RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503586.1

PITX1-203, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-203ENST00000503586 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.57■■■■■ 6.65
PITX1-203ENST00000503586 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.3■■■■■ 5.64
PITX1-203ENST00000503586 ABCC9O60706 1549 aa49.42■■■■■ 5.5
PITX1-203ENST00000503586 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.47■■■■■ 5.19
PITX1-203ENST00000503586 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.45■■■■■ 5.19
PITX1-203ENST00000503586 NACADO15069 1562 aa47.35■■■■■ 5.17
PITX1-203ENST00000503586 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
PITX1-203ENST00000503586 MYO15BQ96JP2 1530 aa47■■■■■ 5.11
PITX1-203ENST00000503586 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.76■■■■■ 5.08
PITX1-203ENST00000503586 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.31■■■■■ 5
PITX1-203ENST00000503586 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.19■■■■■ 4.98
PITX1-203ENST00000503586 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.97■■■■■ 4.95
PITX1-203ENST00000503586 SCRIBQ14160 1630 aa45.96■■■■■ 4.95
PITX1-203ENST00000503586 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.49■■■■■ 4.87
PITX1-203ENST00000503586 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.43■■■■■ 4.86
PITX1-203ENST00000503586 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
PITX1-203ENST00000503586 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.65■■■■■ 4.74
PITX1-203ENST00000503586 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.4■■■■■ 4.7
PITX1-203ENST00000503586 SMARCA4P51532 1647 aa43.91■■■■■ 4.62
PITX1-203ENST00000503586 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
PITX1-203ENST00000503586 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.72■■■■■ 4.59
PITX1-203ENST00000503586 NCAPD3P42695 1498 aa43.7■■■■■ 4.59
PITX1-203ENST00000503586 SMARCA2P51531 1590 aa43.67■■■■■ 4.58
PITX1-203ENST00000503586 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.6■■■■■ 4.57
PITX1-203ENST00000503586 HMGXB3Q12766 1538 aa43.47■■■■■ 4.55
PITX1-203ENST00000503586 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.45■■■■■ 4.55
PITX1-203ENST00000503586 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
PITX1-203ENST00000503586 WIZO95785 1651 aa43.12■■■■■ 4.49
PITX1-203ENST00000503586 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
PITX1-203ENST00000503586 NESP48681 1621 aa42.71■■■■■ 4.43
PITX1-203ENST00000503586 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
PITX1-203ENST00000503586 ERCC6Q03468 1493 aa42.64■■■■■ 4.42
PITX1-203ENST00000503586 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.56■■■■■ 4.4
PITX1-203ENST00000503586 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.45■■■■■ 4.39
PITX1-203ENST00000503586 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.33■■■■■ 4.37
PITX1-203ENST00000503586 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.17■■■■■ 4.34
PITX1-203ENST00000503586 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.17■■■■■ 4.34
PITX1-203ENST00000503586 CUX2O14529 1486 aa42.16■■■■■ 4.34
PITX1-203ENST00000503586 CFTRP13569 1480 aa42.15■■■■■ 4.34
PITX1-203ENST00000503586 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
PITX1-203ENST00000503586 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
PITX1-203ENST00000503586 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.98■■■■■ 4.31
PITX1-203ENST00000503586 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.93■■■■■ 4.3
PITX1-203ENST00000503586 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.88■■■■■ 4.29
PITX1-203ENST00000503586 PRDM2Q13029 1718 aa41.77■■■■■ 4.28
PITX1-203ENST00000503586 WDR62O43379 1518 aa41.71■■■■■ 4.27
PITX1-203ENST00000503586 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
PITX1-203ENST00000503586 ABCC8Q09428 1581 aa41.27■■■■■ 4.2
PITX1-203ENST00000503586 TOPBP1Q92547 1522 aa41.27■■■■■ 4.2
PITX1-203ENST00000503586 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.2■■■■■ 4.19
PITX1-203ENST00000503586 IFT140Q96RY7 1462 aa41.05■■■■■ 4.16
PITX1-203ENST00000503586 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.02■■■■■ 4.16
PITX1-203ENST00000503586 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
PITX1-203ENST00000503586 CUX1P39880 1505 aa40.91■■■■■ 4.14
PITX1-203ENST00000503586 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
PITX1-203ENST00000503586 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.81■■■■■ 4.12
PITX1-203ENST00000503586 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
PITX1-203ENST00000503586 SOGA1O94964 1423 aa40.77■■■■■ 4.12
PITX1-203ENST00000503586 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.76■■■■■ 4.12
PITX1-203ENST00000503586 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
PITX1-203ENST00000503586 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.65■■■■■ 4.1
PITX1-203ENST00000503586 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.14e-12■■□□□ 14.4
PITX1-203ENST00000503586 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.08
PITX1-203ENST00000503586 TOP2BQ02880 1626 aa40.53■■■■■ 4.08
PITX1-203ENST00000503586 SYNJ1O43426 1573 aa40.51■■■■■ 4.08
PITX1-203ENST00000503586 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.5■■■■■ 4.07
PITX1-203ENST00000503586 WDR97A6NE52 1622 aa40.46■■■■■ 4.07
PITX1-203ENST00000503586 OSCARQ8IYS5 282 aa40.46■■■■■ 4.07
PITX1-203ENST00000503586 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.39■■■■■ 4.06
PITX1-203ENST00000503586 GRIN2BQ13224 1484 aa40.3■■■■■ 4.04
PITX1-203ENST00000503586 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.29■■■■■ 4.04
PITX1-203ENST00000503586 FBLN2P98095 1184 aa40.27■■■■■ 4.04
PITX1-203ENST00000503586 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.26■■■■■ 4.04
PITX1-203ENST00000503586 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.21■■■■■ 4.03
PITX1-203ENST00000503586 CHD1O14646 1710 aa40.19■■■■■ 4.02
PITX1-203ENST00000503586 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
PITX1-203ENST00000503586 PBRM1Q86U86 1689 aa40.17■■■■■ 4.02
PITX1-203ENST00000503586 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
PITX1-203ENST00000503586 SYNJ2O15056 1496 aa40.04■■■■■ 4
PITX1-203ENST00000503586 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.91■■■■□ 3.98
PITX1-203ENST00000503586 ADAMTS12P58397 1594 aa39.86■■■■□ 3.97
PITX1-203ENST00000503586 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.82■■■■□ 3.97
PITX1-203ENST00000503586 KIF27Q86VH2 1401 aa39.82■■■■□ 3.96
PITX1-203ENST00000503586 GRIN2AQ12879 1464 aa39.77■■■■□ 3.96
PITX1-203ENST00000503586 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.76■■■■□ 3.95
PITX1-203ENST00000503586 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.76■■■■□ 3.95
PITX1-203ENST00000503586 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.76■■■■□ 3.95
PITX1-203ENST00000503586 ARHGEF11O15085 1522 aa39.75■■■■□ 3.95
PITX1-203ENST00000503586 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.74■■■■□ 3.95
PITX1-203ENST00000503586 TRIM41Q8WV44 630 aa39.72■■■■□ 3.95
PITX1-203ENST00000503586 IGF1RP08069 1367 aa39.64■■■■□ 3.94
PITX1-203ENST00000503586 NUP160Q12769 1436 aa39.57■■■■□ 3.93
PITX1-203ENST00000503586 CEP170Q5SW79 1584 aa39.55■■■■□ 3.92
PITX1-203ENST00000503586 CUL7Q14999 1698 aa39.52■■■■□ 3.92
PITX1-203ENST00000503586 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.46■■■■□ 3.91
PITX1-203ENST00000503586 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.44■■■■□ 3.9
PITX1-203ENST00000503586 ARAP1Q96P48 1450 aa39.42■■■■□ 3.9
PITX1-203ENST00000503586 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.39■■■■□ 3.9
PITX1-203ENST00000503586 SHROOM2Q13796 1616 aa39.26■■■■□ 3.88
PITX1-203ENST00000503586 JPH4Q96JJ6 628 aa39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms