RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496070.1

GAREM2-203, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

TSL 3

Gene GAREM2, Length 273 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-203ENST00000496070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.69■■□□□ 1.22
GAREM2-203ENST00000496070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.69■■□□□ 1.22
GAREM2-203ENST00000496070 ARHGEF11O15085 1522 aa22.69■■□□□ 1.22
GAREM2-203ENST00000496070 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.64■■□□□ 1.21
GAREM2-203ENST00000496070 JPH4Q96JJ6 628 aa22.64■■□□□ 1.21
GAREM2-203ENST00000496070 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.6■■□□□ 1.21
GAREM2-203ENST00000496070 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
GAREM2-203ENST00000496070 SHROOM2Q13796 1616 aa22.57■■□□□ 1.2
GAREM2-203ENST00000496070 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.57■■□□□ 1.2
GAREM2-203ENST00000496070 IQGAP2Q13576 1575 aa22.55■■□□□ 1.2
GAREM2-203ENST00000496070 ARAP1Q96P48 1450 aa22.54■■□□□ 1.2
GAREM2-203ENST00000496070 KIF21BO75037 1637 aa22.53■■□□□ 1.2
GAREM2-203ENST00000496070 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.51■■□□□ 1.19
GAREM2-203ENST00000496070 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GAREM2-203ENST00000496070 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GAREM2-203ENST00000496070 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
GAREM2-203ENST00000496070 GOLGA3Q08378 1498 aa22.46■■□□□ 1.19
GAREM2-203ENST00000496070 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.41■■□□□ 1.18
GAREM2-203ENST00000496070 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.41■■□□□ 1.18
GAREM2-203ENST00000496070 DISP1Q96F81 1524 aa22.4■■□□□ 1.18
GAREM2-203ENST00000496070 P3H3Q8IVL6 736 aa22.39■■□□□ 1.17
GAREM2-203ENST00000496070 KIAA0556O60303 1618 aa22.34■■□□□ 1.17
GAREM2-203ENST00000496070 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.34■■□□□ 1.17
GAREM2-203ENST00000496070 PTPRGP23470 1445 aa22.33■■□□□ 1.17
GAREM2-203ENST00000496070 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.29■■□□□ 1.16
GAREM2-203ENST00000496070 SAMD9Q5K651 1589 aa22.23■■□□□ 1.15
GAREM2-203ENST00000496070 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.22■■□□□ 1.15
GAREM2-203ENST00000496070 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.18■■□□□ 1.14
GAREM2-203ENST00000496070 UACAQ9BZF9 1416 aa22.16■■□□□ 1.14
GAREM2-203ENST00000496070 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.15■■□□□ 1.14
GAREM2-203ENST00000496070 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
GAREM2-203ENST00000496070 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.15■■□□□ 1.14
GAREM2-203ENST00000496070 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.14■■□□□ 1.13
GAREM2-203ENST00000496070 ARID3CA6NKF2 412 aa22.12■■□□□ 1.13
GAREM2-203ENST00000496070 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GAREM2-203ENST00000496070 ABCC2Q92887 1545 aa22.1■■□□□ 1.13
GAREM2-203ENST00000496070 CLIP1P30622 1438 aa22.09■■□□□ 1.13
GAREM2-203ENST00000496070 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.08■■□□□ 1.12
GAREM2-203ENST00000496070 ABCA8O94911 1581 aa22.08■■□□□ 1.12
GAREM2-203ENST00000496070 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GAREM2-203ENST00000496070 CEP162Q5TB80 1403 aa22.04■■□□□ 1.12
GAREM2-203ENST00000496070 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.01■■□□□ 1.11
GAREM2-203ENST00000496070 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GAREM2-203ENST00000496070 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.99■■□□□ 1.11
GAREM2-203ENST00000496070 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
GAREM2-203ENST00000496070 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
GAREM2-203ENST00000496070 FMN1Q68DA7 1419 aa21.97■■□□□ 1.11
GAREM2-203ENST00000496070 ASXL2Q76L83 1435 aa21.95■■□□□ 1.1
GAREM2-203ENST00000496070 MAPKBP1O60336 1514 aa21.95■■□□□ 1.1
GAREM2-203ENST00000496070 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
GAREM2-203ENST00000496070 ATP10BO94823 1461 aa21.93■■□□□ 1.1
GAREM2-203ENST00000496070 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.9■■□□□ 1.1
GAREM2-203ENST00000496070 KCNH8Q96L42 1107 aa21.88■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.86■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 HECW1Q76N89 1606 aa21.86■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.83■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 DIP2BQ9P265 1576 aa21.83■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.83■■□□□ 1.09
GAREM2-203ENST00000496070 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
GAREM2-203ENST00000496070 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.81■■□□□ 1.08
GAREM2-203ENST00000496070 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.79■■□□□ 1.08
GAREM2-203ENST00000496070 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.78■■□□□ 1.08
GAREM2-203ENST00000496070 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.77■■□□□ 1.08
GAREM2-203ENST00000496070 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.72■■□□□ 1.07
GAREM2-203ENST00000496070 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
GAREM2-203ENST00000496070 TSPOAP1O95153 1857 aa21.71■■□□□ 1.07
GAREM2-203ENST00000496070 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.71■■□□□ 1.07
GAREM2-203ENST00000496070 GLI2P10070 1586 aa21.7■■□□□ 1.06
GAREM2-203ENST00000496070 CD109Q6YHK3 1445 aa21.65■■□□□ 1.06
GAREM2-203ENST00000496070 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.64■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.63■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.6■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 KIF14Q15058 1648 aa21.59■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.59■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GAREM2-203ENST00000496070 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.58■■□□□ 1.04
GAREM2-203ENST00000496070 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.57■■□□□ 1.04
GAREM2-203ENST00000496070 APLP2Q06481 763 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-203ENST00000496070 TIAM1Q13009 1591 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-203ENST00000496070 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-203ENST00000496070 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-203ENST00000496070 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-203ENST00000496070 KDM6BO15054 1643 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-203ENST00000496070 PLCH2O75038 1416 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-203ENST00000496070 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.45■■□□□ 1.03
GAREM2-203ENST00000496070 FANCAO15360 1455 aa21.44■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 MAP3K1Q13233 1512 aa21.43■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.42■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 NCOA2Q15596 1464 aa21.39■■□□□ 1.02
GAREM2-203ENST00000496070 NEO1Q92859 1461 aa21.39■■□□□ 1.02
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