENST00000514449 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.08■■■■■ 4.17
TMCO6-212ENST00000514449 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.08■■■■■ 4.17
TMCO6-212ENST00000514449 ABCA8O94911 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
TMCO6-212ENST00000514449 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.07■■■■■ 4.16
TMCO6-212ENST00000514449 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.04■■■■■ 4.16
TMCO6-212ENST00000514449 FAM69CQ0P6D2 419 aa41■■■■■ 4.15
TMCO6-212ENST00000514449 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
TMCO6-212ENST00000514449 ASXL2Q76L83 1435 aa40.98■■■■■ 4.15
TMCO6-212ENST00000514449 DIP2BQ9P265 1576 aa40.98■■■■■ 4.15
TMCO6-212ENST00000514449 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.95■■■■■ 4.15
TMCO6-212ENST00000514449 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.88■■■■■ 4.13
TMCO6-212ENST00000514449 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.79■■■■■ 4.12
TMCO6-212ENST00000514449 GLI2P10070 1586 aa40.78■■■■■ 4.12
TMCO6-212ENST00000514449 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.77■■■■■ 4.12
TMCO6-212ENST00000514449 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
TMCO6-212ENST00000514449 ATP10BO94823 1461 aa40.74■■■■■ 4.11
TMCO6-212ENST00000514449 FMN1Q68DA7 1419 aa40.72■■■■■ 4.11
TMCO6-212ENST00000514449 ARID3CA6NKF2 412 aa40.7■■■■■ 4.11
TMCO6-212ENST00000514449 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
TMCO6-212ENST00000514449 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
TMCO6-212ENST00000514449 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
TMCO6-212ENST00000514449 TSPOAP1O95153 1857 aa40.64■■■■■ 4.1
TMCO6-212ENST00000514449 KCNH8Q96L42 1107 aa40.58■■■■■ 4.09
TMCO6-212ENST00000514449 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.56■■■■■ 4.08
TMCO6-212ENST00000514449 CLIP1P30622 1438 aa40.56■■■■■ 4.08
TMCO6-212ENST00000514449 HECW1Q76N89 1606 aa40.52■■■■■ 4.08
TMCO6-212ENST00000514449 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
TMCO6-212ENST00000514449 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.48■■■■■ 4.07
TMCO6-212ENST00000514449 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.47■■■■■ 4.07
TMCO6-212ENST00000514449 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.46■■■■■ 4.07
TMCO6-212ENST00000514449 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
TMCO6-212ENST00000514449 CD109Q6YHK3 1445 aa40.42■■■■■ 4.06
TMCO6-212ENST00000514449 KDM6BO15054 1643 aa40.39■■■■■ 4.06
TMCO6-212ENST00000514449 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
TMCO6-212ENST00000514449 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.35■■■■■ 4.05
TMCO6-212ENST00000514449 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.34■■■■■ 4.05
TMCO6-212ENST00000514449 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.34■■■■■ 4.05
TMCO6-212ENST00000514449 CEP162Q5TB80 1403 aa40.33■■■■■ 4.05
TMCO6-212ENST00000514449 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
TMCO6-212ENST00000514449 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.32■■■■■ 4.05
TMCO6-212ENST00000514449 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
TMCO6-212ENST00000514449 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.26■■■■■ 4.04
TMCO6-212ENST00000514449 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.25■■■■■ 4.03
TMCO6-212ENST00000514449 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.19■■■■■ 4.02
TMCO6-212ENST00000514449 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
TMCO6-212ENST00000514449 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.11■■■■■ 4.01
TMCO6-212ENST00000514449 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
TMCO6-212ENST00000514449 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
TMCO6-212ENST00000514449 NEO1Q92859 1461 aa40.06■■■■■ 4
TMCO6-212ENST00000514449 KIF14Q15058 1648 aa40.05■■■■■ 4
TMCO6-212ENST00000514449 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.05■■■■■ 4
TMCO6-212ENST00000514449 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40■■■■□ 3.99
TMCO6-212ENST00000514449 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.98■■■■□ 3.99
TMCO6-212ENST00000514449 FANCAO15360 1455 aa39.93■■■■□ 3.98
TMCO6-212ENST00000514449 PLCH2O75038 1416 aa39.92■■■■□ 3.98
TMCO6-212ENST00000514449 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.91■■■■□ 3.98
TMCO6-212ENST00000514449 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.88■■■■□ 3.97
TMCO6-212ENST00000514449 AKNAQ7Z591 1439 aa39.86■■■■□ 3.97
TMCO6-212ENST00000514449 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.82■■■■□ 3.97
TMCO6-212ENST00000514449 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.82■■■■□ 3.96
TMCO6-212ENST00000514449 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
TMCO6-212ENST00000514449 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.75■■■■□ 3.95
TMCO6-212ENST00000514449 RAPGEF3O95398 923 aa39.74■■■■□ 3.95
TMCO6-212ENST00000514449 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.71■■■■□ 3.95
TMCO6-212ENST00000514449 ADGRL1O94910 1474 aa39.71■■■■□ 3.95
TMCO6-212ENST00000514449 PREX2Q70Z35 1606 aa39.7■■■■□ 3.95
TMCO6-212ENST00000514449 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms