RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491749.2

EFHC1-204, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EFHC1, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-204ENST00000491749 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.9■■■■■ 4.3
EFHC1-204ENST00000491749 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.88■■■■■ 4.29
EFHC1-204ENST00000491749 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.87■■■■■ 4.29
EFHC1-204ENST00000491749 JPH4Q96JJ6 628 aa41.82■■■■■ 4.29
EFHC1-204ENST00000491749 EEA1Q15075 1411 aa41.78■■■■■ 4.28
EFHC1-204ENST00000491749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
EFHC1-204ENST00000491749 PRXQ9BXM0 1461 aa41.76■■■■■ 4.28
EFHC1-204ENST00000491749 IQGAP2Q13576 1575 aa41.71■■■■■ 4.27
EFHC1-204ENST00000491749 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.66■■■■■ 4.26
EFHC1-204ENST00000491749 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.64■■■■■ 4.26
EFHC1-204ENST00000491749 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
EFHC1-204ENST00000491749 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.47■■■■■ 4.23
EFHC1-204ENST00000491749 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.46■■■■■ 4.23
EFHC1-204ENST00000491749 KIF21BO75037 1637 aa41.4■■■■■ 4.22
EFHC1-204ENST00000491749 DISP1Q96F81 1524 aa41.38■■■■■ 4.21
EFHC1-204ENST00000491749 KIAA0556O60303 1618 aa41.32■■■■■ 4.2
EFHC1-204ENST00000491749 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.3■■■■■ 4.2
EFHC1-204ENST00000491749 PTPRGP23470 1445 aa41.27■■■■■ 4.2
EFHC1-204ENST00000491749 GOLGA3Q08378 1498 aa41.24■■■■■ 4.19
EFHC1-204ENST00000491749 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.22■■■■■ 4.19
EFHC1-204ENST00000491749 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
EFHC1-204ENST00000491749 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
EFHC1-204ENST00000491749 SAMD9Q5K651 1589 aa41.04■■■■■ 4.16
EFHC1-204ENST00000491749 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.16
EFHC1-204ENST00000491749 UACAQ9BZF9 1416 aa41.01■■■■■ 4.16
EFHC1-204ENST00000491749 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.01■■■■■ 4.16
EFHC1-204ENST00000491749 ABCC2Q92887 1545 aa40.98■■■■■ 4.15
EFHC1-204ENST00000491749 MAPKBP1O60336 1514 aa40.96■■■■■ 4.15
EFHC1-204ENST00000491749 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
EFHC1-204ENST00000491749 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.93■■■■■ 4.14
EFHC1-204ENST00000491749 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.87■■■■■ 4.13
EFHC1-204ENST00000491749 ABCA8O94911 1581 aa40.86■■■■■ 4.13
EFHC1-204ENST00000491749 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.85■■■■■ 4.13
EFHC1-204ENST00000491749 P3H3Q8IVL6 736 aa40.85■■■■■ 4.13
EFHC1-204ENST00000491749 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
EFHC1-204ENST00000491749 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.82■■■■■ 4.13
EFHC1-204ENST00000491749 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.8■■■■■ 4.12
EFHC1-204ENST00000491749 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
EFHC1-204ENST00000491749 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.73■■■■■ 4.11
EFHC1-204ENST00000491749 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.73■■■■■ 4.11
EFHC1-204ENST00000491749 DIP2BQ9P265 1576 aa40.72■■■■■ 4.11
EFHC1-204ENST00000491749 ASXL2Q76L83 1435 aa40.67■■■■■ 4.1
EFHC1-204ENST00000491749 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.66■■■■■ 4.1
EFHC1-204ENST00000491749 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.59■■■■■ 4.09
EFHC1-204ENST00000491749 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.59■■■■■ 4.09
EFHC1-204ENST00000491749 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.49■■■■■ 4.07
EFHC1-204ENST00000491749 GLI2P10070 1586 aa40.48■■■■■ 4.07
EFHC1-204ENST00000491749 ATP10BO94823 1461 aa40.46■■■■■ 4.07
EFHC1-204ENST00000491749 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
EFHC1-204ENST00000491749 FMN1Q68DA7 1419 aa40.44■■■■■ 4.06
EFHC1-204ENST00000491749 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
EFHC1-204ENST00000491749 TSPOAP1O95153 1857 aa40.41■■■■■ 4.06
EFHC1-204ENST00000491749 ARID3CA6NKF2 412 aa40.4■■■■■ 4.06
EFHC1-204ENST00000491749 CLIP1P30622 1438 aa40.33■■■■■ 4.05
EFHC1-204ENST00000491749 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.32■■■■■ 4.05
EFHC1-204ENST00000491749 HECW1Q76N89 1606 aa40.31■■■■■ 4.04
EFHC1-204ENST00000491749 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
EFHC1-204ENST00000491749 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
EFHC1-204ENST00000491749 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
EFHC1-204ENST00000491749 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.23■■■■■ 4.03
EFHC1-204ENST00000491749 KCNH8Q96L42 1107 aa40.21■■■■■ 4.03
EFHC1-204ENST00000491749 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
EFHC1-204ENST00000491749 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
EFHC1-204ENST00000491749 CEP162Q5TB80 1403 aa40.16■■■■■ 4.02
EFHC1-204ENST00000491749 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
EFHC1-204ENST00000491749 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.12■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.11■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.11■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.11■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.11■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.09■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 CD109Q6YHK3 1445 aa40.08■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 KDM6BO15054 1643 aa40.08■■■■■ 4.01
EFHC1-204ENST00000491749 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.06■■■■■ 4
EFHC1-204ENST00000491749 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.04■■■■■ 4
EFHC1-204ENST00000491749 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40■■■■□ 3.99
EFHC1-204ENST00000491749 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
EFHC1-204ENST00000491749 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.987e-7■■■■■ 27.5
EFHC1-204ENST00000491749 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.87■■■■□ 3.97
EFHC1-204ENST00000491749 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
EFHC1-204ENST00000491749 KIF14Q15058 1648 aa39.83■■■■□ 3.97
EFHC1-204ENST00000491749 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
EFHC1-204ENST00000491749 NEO1Q92859 1461 aa39.75■■■■□ 3.95
EFHC1-204ENST00000491749 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.72■■■■□ 3.95
EFHC1-204ENST00000491749 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.72■■■■□ 3.95
EFHC1-204ENST00000491749 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.72■■■■□ 3.95
EFHC1-204ENST00000491749 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.7■■■■□ 3.95
EFHC1-204ENST00000491749 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.68■■■■□ 3.94
EFHC1-204ENST00000491749 FANCAO15360 1455 aa39.65■■■■□ 3.94
EFHC1-204ENST00000491749 PLCH2O75038 1416 aa39.63■■■■□ 3.93
EFHC1-204ENST00000491749 AKNAQ7Z591 1439 aa39.55■■■■□ 3.92
EFHC1-204ENST00000491749 PREX2Q70Z35 1606 aa39.52■■■■□ 3.92
EFHC1-204ENST00000491749 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.52■■■■□ 3.92
EFHC1-204ENST00000491749 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.51■■■■□ 3.92
EFHC1-204ENST00000491749 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.51■■■■□ 3.91
EFHC1-204ENST00000491749 TIAM1Q13009 1591 aa39.5■■■■□ 3.91
EFHC1-204ENST00000491749 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.5■■■■□ 3.91
EFHC1-204ENST00000491749 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.49■■■■□ 3.91
EFHC1-204ENST00000491749 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.46■■■■□ 3.91
EFHC1-204ENST00000491749 RICTORQ6R327 1708 aa39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms