RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514449.5

TMCO6-212, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 6, humanhuman

TSL 5

Gene TMCO6, Length 760 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6-212ENST00000514449 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.92■■■■■ 7.34
TMCO6-212ENST00000514449 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.25■■■■■ 6.27
TMCO6-212ENST00000514449 ABCC9O60706 1549 aa53.07■■■■■ 6.09
TMCO6-212ENST00000514449 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.11■■■■■ 5.77
TMCO6-212ENST00000514449 NACADO15069 1562 aa51.02■■■■■ 5.76
TMCO6-212ENST00000514449 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.96■■■■■ 5.75
TMCO6-212ENST00000514449 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.71■■■■■ 5.71
TMCO6-212ENST00000514449 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.7■■■■■ 5.71
TMCO6-212ENST00000514449 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.44■■■■■ 5.67
TMCO6-212ENST00000514449 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.85■■■■■ 5.57
TMCO6-212ENST00000514449 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.56■■■■■ 5.52
TMCO6-212ENST00000514449 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.45■■■■■ 5.51
TMCO6-212ENST00000514449 SCRIBQ14160 1630 aa49.42■■■■■ 5.5
TMCO6-212ENST00000514449 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.06■■■■■ 5.44
TMCO6-212ENST00000514449 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.68■■■■■ 5.38
TMCO6-212ENST00000514449 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
TMCO6-212ENST00000514449 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.02■■■■■ 5.28
TMCO6-212ENST00000514449 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.72■■■■■ 5.23
TMCO6-212ENST00000514449 SMARCA4P51532 1647 aa47.29■■■■■ 5.16
TMCO6-212ENST00000514449 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.27■■■■■ 5.16
TMCO6-212ENST00000514449 NCAPD3P42695 1498 aa47.05■■■■■ 5.12
TMCO6-212ENST00000514449 SMARCA2P51531 1590 aa47.04■■■■■ 5.12
TMCO6-212ENST00000514449 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.04■■■■■ 5.12
TMCO6-212ENST00000514449 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.9■■■■■ 5.1
TMCO6-212ENST00000514449 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.84■■■■■ 5.09
TMCO6-212ENST00000514449 HMGXB3Q12766 1538 aa46.82■■■■■ 5.09
TMCO6-212ENST00000514449 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.06
TMCO6-212ENST00000514449 WIZO95785 1651 aa46.41■■■■■ 5.02
TMCO6-212ENST00000514449 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
TMCO6-212ENST00000514449 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
TMCO6-212ENST00000514449 NESP48681 1621 aa45.86■■■■■ 4.93
TMCO6-212ENST00000514449 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.85■■■■■ 4.93
TMCO6-212ENST00000514449 ERCC6Q03468 1493 aa45.82■■■■■ 4.93
TMCO6-212ENST00000514449 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.68■■■■■ 4.9
TMCO6-212ENST00000514449 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.57■■■■■ 4.89
TMCO6-212ENST00000514449 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.39■■■■■ 4.86
TMCO6-212ENST00000514449 CFTRP13569 1480 aa45.37■■■■■ 4.85
TMCO6-212ENST00000514449 CUX2O14529 1486 aa45.36■■■■■ 4.85
TMCO6-212ENST00000514449 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.36■■■■■ 4.85
TMCO6-212ENST00000514449 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
TMCO6-212ENST00000514449 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
TMCO6-212ENST00000514449 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.15■■■■■ 4.82
TMCO6-212ENST00000514449 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.12■■■■■ 4.81
TMCO6-212ENST00000514449 PRDM2Q13029 1718 aa45.07■■■■■ 4.81
TMCO6-212ENST00000514449 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.06■■■■■ 4.8
TMCO6-212ENST00000514449 WDR62O43379 1518 aa44.9■■■■■ 4.78
TMCO6-212ENST00000514449 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
TMCO6-212ENST00000514449 ABCC8Q09428 1581 aa44.5■■■■■ 4.71
TMCO6-212ENST00000514449 TOPBP1Q92547 1522 aa44.4■■■■■ 4.7
TMCO6-212ENST00000514449 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.38■■■■■ 4.69
TMCO6-212ENST00000514449 IFT140Q96RY7 1462 aa44.19■■■■■ 4.66
TMCO6-212ENST00000514449 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
TMCO6-212ENST00000514449 CUX1P39880 1505 aa44.01■■■■■ 4.64
TMCO6-212ENST00000514449 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.01■■■■■ 4.64
TMCO6-212ENST00000514449 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
TMCO6-212ENST00000514449 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.9■■■■■ 4.62
TMCO6-212ENST00000514449 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
TMCO6-212ENST00000514449 SOGA1O94964 1423 aa43.88■■■■■ 4.61
TMCO6-212ENST00000514449 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.8■■■■■ 4.6
TMCO6-212ENST00000514449 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
TMCO6-212ENST00000514449 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.76■■■■■ 4.6
TMCO6-212ENST00000514449 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.67■■■■■ 4.582e-6■■■■□ 24.5
TMCO6-212ENST00000514449 WDR97A6NE52 1622 aa43.66■■■■■ 4.58
TMCO6-212ENST00000514449 TOP2BQ02880 1626 aa43.66■■■■■ 4.58
TMCO6-212ENST00000514449 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.66■■■■■ 4.58
TMCO6-212ENST00000514449 SYNJ1O43426 1573 aa43.59■■■■■ 4.57
TMCO6-212ENST00000514449 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
TMCO6-212ENST00000514449 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.5■■■■■ 4.55
TMCO6-212ENST00000514449 OSCARQ8IYS5 282 aa43.49■■■■■ 4.55
TMCO6-212ENST00000514449 GRIN2BQ13224 1484 aa43.38■■■■■ 4.54
TMCO6-212ENST00000514449 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.36■■■■■ 4.53
TMCO6-212ENST00000514449 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.31■■■■■ 4.52
TMCO6-212ENST00000514449 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.29■■■■■ 4.52
TMCO6-212ENST00000514449 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
TMCO6-212ENST00000514449 PBRM1Q86U86 1689 aa43.27■■■■■ 4.52
TMCO6-212ENST00000514449 CHD1O14646 1710 aa43.24■■■■■ 4.51
TMCO6-212ENST00000514449 FBLN2P98095 1184 aa43.23■■■■■ 4.51
TMCO6-212ENST00000514449 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
TMCO6-212ENST00000514449 SYNJ2O15056 1496 aa43.1■■■■■ 4.49
TMCO6-212ENST00000514449 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43■■■■■ 4.47
TMCO6-212ENST00000514449 ADAMTS12P58397 1594 aa42.9■■■■■ 4.46
TMCO6-212ENST00000514449 KIF27Q86VH2 1401 aa42.88■■■■■ 4.46
TMCO6-212ENST00000514449 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.88■■■■■ 4.45
TMCO6-212ENST00000514449 GRIN2AQ12879 1464 aa42.8■■■■■ 4.44
TMCO6-212ENST00000514449 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.76■■■■■ 4.44
TMCO6-212ENST00000514449 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
TMCO6-212ENST00000514449 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
TMCO6-212ENST00000514449 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
TMCO6-212ENST00000514449 ARHGEF11O15085 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
TMCO6-212ENST00000514449 TRIM41Q8WV44 630 aa42.71■■■■■ 4.43
TMCO6-212ENST00000514449 IGF1RP08069 1367 aa42.65■■■■■ 4.42
TMCO6-212ENST00000514449 CUL7Q14999 1698 aa42.62■■■■■ 4.41
TMCO6-212ENST00000514449 NUP160Q12769 1436 aa42.6■■■■■ 4.41
TMCO6-212ENST00000514449 CEP170Q5SW79 1584 aa42.55■■■■■ 4.4
TMCO6-212ENST00000514449 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.44■■■■■ 4.38
TMCO6-212ENST00000514449 ARAP1Q96P48 1450 aa42.35■■■■■ 4.37
TMCO6-212ENST00000514449 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.35■■■■■ 4.37
TMCO6-212ENST00000514449 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.34■■■■■ 4.37
TMCO6-212ENST00000514449 SHROOM2Q13796 1616 aa42.28■■■■■ 4.36
TMCO6-212ENST00000514449 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.2■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122 ms