RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496681.5

FAM208B-210, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM208B, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208B-210ENST00000496681 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
FAM208B-210ENST00000496681 JPH4Q96JJ6 628 aa40.73■■■■■ 4.11
FAM208B-210ENST00000496681 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.67■■■■■ 4.1
FAM208B-210ENST00000496681 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.65■■■■■ 4.1
FAM208B-210ENST00000496681 IQGAP2Q13576 1575 aa40.37■■■■■ 4.05
FAM208B-210ENST00000496681 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.36■■■■■ 4.05
FAM208B-210ENST00000496681 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.33■■■■■ 4.05
FAM208B-210ENST00000496681 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.19■■■■■ 4.02
FAM208B-210ENST00000496681 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.18■■■■■ 4.02
FAM208B-210ENST00000496681 DISP1Q96F81 1524 aa40.17■■■■■ 4.02
FAM208B-210ENST00000496681 MAPKBP1O60336 1514 aa40.16■■■■■ 4.02
FAM208B-210ENST00000496681 PTPRGP23470 1445 aa40.16■■■■■ 4.02
FAM208B-210ENST00000496681 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM208B-210ENST00000496681 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM208B-210ENST00000496681 PRXQ9BXM0 1461 aa40.11■■■■■ 4.01
FAM208B-210ENST00000496681 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.06■■■■■ 4
FAM208B-210ENST00000496681 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.05■■■■■ 4
FAM208B-210ENST00000496681 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.05■■■■■ 4
FAM208B-210ENST00000496681 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
FAM208B-210ENST00000496681 KIAA0556O60303 1618 aa40.02■■■■■ 4
FAM208B-210ENST00000496681 DIP2BQ9P265 1576 aa40.01■■■■■ 4
FAM208B-210ENST00000496681 ABCC2Q92887 1545 aa39.96■■■■□ 3.99
FAM208B-210ENST00000496681 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.93■■■■□ 3.98
FAM208B-210ENST00000496681 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.91■■■■□ 3.98
FAM208B-210ENST00000496681 UACAQ9BZF9 1416 aa39.9■■■■□ 3.98
FAM208B-210ENST00000496681 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.78■■■■□ 3.96
FAM208B-210ENST00000496681 GOLGA3Q08378 1498 aa39.77■■■■□ 3.96
FAM208B-210ENST00000496681 ASXL2Q76L83 1435 aa39.76■■■■□ 3.96
FAM208B-210ENST00000496681 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.75■■■■□ 3.95
FAM208B-210ENST00000496681 EEA1Q15075 1411 aa39.74■■■■□ 3.95
FAM208B-210ENST00000496681 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.7■■■■□ 3.95
FAM208B-210ENST00000496681 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
FAM208B-210ENST00000496681 ABCA8O94911 1581 aa39.63■■■■□ 3.94
FAM208B-210ENST00000496681 TSPOAP1O95153 1857 aa39.63■■■■□ 3.93
FAM208B-210ENST00000496681 GLI2P10070 1586 aa39.63■■■■□ 3.93
FAM208B-210ENST00000496681 SAMD9Q5K651 1589 aa39.55■■■■□ 3.92
FAM208B-210ENST00000496681 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
FAM208B-210ENST00000496681 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
FAM208B-210ENST00000496681 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
FAM208B-210ENST00000496681 KDM6BO15054 1643 aa39.51■■■■□ 3.91
FAM208B-210ENST00000496681 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.48■■■■□ 3.91
FAM208B-210ENST00000496681 KIF21BO75037 1637 aa39.47■■■■□ 3.91
FAM208B-210ENST00000496681 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.45■■■■□ 3.91
FAM208B-210ENST00000496681 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.44■■■■□ 3.9
FAM208B-210ENST00000496681 P3H3Q8IVL6 736 aa39.44■■■■□ 3.9
FAM208B-210ENST00000496681 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.26■■■■□ 3.88
FAM208B-210ENST00000496681 ATP10BO94823 1461 aa39.26■■■■□ 3.88
FAM208B-210ENST00000496681 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.26■■■■□ 3.88
FAM208B-210ENST00000496681 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
FAM208B-210ENST00000496681 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.22■■■■□ 3.87
FAM208B-210ENST00000496681 ARID3CA6NKF2 412 aa39.21■■■■□ 3.87
FAM208B-210ENST00000496681 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
FAM208B-210ENST00000496681 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.19■■■■□ 3.86
FAM208B-210ENST00000496681 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.19■■■■□ 3.86
FAM208B-210ENST00000496681 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
FAM208B-210ENST00000496681 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
FAM208B-210ENST00000496681 KCNH8Q96L42 1107 aa39.14■■■■□ 3.86
FAM208B-210ENST00000496681 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.12■■■■□ 3.85
FAM208B-210ENST00000496681 CD109Q6YHK3 1445 aa39.12■■■■□ 3.85
FAM208B-210ENST00000496681 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.08■■■■□ 3.85
FAM208B-210ENST00000496681 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
FAM208B-210ENST00000496681 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39■■■■□ 3.83
FAM208B-210ENST00000496681 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.93■■■■□ 3.82
FAM208B-210ENST00000496681 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
FAM208B-210ENST00000496681 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
FAM208B-210ENST00000496681 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.89■■■■□ 3.82
FAM208B-210ENST00000496681 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
FAM208B-210ENST00000496681 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.79■■■■□ 3.8
FAM208B-210ENST00000496681 FMN1Q68DA7 1419 aa38.78■■■■□ 3.8
FAM208B-210ENST00000496681 HECW1Q76N89 1606 aa38.74■■■■□ 3.79
FAM208B-210ENST00000496681 ADGRL1O94910 1474 aa38.73■■■■□ 3.79
FAM208B-210ENST00000496681 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.72■■■■□ 3.79
FAM208B-210ENST00000496681 NEO1Q92859 1461 aa38.7■■■■□ 3.79
FAM208B-210ENST00000496681 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.69■■■■□ 3.788e-11■■■■■ 48
FAM208B-210ENST00000496681 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.68■■■■□ 3.78
FAM208B-210ENST00000496681 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.67■■■■□ 3.78
FAM208B-210ENST00000496681 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.61■■■■□ 3.77
FAM208B-210ENST00000496681 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.58■■■■□ 3.77
FAM208B-210ENST00000496681 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
FAM208B-210ENST00000496681 RAPGEF3O95398 923 aa38.53■■■■□ 3.76
FAM208B-210ENST00000496681 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
FAM208B-210ENST00000496681 FANCAO15360 1455 aa38.52■■■■□ 3.76
FAM208B-210ENST00000496681 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.51■■■■□ 3.76
FAM208B-210ENST00000496681 AKNAQ7Z591 1439 aa38.47■■■■□ 3.75
FAM208B-210ENST00000496681 KIF14Q15058 1648 aa38.47■■■■□ 3.75
FAM208B-210ENST00000496681 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.45■■■■□ 3.75
FAM208B-210ENST00000496681 RICTORQ6R327 1708 aa38.44■■■■□ 3.74
FAM208B-210ENST00000496681 CLIP1P30622 1438 aa38.42■■■■□ 3.74
FAM208B-210ENST00000496681 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
FAM208B-210ENST00000496681 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
FAM208B-210ENST00000496681 PLCH2O75038 1416 aa38.4■■■■□ 3.74
FAM208B-210ENST00000496681 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
FAM208B-210ENST00000496681 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.36■■■■□ 3.73
FAM208B-210ENST00000496681 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.35■■■■□ 3.73
FAM208B-210ENST00000496681 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.34■■■■□ 3.73
FAM208B-210ENST00000496681 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.34■■■■□ 3.73
FAM208B-210ENST00000496681 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.31■■■■□ 3.72
FAM208B-210ENST00000496681 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.24■■■■□ 3.71
FAM208B-210ENST00000496681 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.23■■■■□ 3.71
FAM208B-210ENST00000496681 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms