RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 IGF1RP08069 1367 aa42.27■■■■■ 4.36
SIMC1-211ENST00000514128 JPH4Q96JJ6 628 aa42.23■■■■■ 4.35
SIMC1-211ENST00000514128 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.11■■■■■ 4.33
SIMC1-211ENST00000514128 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.05■■■■■ 4.32
SIMC1-211ENST00000514128 IQGAP2Q13576 1575 aa41.83■■■■■ 4.29
SIMC1-211ENST00000514128 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.81■■■■■ 4.28
SIMC1-211ENST00000514128 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.8■■■■■ 4.28
SIMC1-211ENST00000514128 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
SIMC1-211ENST00000514128 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.75■■■■■ 4.27
SIMC1-211ENST00000514128 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.74■■■■■ 4.27
SIMC1-211ENST00000514128 MAPKBP1O60336 1514 aa41.71■■■■■ 4.27
SIMC1-211ENST00000514128 PTPRGP23470 1445 aa41.67■■■■■ 4.26
SIMC1-211ENST00000514128 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.63■■■■■ 4.25
SIMC1-211ENST00000514128 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.6■■■■■ 4.25
SIMC1-211ENST00000514128 DIP2BQ9P265 1576 aa41.56■■■■■ 4.24
SIMC1-211ENST00000514128 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.52■■■■■ 4.24
SIMC1-211ENST00000514128 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.52■■■■■ 4.24
SIMC1-211ENST00000514128 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.52■■■■■ 4.24
SIMC1-211ENST00000514128 DISP1Q96F81 1524 aa41.51■■■■■ 4.24
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC2Q92887 1545 aa41.44■■■■■ 4.23
SIMC1-211ENST00000514128 KIAA0556O60303 1618 aa41.44■■■■■ 4.22
SIMC1-211ENST00000514128 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.38■■■■■ 4.21
SIMC1-211ENST00000514128 UACAQ9BZF9 1416 aa41.36■■■■■ 4.21
SIMC1-211ENST00000514128 PRXQ9BXM0 1461 aa41.34■■■■■ 4.21
SIMC1-211ENST00000514128 TSPOAP1O95153 1857 aa41.32■■■■■ 4.2
SIMC1-211ENST00000514128 GOLGA3Q08378 1498 aa41.26■■■■■ 4.2
SIMC1-211ENST00000514128 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.26■■■■■ 4.2
SIMC1-211ENST00000514128 ASXL2Q76L83 1435 aa41.26■■■■■ 4.19
SIMC1-211ENST00000514128 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.18■■■■■ 4.18
SIMC1-211ENST00000514128 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
SIMC1-211ENST00000514128 KDM6BO15054 1643 aa41.17■■■■■ 4.18
SIMC1-211ENST00000514128 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
SIMC1-211ENST00000514128 GLI2P10070 1586 aa41.12■■■■■ 4.17
SIMC1-211ENST00000514128 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.06■■■■■ 4.16
SIMC1-211ENST00000514128 EEA1Q15075 1411 aa41.05■■■■■ 4.16
SIMC1-211ENST00000514128 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SIMC1-211ENST00000514128 ABCA8O94911 1581 aa40.99■■■■■ 4.15
SIMC1-211ENST00000514128 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
SIMC1-211ENST00000514128 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.94■■■■■ 4.14
SIMC1-211ENST00000514128 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.93■■■■■ 4.14
SIMC1-211ENST00000514128 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
SIMC1-211ENST00000514128 SAMD9Q5K651 1589 aa40.85■■■■■ 4.13
SIMC1-211ENST00000514128 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.84■■■■■ 4.13
SIMC1-211ENST00000514128 P3H3Q8IVL6 736 aa40.81■■■■■ 4.12
SIMC1-211ENST00000514128 KIF21BO75037 1637 aa40.73■■■■■ 4.11
SIMC1-211ENST00000514128 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.72■■■■■ 4.11
SIMC1-211ENST00000514128 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.67■■■■■ 4.1
SIMC1-211ENST00000514128 KCNH8Q96L42 1107 aa40.65■■■■■ 4.1
SIMC1-211ENST00000514128 ARID3CA6NKF2 412 aa40.63■■■■■ 4.09
SIMC1-211ENST00000514128 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
SIMC1-211ENST00000514128 CD109Q6YHK3 1445 aa40.62■■■■■ 4.09
SIMC1-211ENST00000514128 ATP10BO94823 1461 aa40.6■■■■■ 4.09
SIMC1-211ENST00000514128 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.58■■■■■ 4.09
SIMC1-211ENST00000514128 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
SIMC1-211ENST00000514128 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.55■■■■■ 4.08
SIMC1-211ENST00000514128 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.54■■■■■ 4.08
SIMC1-211ENST00000514128 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.5■■■■■ 4.07
SIMC1-211ENST00000514128 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
SIMC1-211ENST00000514128 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
SIMC1-211ENST00000514128 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
SIMC1-211ENST00000514128 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.43■■■■■ 4.06
SIMC1-211ENST00000514128 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.42■■■■■ 4.06
SIMC1-211ENST00000514128 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
SIMC1-211ENST00000514128 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.35■■■■■ 4.05
SIMC1-211ENST00000514128 ADGRL1O94910 1474 aa40.33■■■■■ 4.05
SIMC1-211ENST00000514128 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.25■■■■■ 4.03
SIMC1-211ENST00000514128 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.21■■■■■ 4.03
SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.19■■■■■ 4.02
SIMC1-211ENST00000514128 NEO1Q92859 1461 aa40.17■■■■■ 4.02
SIMC1-211ENST00000514128 FMN1Q68DA7 1419 aa40.15■■■■■ 4.02
SIMC1-211ENST00000514128 HECW1Q76N89 1606 aa40.12■■■■■ 4.01
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.12■■■■■ 4.01
SIMC1-211ENST00000514128 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
SIMC1-211ENST00000514128 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.06■■■■■ 4
SIMC1-211ENST00000514128 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
SIMC1-211ENST00000514128 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.02■■■■■ 4
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SIMC1-211ENST00000514128 FANCAO15360 1455 aa39.96■■■■□ 3.99
SIMC1-211ENST00000514128 RAPGEF3O95398 923 aa39.96■■■■□ 3.99
SIMC1-211ENST00000514128 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.96■■■■□ 3.99
SIMC1-211ENST00000514128 AKNAQ7Z591 1439 aa39.89■■■■□ 3.98
SIMC1-211ENST00000514128 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.98
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SIMC1-211ENST00000514128 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
SIMC1-211ENST00000514128 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.82■■■■□ 3.97
SIMC1-211ENST00000514128 KIF14Q15058 1648 aa39.82■■■■□ 3.96
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.81■■■■□ 3.96
SIMC1-211ENST00000514128 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.8■■■■□ 3.96
SIMC1-211ENST00000514128 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
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SIMC1-211ENST00000514128 PLCH2O75038 1416 aa39.75■■■■□ 3.95
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SIMC1-211ENST00000514128 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.73■■■■□ 3.95
SIMC1-211ENST00000514128 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.71■■■■□ 3.95
SIMC1-211ENST00000514128 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.7■■■■□ 3.95
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.7■■■■□ 3.95
SIMC1-211ENST00000514128 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.7■■■■□ 3.95
SIMC1-211ENST00000514128 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
SIMC1-211ENST00000514128 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.68■■■■□ 3.94
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