RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.37■■■■■ 5.33
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HOXB3-211ENST00000490677 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.17■■■■■ 5.3
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HOXB3-211ENST00000490677 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.92■■■■■ 5.26
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HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.09■■■■■ 4.97
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HOXB3-211ENST00000490677 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.52■■■■■ 4.88
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HOXB3-211ENST00000490677 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.5■■■■■ 4.87
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HOXB3-211ENST00000490677 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
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HOXB3-211ENST00000490677 CLIP1P30622 1438 aa45.41■■■■■ 4.86
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.41■■■■■ 4.86
HOXB3-211ENST00000490677 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.37■■■■■ 4.85
HOXB3-211ENST00000490677 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.37■■■■■ 4.85
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