RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508769.1

SIMC1-210, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIMC1, Length 461 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-210ENST00000508769 CUL7Q14999 1698 aa40.5■■■■■ 4.07
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SIMC1-210ENST00000508769 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.28■■■■■ 4.04
SIMC1-210ENST00000508769 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.13■■■■■ 4.01
SIMC1-210ENST00000508769 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.13■■■■■ 4.01
SIMC1-210ENST00000508769 IQGAP2Q13576 1575 aa40.02■■■■■ 4
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SIMC1-210ENST00000508769 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.83■■■■□ 3.97
SIMC1-210ENST00000508769 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.83■■■■□ 3.97
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SIMC1-210ENST00000508769 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.73■■■■□ 3.95
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SIMC1-210ENST00000508769 PRXQ9BXM0 1461 aa39.65■■■■□ 3.94
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SIMC1-210ENST00000508769 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
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SIMC1-210ENST00000508769 EEA1Q15075 1411 aa39.15■■■■□ 3.86
SIMC1-210ENST00000508769 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
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SIMC1-210ENST00000508769 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
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SIMC1-210ENST00000508769 ATP10BO94823 1461 aa38.96■■■■□ 3.83
SIMC1-210ENST00000508769 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.96■■■■□ 3.83
SIMC1-210ENST00000508769 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.94■■■■□ 3.82
SIMC1-210ENST00000508769 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.93■■■■□ 3.82
SIMC1-210ENST00000508769 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.91■■■■□ 3.82
SIMC1-210ENST00000508769 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.9■■■■□ 3.82
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SIMC1-210ENST00000508769 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.53■■■■□ 3.76
SIMC1-210ENST00000508769 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.5■■■■□ 3.75
SIMC1-210ENST00000508769 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.4■■■■□ 3.74
SIMC1-210ENST00000508769 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.74
SIMC1-210ENST00000508769 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.4■■■■□ 3.74
SIMC1-210ENST00000508769 NEO1Q92859 1461 aa38.4■■■■□ 3.74
SIMC1-210ENST00000508769 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.4■■■■□ 3.74
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SIMC1-210ENST00000508769 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.33■■■■□ 3.73
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SIMC1-210ENST00000508769 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.99■■■■□ 3.67
SIMC1-210ENST00000508769 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.97■■■■□ 3.67
SIMC1-210ENST00000508769 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
SIMC1-210ENST00000508769 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.95■■■■□ 3.67
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