RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495113.5

TMBIM1-223, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 2

Gene TMBIM1, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-223	ENST00000495113	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		19.09	■□□□□ 0.65
TMBIM1-223	ENST00000495113	SYNJ2	O15056	1496 aa		19.03	■□□□□ 0.64
TMBIM1-223	ENST00000495113	GRIN2A	Q12879	1464 aa		19.02	■□□□□ 0.63
TMBIM1-223	ENST00000495113	IQGAP2	Q13576	1575 aa		19.01	■□□□□ 0.63
TMBIM1-223	ENST00000495113	SAMD9	Q5K651	1589 aa		19.01	■□□□□ 0.63
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
TMBIM1-223	ENST00000495113	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
TMBIM1-223	ENST00000495113	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		18.94	■□□□□ 0.62
TMBIM1-223	ENST00000495113	CHD1	O14646	1710 aa		18.94	■□□□□ 0.62
TMBIM1-223	ENST00000495113	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAP3K1	Q13233	1512 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TMBIM1-223	ENST00000495113	APLP2	Q06481	763 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TMBIM1-223	ENST00000495113	NUP160	Q12769	1436 aa		18.89	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	CEP170	Q5SW79	1584 aa		18.89	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	FMN1	Q68DA7	1419 aa		18.88	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		18.86	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		18.86	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		18.86	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		18.86	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		18.84	■□□□□ 0.61
TMBIM1-223	ENST00000495113	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		18.83	■□□□□ 0.6
TMBIM1-223	ENST00000495113	KIAA0556	O60303	1618 aa		18.82	■□□□□ 0.6
TMBIM1-223	ENST00000495113	TIAM1	Q13009	1591 aa		18.81	■□□□□ 0.6
TMBIM1-223	ENST00000495113	DISP1	Q96F81	1524 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TMBIM1-223	ENST00000495113	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
TMBIM1-223	ENST00000495113	P3H3	Q8IVL6	736 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TMBIM1-223	ENST00000495113	FBLN2	P98095	1184 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TMBIM1-223	ENST00000495113	HECW1	Q76N89	1606 aa		18.74	■□□□□ 0.59
TMBIM1-223	ENST00000495113	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TMBIM1-223	ENST00000495113	SHROOM2	Q13796	1616 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		18.68	■□□□□ 0.58
TMBIM1-223	ENST00000495113	JPH4	Q96JJ6	628 aa		18.64	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TMBIM1-223	ENST00000495113	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	ABCA8	O94911	1581 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	ARHGEF11	O15085	1522 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TMBIM1-223	ENST00000495113	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
TMBIM1-223	ENST00000495113	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TMBIM1-223	ENST00000495113	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TMBIM1-223	ENST00000495113	PTPRG	P23470	1445 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TMBIM1-223	ENST00000495113	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TMBIM1-223	ENST00000495113	NCOA2	Q15596	1464 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TMBIM1-223	ENST00000495113	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54	2e-6	■■□□□ 13.2
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TMBIM1-223	ENST00000495113	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TMBIM1-223	ENST00000495113	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TMBIM1-223	ENST00000495113	HRC	P23327	699 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TMBIM1-223	ENST00000495113	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	UACA	Q9BZF9	1416 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	ABCC2	Q92887	1545 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	ATP10B	O94823	1461 aa		18.33	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	MIA2	Q96PC5	1412 aa		18.33	■□□□□ 0.53
TMBIM1-223	ENST00000495113	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TMBIM1-223	ENST00000495113	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TMBIM1-223	ENST00000495113	KIF14	Q15058	1648 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
TMBIM1-223	ENST00000495113	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TMBIM1-223	ENST00000495113	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
TMBIM1-223	ENST00000495113	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMBIM1-223	ENST00000495113	ARID3C	A6NKF2	412 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TMBIM1-223	ENST00000495113	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TMBIM1-223	ENST00000495113	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	PREX2	Q70Z35	1606 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	AKNA	Q7Z591	1439 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TMBIM1-223	ENST00000495113	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TMBIM1-223	ENST00000495113	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TMBIM1-223	ENST00000495113	ITGAE	P38570	1179 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TMBIM1-223	ENST00000495113	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TMBIM1-223	ENST00000495113	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TMBIM1-223	ENST00000495113	HFM1	A2PYH4	1435 aa		18.11	■□□□□ 0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms