RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508769.1

SIMC1-210, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIMC1, Length 461 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-210ENST00000508769 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.08■■■■■ 6.89
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SIMC1-210ENST00000508769 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.28■■■■■ 5.48
SIMC1-210ENST00000508769 NACADO15069 1562 aa49.01■■■■■ 5.44
SIMC1-210ENST00000508769 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.83■■■■■ 5.41
SIMC1-210ENST00000508769 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.41■■■■■ 5.34
SIMC1-210ENST00000508769 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.39■■■■■ 5.34
SIMC1-210ENST00000508769 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.31■■■■■ 5.32
SIMC1-210ENST00000508769 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
SIMC1-210ENST00000508769 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.21■■■■■ 5.31
SIMC1-210ENST00000508769 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.99■■■■■ 5.27
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SIMC1-210ENST00000508769 SCRIBQ14160 1630 aa47.49■■■■■ 5.19
SIMC1-210ENST00000508769 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.14■■■■■ 5.14
SIMC1-210ENST00000508769 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.76■■■■■ 5.08
SIMC1-210ENST00000508769 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
SIMC1-210ENST00000508769 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
SIMC1-210ENST00000508769 SMARCA4P51532 1647 aa45.3■■■■■ 4.84
SIMC1-210ENST00000508769 NCAPD3P42695 1498 aa45.24■■■■■ 4.83
SIMC1-210ENST00000508769 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
SIMC1-210ENST00000508769 SMARCA2P51531 1590 aa45.04■■■■■ 4.8
SIMC1-210ENST00000508769 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
SIMC1-210ENST00000508769 HMGXB3Q12766 1538 aa44.97■■■■■ 4.79
SIMC1-210ENST00000508769 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.84■■■■■ 4.77
SIMC1-210ENST00000508769 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.79■■■■■ 4.76
SIMC1-210ENST00000508769 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
SIMC1-210ENST00000508769 NESP48681 1621 aa44.6■■■■■ 4.73
SIMC1-210ENST00000508769 ERCC6Q03468 1493 aa44.56■■■■■ 4.72
SIMC1-210ENST00000508769 WIZO95785 1651 aa44.35■■■■■ 4.69
SIMC1-210ENST00000508769 CUX2O14529 1486 aa44.34■■■■■ 4.69
SIMC1-210ENST00000508769 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.19■■■■■ 4.66
SIMC1-210ENST00000508769 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
SIMC1-210ENST00000508769 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.06■■■■■ 4.64
SIMC1-210ENST00000508769 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
SIMC1-210ENST00000508769 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.96■■■■■ 4.63
SIMC1-210ENST00000508769 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.88■■■■■ 4.61
SIMC1-210ENST00000508769 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.85■■■■■ 4.61
SIMC1-210ENST00000508769 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
SIMC1-210ENST00000508769 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.55■■■■■ 4.56
SIMC1-210ENST00000508769 CFTRP13569 1480 aa43.48■■■■■ 4.55
SIMC1-210ENST00000508769 WDR62O43379 1518 aa43.47■■■■■ 4.55
SIMC1-210ENST00000508769 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.44■■■■■ 4.54
SIMC1-210ENST00000508769 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.43■■■■■ 4.54
SIMC1-210ENST00000508769 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.23■■■■■ 4.51
SIMC1-210ENST00000508769 PRDM2Q13029 1718 aa43.17■■■■■ 4.5
SIMC1-210ENST00000508769 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
SIMC1-210ENST00000508769 TOPBP1Q92547 1522 aa42.68■■■■■ 4.42
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
SIMC1-210ENST00000508769 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.53■■■■■ 4.4
SIMC1-210ENST00000508769 IFT140Q96RY7 1462 aa42.52■■■■■ 4.4
SIMC1-210ENST00000508769 ABCC8Q09428 1581 aa42.44■■■■■ 4.38
SIMC1-210ENST00000508769 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
SIMC1-210ENST00000508769 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
SIMC1-210ENST00000508769 OSCARQ8IYS5 282 aa42.31■■■■■ 4.36
SIMC1-210ENST00000508769 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
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SIMC1-210ENST00000508769 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.17■■■■■ 4.34
SIMC1-210ENST00000508769 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.15■■■■■ 4.34
SIMC1-210ENST00000508769 CUX1P39880 1505 aa42.1■■■■■ 4.33
SIMC1-210ENST00000508769 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.05■■■■■ 4.32
SIMC1-210ENST00000508769 CHD1O14646 1710 aa42.01■■■■■ 4.32
SIMC1-210ENST00000508769 SOGA1O94964 1423 aa42.01■■■■■ 4.32
SIMC1-210ENST00000508769 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
SIMC1-210ENST00000508769 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.93■■■■■ 4.3
SIMC1-210ENST00000508769 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.93■■■■■ 4.3
SIMC1-210ENST00000508769 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.93■■■■■ 4.3
SIMC1-210ENST00000508769 WDR97A6NE52 1622 aa41.81■■■■■ 4.28
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGEF11O15085 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
SIMC1-210ENST00000508769 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.75■■■■■ 4.27
SIMC1-210ENST00000508769 FBLN2P98095 1184 aa41.74■■■■■ 4.27
SIMC1-210ENST00000508769 PBRM1Q86U86 1689 aa41.61■■■■■ 4.25
SIMC1-210ENST00000508769 GRIN2BQ13224 1484 aa41.6■■■■■ 4.25
SIMC1-210ENST00000508769 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
SIMC1-210ENST00000508769 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.54■■■■■ 4.24
SIMC1-210ENST00000508769 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.54■■■■■ 4.24
SIMC1-210ENST00000508769 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.52■■■■■ 4.24
SIMC1-210ENST00000508769 SYNJ1O43426 1573 aa41.5■■■■■ 4.23
SIMC1-210ENST00000508769 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.49■■■■■ 4.23
SIMC1-210ENST00000508769 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.47■■■■■ 4.23
SIMC1-210ENST00000508769 TOP2BQ02880 1626 aa41.46■■■■■ 4.23
SIMC1-210ENST00000508769 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
SIMC1-210ENST00000508769 SYNJ2O15056 1496 aa41.44■■■■■ 4.22
SIMC1-210ENST00000508769 ARAP1Q96P48 1450 aa41.43■■■■■ 4.22
SIMC1-210ENST00000508769 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
SIMC1-210ENST00000508769 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.39■■■■■ 4.22
SIMC1-210ENST00000508769 ADAMTS12P58397 1594 aa41.2■■■■■ 4.19
SIMC1-210ENST00000508769 GRIN2AQ12879 1464 aa41.11■■■■■ 4.17
SIMC1-210ENST00000508769 CEP170Q5SW79 1584 aa41.03■■■■■ 4.16
SIMC1-210ENST00000508769 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41■■■■■ 4.15
SIMC1-210ENST00000508769 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.98■■■■■ 4.15
SIMC1-210ENST00000508769 NUP160Q12769 1436 aa40.96■■■■■ 4.15
SIMC1-210ENST00000508769 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.95■■■■■ 4.15
SIMC1-210ENST00000508769 SHROOM2Q13796 1616 aa40.79■■■■■ 4.12
SIMC1-210ENST00000508769 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
SIMC1-210ENST00000508769 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.62■■■■■ 4.09
SIMC1-210ENST00000508769 IGF1RP08069 1367 aa40.57■■■■■ 4.08
SIMC1-210ENST00000508769 KIF27Q86VH2 1401 aa40.57■■■■■ 4.08
SIMC1-210ENST00000508769 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
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