RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496681.5

FAM208B-210, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM208B, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208B-210ENST00000496681 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.62■■■■■ 6.97
FAM208B-210ENST00000496681 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.4■■■■■ 5.98
FAM208B-210ENST00000496681 ABCC9O60706 1549 aa51.89■■■■■ 5.9
FAM208B-210ENST00000496681 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.6■■■■■ 5.53
FAM208B-210ENST00000496681 NACADO15069 1562 aa49.38■■■■■ 5.5
FAM208B-210ENST00000496681 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.07■■■■■ 5.45
FAM208B-210ENST00000496681 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.89■■■■■ 5.42
FAM208B-210ENST00000496681 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.74■■■■■ 5.39
FAM208B-210ENST00000496681 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.55■■■■■ 5.36
FAM208B-210ENST00000496681 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.46■■■■■ 5.35
FAM208B-210ENST00000496681 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.34■■■■■ 5.33
FAM208B-210ENST00000496681 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.24■■■■■ 5.31
FAM208B-210ENST00000496681 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.22■■■■■ 5.31
FAM208B-210ENST00000496681 SCRIBQ14160 1630 aa47.78■■■■■ 5.24
FAM208B-210ENST00000496681 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.57■■■■■ 5.21
FAM208B-210ENST00000496681 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
FAM208B-210ENST00000496681 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.93■■■■■ 5.1
FAM208B-210ENST00000496681 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.69■■■■■ 5.06
FAM208B-210ENST00000496681 SMARCA4P51532 1647 aa45.64■■■■■ 4.9
FAM208B-210ENST00000496681 NCAPD3P42695 1498 aa45.59■■■■■ 4.89
FAM208B-210ENST00000496681 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.55■■■■■ 4.88
FAM208B-210ENST00000496681 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
FAM208B-210ENST00000496681 SMARCA2P51531 1590 aa45.41■■■■■ 4.86
FAM208B-210ENST00000496681 HMGXB3Q12766 1538 aa45.33■■■■■ 4.85
FAM208B-210ENST00000496681 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.21■■■■■ 4.83
FAM208B-210ENST00000496681 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.2■■■■■ 4.83
FAM208B-210ENST00000496681 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
FAM208B-210ENST00000496681 NESP48681 1621 aa44.75■■■■■ 4.75
FAM208B-210ENST00000496681 ERCC6Q03468 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
FAM208B-210ENST00000496681 WIZO95785 1651 aa44.67■■■■■ 4.74
FAM208B-210ENST00000496681 CUX2O14529 1486 aa44.51■■■■■ 4.72
FAM208B-210ENST00000496681 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.48■■■■■ 4.71
FAM208B-210ENST00000496681 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
FAM208B-210ENST00000496681 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
FAM208B-210ENST00000496681 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.2■■■■■ 4.67
FAM208B-210ENST00000496681 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.19■■■■■ 4.67
FAM208B-210ENST00000496681 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.15■■■■■ 4.66
FAM208B-210ENST00000496681 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
FAM208B-210ENST00000496681 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.86■■■■■ 4.61
FAM208B-210ENST00000496681 CFTRP13569 1480 aa43.84■■■■■ 4.61
FAM208B-210ENST00000496681 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.81■■■■■ 4.6
FAM208B-210ENST00000496681 WDR62O43379 1518 aa43.73■■■■■ 4.59
FAM208B-210ENST00000496681 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.72■■■■■ 4.59
FAM208B-210ENST00000496681 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.72■■■■■ 4.59
FAM208B-210ENST00000496681 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.61■■■■■ 4.57
FAM208B-210ENST00000496681 PRDM2Q13029 1718 aa43.46■■■■■ 4.55
FAM208B-210ENST00000496681 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
FAM208B-210ENST00000496681 TOPBP1Q92547 1522 aa42.97■■■■■ 4.47
FAM208B-210ENST00000496681 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.86■■■■■ 4.45
FAM208B-210ENST00000496681 ABCC8Q09428 1581 aa42.82■■■■■ 4.45
FAM208B-210ENST00000496681 IFT140Q96RY7 1462 aa42.82■■■■■ 4.45
FAM208B-210ENST00000496681 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
FAM208B-210ENST00000496681 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
FAM208B-210ENST00000496681 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
FAM208B-210ENST00000496681 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
FAM208B-210ENST00000496681 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
FAM208B-210ENST00000496681 OSCARQ8IYS5 282 aa42.44■■■■■ 4.38
FAM208B-210ENST00000496681 CUX1P39880 1505 aa42.44■■■■■ 4.38
FAM208B-210ENST00000496681 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.4■■■■■ 4.38
FAM208B-210ENST00000496681 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.38■■■■■ 4.38
FAM208B-210ENST00000496681 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.37■■■■■ 4.37
FAM208B-210ENST00000496681 SOGA1O94964 1423 aa42.31■■■■■ 4.36
FAM208B-210ENST00000496681 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
FAM208B-210ENST00000496681 WDR97A6NE52 1622 aa42.15■■■■■ 4.34
FAM208B-210ENST00000496681 CHD1O14646 1710 aa42.13■■■■■ 4.33
FAM208B-210ENST00000496681 TRIM41Q8WV44 630 aa42.12■■■■■ 4.33
FAM208B-210ENST00000496681 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42■■■■■ 4.31
FAM208B-210ENST00000496681 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
FAM208B-210ENST00000496681 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
FAM208B-210ENST00000496681 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.99■■■■■ 4.31
FAM208B-210ENST00000496681 GRIN2BQ13224 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
FAM208B-210ENST00000496681 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.92■■■■■ 4.3
FAM208B-210ENST00000496681 ARHGEF11O15085 1522 aa41.91■■■■■ 4.3
FAM208B-210ENST00000496681 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.89■■■■■ 4.3
FAM208B-210ENST00000496681 FBLN2P98095 1184 aa41.89■■■■■ 4.3
FAM208B-210ENST00000496681 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
FAM208B-210ENST00000496681 SYNJ1O43426 1573 aa41.88■■■■■ 4.29
FAM208B-210ENST00000496681 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
FAM208B-210ENST00000496681 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.86■■■■■ 4.29
FAM208B-210ENST00000496681 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
FAM208B-210ENST00000496681 PBRM1Q86U86 1689 aa41.84■■■■■ 4.29
FAM208B-210ENST00000496681 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.84■■■■■ 4.29
FAM208B-210ENST00000496681 SYNJ2O15056 1496 aa41.73■■■■■ 4.27
FAM208B-210ENST00000496681 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.69■■■■■ 4.27
FAM208B-210ENST00000496681 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
FAM208B-210ENST00000496681 ARAP1Q96P48 1450 aa41.55■■■■■ 4.24
FAM208B-210ENST00000496681 ADAMTS12P58397 1594 aa41.5■■■■■ 4.23
FAM208B-210ENST00000496681 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.44■■■■■ 4.22
FAM208B-210ENST00000496681 GRIN2AQ12879 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
FAM208B-210ENST00000496681 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.39■■■■■ 4.22
FAM208B-210ENST00000496681 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
FAM208B-210ENST00000496681 CEP170Q5SW79 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
FAM208B-210ENST00000496681 NUP160Q12769 1436 aa41.27■■■■■ 4.2
FAM208B-210ENST00000496681 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.09■■■■■ 4.17
FAM208B-210ENST00000496681 SHROOM2Q13796 1616 aa41.06■■■■■ 4.16
FAM208B-210ENST00000496681 KIF27Q86VH2 1401 aa41■■■■■ 4.15
FAM208B-210ENST00000496681 IGF1RP08069 1367 aa40.94■■■■■ 4.14
FAM208B-210ENST00000496681 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.92■■■■■ 4.14
FAM208B-210ENST00000496681 CUL7Q14999 1698 aa40.88■■■■■ 4.14
FAM208B-210ENST00000496681 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.9 ms