RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.57■■■■■ 7.29
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.34■■■■■ 6.29
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC9O60706 1549 aa53.9■■■■■ 6.22
SIMC1-211ENST00000514128 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.53■■■■■ 5.84
SIMC1-211ENST00000514128 NACADO15069 1562 aa51.23■■■■■ 5.79
SIMC1-211ENST00000514128 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.96■■■■■ 5.75
SIMC1-211ENST00000514128 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.6■■■■■ 5.69
SIMC1-211ENST00000514128 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.38■■■■■ 5.66
SIMC1-211ENST00000514128 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.3■■■■■ 5.64
SIMC1-211ENST00000514128 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.16■■■■■ 5.62
SIMC1-211ENST00000514128 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.07■■■■■ 5.61
SIMC1-211ENST00000514128 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.07■■■■■ 5.61
SIMC1-211ENST00000514128 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.92■■■■■ 5.58
SIMC1-211ENST00000514128 SCRIBQ14160 1630 aa49.5■■■■■ 5.51
SIMC1-211ENST00000514128 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.39■■■■■ 5.5
SIMC1-211ENST00000514128 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.74■■■■■ 5.39
SIMC1-211ENST00000514128 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
SIMC1-211ENST00000514128 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.54■■■■■ 5.36
SIMC1-211ENST00000514128 SMARCA4P51532 1647 aa47.24■■■■■ 5.15
SIMC1-211ENST00000514128 NCAPD3P42695 1498 aa47.21■■■■■ 5.15
SIMC1-211ENST00000514128 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.13■■■■■ 5.13
SIMC1-211ENST00000514128 SMARCA2P51531 1590 aa47.11■■■■■ 5.13
SIMC1-211ENST00000514128 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.07■■■■■ 5.12
SIMC1-211ENST00000514128 HMGXB3Q12766 1538 aa46.99■■■■■ 5.11
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SIMC1-211ENST00000514128 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.75■■■■■ 5.07
SIMC1-211ENST00000514128 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.65■■■■■ 5.06
SIMC1-211ENST00000514128 ERCC6Q03468 1493 aa46.61■■■■■ 5.05
SIMC1-211ENST00000514128 CUX2O14529 1486 aa46.37■■■■■ 5.01
SIMC1-211ENST00000514128 NESP48681 1621 aa46.36■■■■■ 5.01
SIMC1-211ENST00000514128 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.2■■■■■ 4.99
SIMC1-211ENST00000514128 WIZO95785 1651 aa46.17■■■■■ 4.98
SIMC1-211ENST00000514128 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
SIMC1-211ENST00000514128 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.9■■■■■ 4.94
SIMC1-211ENST00000514128 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.88■■■■■ 4.94
SIMC1-211ENST00000514128 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.82■■■■■ 4.93
SIMC1-211ENST00000514128 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.8■■■■■ 4.92
SIMC1-211ENST00000514128 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.78■■■■■ 4.92
SIMC1-211ENST00000514128 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
SIMC1-211ENST00000514128 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.49■■■■■ 4.87
SIMC1-211ENST00000514128 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.39■■■■■ 4.86
SIMC1-211ENST00000514128 WDR62O43379 1518 aa45.36■■■■■ 4.85
SIMC1-211ENST00000514128 CFTRP13569 1480 aa45.36■■■■■ 4.85
SIMC1-211ENST00000514128 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.33■■■■■ 4.85
SIMC1-211ENST00000514128 PRDM2Q13029 1718 aa45.13■■■■■ 4.82
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.03■■■■■ 4.8
SIMC1-211ENST00000514128 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
SIMC1-211ENST00000514128 TOPBP1Q92547 1522 aa44.5■■■■■ 4.71
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC8Q09428 1581 aa44.48■■■■■ 4.71
SIMC1-211ENST00000514128 IFT140Q96RY7 1462 aa44.44■■■■■ 4.7
SIMC1-211ENST00000514128 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.42■■■■■ 4.7
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
SIMC1-211ENST00000514128 OSCARQ8IYS5 282 aa44.22■■■■■ 4.67
SIMC1-211ENST00000514128 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
SIMC1-211ENST00000514128 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
SIMC1-211ENST00000514128 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
SIMC1-211ENST00000514128 TRIM41Q8WV44 630 aa44.04■■■■■ 4.64
SIMC1-211ENST00000514128 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
SIMC1-211ENST00000514128 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.91■■■■■ 4.62
SIMC1-211ENST00000514128 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.86■■■■■ 4.61
SIMC1-211ENST00000514128 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.85■■■■■ 4.61
SIMC1-211ENST00000514128 CUX1P39880 1505 aa43.84■■■■■ 4.61
SIMC1-211ENST00000514128 SOGA1O94964 1423 aa43.84■■■■■ 4.61
SIMC1-211ENST00000514128 CHD1O14646 1710 aa43.79■■■■■ 4.6
SIMC1-211ENST00000514128 WDR97A6NE52 1622 aa43.75■■■■■ 4.59
SIMC1-211ENST00000514128 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
SIMC1-211ENST00000514128 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
SIMC1-211ENST00000514128 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
SIMC1-211ENST00000514128 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.59
SIMC1-211ENST00000514128 FBLN2P98095 1184 aa43.6■■■■■ 4.57
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF11O15085 1522 aa43.58■■■■■ 4.57
SIMC1-211ENST00000514128 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.55■■■■■ 4.56
SIMC1-211ENST00000514128 GRIN2BQ13224 1484 aa43.47■■■■■ 4.55
SIMC1-211ENST00000514128 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
SIMC1-211ENST00000514128 PBRM1Q86U86 1689 aa43.42■■■■■ 4.54
SIMC1-211ENST00000514128 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.37■■■■■ 4.53
SIMC1-211ENST00000514128 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.36■■■■■ 4.53
SIMC1-211ENST00000514128 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
SIMC1-211ENST00000514128 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.32■■■■■ 4.53
SIMC1-211ENST00000514128 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.3■■■■■ 4.52
SIMC1-211ENST00000514128 SYNJ1O43426 1573 aa43.3■■■■■ 4.52
SIMC1-211ENST00000514128 SYNJ2O15056 1496 aa43.3■■■■■ 4.52
SIMC1-211ENST00000514128 TOP2BQ02880 1626 aa43.28■■■■■ 4.52
SIMC1-211ENST00000514128 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.27■■■■■ 4.52
SIMC1-211ENST00000514128 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.22■■■■■ 4.51
SIMC1-211ENST00000514128 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.16■■■■■ 4.5
SIMC1-211ENST00000514128 ARAP1Q96P48 1450 aa43.14■■■■■ 4.5
SIMC1-211ENST00000514128 ADAMTS12P58397 1594 aa42.99■■■■■ 4.47
SIMC1-211ENST00000514128 GRIN2AQ12879 1464 aa42.92■■■■■ 4.46
SIMC1-211ENST00000514128 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.86■■■■■ 4.45
SIMC1-211ENST00000514128 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.81■■■■■ 4.44
SIMC1-211ENST00000514128 CEP170Q5SW79 1584 aa42.74■■■■■ 4.43
SIMC1-211ENST00000514128 NUP160Q12769 1436 aa42.72■■■■■ 4.43
SIMC1-211ENST00000514128 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
SIMC1-211ENST00000514128 SHROOM2Q13796 1616 aa42.55■■■■■ 4.4
SIMC1-211ENST00000514128 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.52■■■■■ 4.4
SIMC1-211ENST00000514128 KIF27Q86VH2 1401 aa42.44■■■■■ 4.38
SIMC1-211ENST00000514128 CUL7Q14999 1698 aa42.38■■■■■ 4.37
SIMC1-211ENST00000514128 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.37■■■■■ 4.37
SIMC1-211ENST00000514128 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
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