RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503586.1

PITX1-203, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-203ENST00000503586 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.2■■■■□ 3.87
PITX1-203ENST00000503586 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.19■■■■□ 3.86
PITX1-203ENST00000503586 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.17■■■■□ 3.86
PITX1-203ENST00000503586 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
PITX1-203ENST00000503586 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.08■■■■□ 3.85
PITX1-203ENST00000503586 PRXQ9BXM0 1461 aa38.98■■■■□ 3.83
PITX1-203ENST00000503586 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.97■■■■□ 3.83
PITX1-203ENST00000503586 EEA1Q15075 1411 aa38.96■■■■□ 3.83
PITX1-203ENST00000503586 IQGAP2Q13576 1575 aa38.95■■■■□ 3.83
PITX1-203ENST00000503586 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
PITX1-203ENST00000503586 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.83■■■■□ 3.81
PITX1-203ENST00000503586 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.77■■■■□ 3.8
PITX1-203ENST00000503586 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
PITX1-203ENST00000503586 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.72■■■■□ 3.79
PITX1-203ENST00000503586 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
PITX1-203ENST00000503586 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.7■■■■□ 3.78
PITX1-203ENST00000503586 PTPRGP23470 1445 aa38.69■■■■□ 3.78
PITX1-203ENST00000503586 DISP1Q96F81 1524 aa38.68■■■■□ 3.78
PITX1-203ENST00000503586 KIAA0556O60303 1618 aa38.58■■■■□ 3.77
PITX1-203ENST00000503586 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.56■■■■□ 3.76
PITX1-203ENST00000503586 GOLGA3Q08378 1498 aa38.54■■■■□ 3.76
PITX1-203ENST00000503586 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.54■■■■□ 3.76
PITX1-203ENST00000503586 KIF21BO75037 1637 aa38.53■■■■□ 3.76
PITX1-203ENST00000503586 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.42■■■■□ 3.74
PITX1-203ENST00000503586 UACAQ9BZF9 1416 aa38.41■■■■□ 3.74
PITX1-203ENST00000503586 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
PITX1-203ENST00000503586 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.35■■■■□ 3.73
PITX1-203ENST00000503586 P3H3Q8IVL6 736 aa38.34■■■■□ 3.73
PITX1-203ENST00000503586 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
PITX1-203ENST00000503586 ABCC2Q92887 1545 aa38.33■■■■□ 3.73
PITX1-203ENST00000503586 MAPKBP1O60336 1514 aa38.32■■■■□ 3.72
PITX1-203ENST00000503586 SAMD9Q5K651 1589 aa38.26■■■■□ 3.72
PITX1-203ENST00000503586 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.23■■■■□ 3.71
PITX1-203ENST00000503586 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.18■■■■□ 3.7
PITX1-203ENST00000503586 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.17■■■■□ 3.7
PITX1-203ENST00000503586 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.17■■■■□ 3.7
PITX1-203ENST00000503586 ABCA8O94911 1581 aa38.15■■■■□ 3.7
PITX1-203ENST00000503586 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.14■■■■□ 3.7
PITX1-203ENST00000503586 ASXL2Q76L83 1435 aa38.12■■■■□ 3.69
PITX1-203ENST00000503586 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.1■■■■□ 3.69
PITX1-203ENST00000503586 DIP2BQ9P265 1576 aa38.1■■■■□ 3.69
PITX1-203ENST00000503586 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
PITX1-203ENST00000503586 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.09■■■■□ 3.69
PITX1-203ENST00000503586 ARID3CA6NKF2 412 aa37.96■■■■□ 3.67
PITX1-203ENST00000503586 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.95■■■■□ 3.67
PITX1-203ENST00000503586 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.9■■■■□ 3.66
PITX1-203ENST00000503586 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.89■■■■□ 3.66
PITX1-203ENST00000503586 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
PITX1-203ENST00000503586 ATP10BO94823 1461 aa37.86■■■■□ 3.65
PITX1-203ENST00000503586 GLI2P10070 1586 aa37.85■■■■□ 3.65
PITX1-203ENST00000503586 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
PITX1-203ENST00000503586 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
PITX1-203ENST00000503586 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
PITX1-203ENST00000503586 TSPOAP1O95153 1857 aa37.8■■■■□ 3.64
PITX1-203ENST00000503586 KCNH8Q96L42 1107 aa37.79■■■■□ 3.64
PITX1-203ENST00000503586 FMN1Q68DA7 1419 aa37.78■■■■□ 3.64
PITX1-203ENST00000503586 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
PITX1-203ENST00000503586 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.67■■■■□ 3.62
PITX1-203ENST00000503586 CLIP1P30622 1438 aa37.66■■■■□ 3.62
PITX1-203ENST00000503586 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
PITX1-203ENST00000503586 HECW1Q76N89 1606 aa37.59■■■■□ 3.61
PITX1-203ENST00000503586 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.59■■■■□ 3.61
PITX1-203ENST00000503586 CD109Q6YHK3 1445 aa37.59■■■■□ 3.61
PITX1-203ENST00000503586 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.57■■■■□ 3.6
PITX1-203ENST00000503586 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.56■■■■□ 3.6
PITX1-203ENST00000503586 KDM6BO15054 1643 aa37.55■■■■□ 3.6
PITX1-203ENST00000503586 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
PITX1-203ENST00000503586 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.51■■■■□ 3.6
PITX1-203ENST00000503586 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.47■■■■□ 3.59
PITX1-203ENST00000503586 CEP162Q5TB80 1403 aa37.45■■■■□ 3.59
PITX1-203ENST00000503586 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.45■■■■□ 3.59
PITX1-203ENST00000503586 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.44■■■■□ 3.58
PITX1-203ENST00000503586 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
PITX1-203ENST00000503586 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
PITX1-203ENST00000503586 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.35■■■■□ 3.57
PITX1-203ENST00000503586 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.33■■■■□ 3.57
PITX1-203ENST00000503586 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.32■■■■□ 3.56
PITX1-203ENST00000503586 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
PITX1-203ENST00000503586 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
PITX1-203ENST00000503586 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
PITX1-203ENST00000503586 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.23■■■■□ 3.55
PITX1-203ENST00000503586 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.2■■■■□ 3.55
PITX1-203ENST00000503586 NEO1Q92859 1461 aa37.19■■■■□ 3.54
PITX1-203ENST00000503586 KIF14Q15058 1648 aa37.17■■■■□ 3.54
PITX1-203ENST00000503586 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.15■■■■□ 3.54
PITX1-203ENST00000503586 FANCAO15360 1455 aa37.11■■■■□ 3.53
PITX1-203ENST00000503586 PLCH2O75038 1416 aa37.08■■■■□ 3.53
PITX1-203ENST00000503586 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.07■■■■□ 3.52
PITX1-203ENST00000503586 AKNAQ7Z591 1439 aa37.05■■■■□ 3.52
PITX1-203ENST00000503586 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.02■■■■□ 3.52
PITX1-203ENST00000503586 RAPGEF3O95398 923 aa37.01■■■■□ 3.52
PITX1-203ENST00000503586 VPS8Q8N3P4 1428 aa37■■■■□ 3.51
PITX1-203ENST00000503586 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.99■■■■□ 3.51
PITX1-203ENST00000503586 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.98■■■■□ 3.51
PITX1-203ENST00000503586 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
PITX1-203ENST00000503586 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.94■■■■□ 3.5
PITX1-203ENST00000503586 ADGRL1O94910 1474 aa36.91■■■■□ 3.5
PITX1-203ENST00000503586 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
PITX1-203ENST00000503586 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.87■■■■□ 3.49
PITX1-203ENST00000503586 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms