RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490460.5

CREM-241, Transcript of cAMP responsive element modulator, humanhuman

TSL 3

Gene CREM, Length 1,074 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREM-241ENST00000490460 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.54■■■■□ 3.28
CREM-241ENST00000490460 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.54■■■■□ 3.28
CREM-241ENST00000490460 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.52■■■■□ 3.28
CREM-241ENST00000490460 JPH4Q96JJ6 628 aa35.46■■■■□ 3.27
CREM-241ENST00000490460 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CREM-241ENST00000490460 PRXQ9BXM0 1461 aa35.41■■■■□ 3.26
CREM-241ENST00000490460 EEA1Q15075 1411 aa35.4■■■■□ 3.26
CREM-241ENST00000490460 IQGAP2Q13576 1575 aa35.38■■■■□ 3.25
CREM-241ENST00000490460 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.33■■■■□ 3.25
CREM-241ENST00000490460 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CREM-241ENST00000490460 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.27■■■■□ 3.24
CREM-241ENST00000490460 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
CREM-241ENST00000490460 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.15■■■■□ 3.22
CREM-241ENST00000490460 DISP1Q96F81 1524 aa35.11■■■■□ 3.21
CREM-241ENST00000490460 KIF21BO75037 1637 aa35.09■■■■□ 3.21
CREM-241ENST00000490460 KIAA0556O60303 1618 aa35.05■■■■□ 3.2
CREM-241ENST00000490460 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.03■■■■□ 3.2
CREM-241ENST00000490460 PTPRGP23470 1445 aa35.01■■■■□ 3.2
CREM-241ENST00000490460 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
CREM-241ENST00000490460 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.97■■■■□ 3.19
CREM-241ENST00000490460 GOLGA3Q08378 1498 aa34.94■■■■□ 3.18
CREM-241ENST00000490460 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
CREM-241ENST00000490460 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.87■■■■□ 3.17
CREM-241ENST00000490460 SAMD9Q5K651 1589 aa34.79■■■■□ 3.16
CREM-241ENST00000490460 UACAQ9BZF9 1416 aa34.79■■■■□ 3.16
CREM-241ENST00000490460 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.77■■■■□ 3.16
CREM-241ENST00000490460 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.76■■■■□ 3.15
CREM-241ENST00000490460 ABCC2Q92887 1545 aa34.76■■■■□ 3.15
CREM-241ENST00000490460 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
CREM-241ENST00000490460 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CREM-241ENST00000490460 P3H3Q8IVL6 736 aa34.73■■■■□ 3.15
CREM-241ENST00000490460 MAPKBP1O60336 1514 aa34.72■■■■□ 3.15
CREM-241ENST00000490460 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.69■■■■□ 3.14
CREM-241ENST00000490460 ABCA8O94911 1581 aa34.64■■■■□ 3.14
CREM-241ENST00000490460 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.62■■■■□ 3.13
CREM-241ENST00000490460 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.6■■■■□ 3.13
CREM-241ENST00000490460 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.6■■■■□ 3.13
CREM-241ENST00000490460 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.59■■■■□ 3.13
CREM-241ENST00000490460 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CREM-241ENST00000490460 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.55■■■■□ 3.12
CREM-241ENST00000490460 DIP2BQ9P265 1576 aa34.53■■■■□ 3.12
CREM-241ENST00000490460 ASXL2Q76L83 1435 aa34.51■■■■□ 3.12
CREM-241ENST00000490460 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.48■■■■□ 3.11
CREM-241ENST00000490460 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.46■■■■□ 3.11
CREM-241ENST00000490460 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.45■■■■□ 3.1
CREM-241ENST00000490460 ARID3CA6NKF2 412 aa34.38■■■■□ 3.09
CREM-241ENST00000490460 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.34■■■■□ 3.09
CREM-241ENST00000490460 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CREM-241ENST00000490460 ATP10BO94823 1461 aa34.33■■■■□ 3.09
CREM-241ENST00000490460 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
CREM-241ENST00000490460 GLI2P10070 1586 aa34.3■■■■□ 3.08
CREM-241ENST00000490460 FMN1Q68DA7 1419 aa34.28■■■■□ 3.08
CREM-241ENST00000490460 TSPOAP1O95153 1857 aa34.27■■■■□ 3.08
CREM-241ENST00000490460 CLIP1P30622 1438 aa34.23■■■■□ 3.07
CREM-241ENST00000490460 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CREM-241ENST00000490460 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CREM-241ENST00000490460 HECW1Q76N89 1606 aa34.18■■■■□ 3.06
CREM-241ENST00000490460 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.18■■■■□ 3.06
CREM-241ENST00000490460 KCNH8Q96L42 1107 aa34.15■■■■□ 3.06
CREM-241ENST00000490460 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
CREM-241ENST00000490460 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CREM-241ENST00000490460 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.1■■■■□ 3.05
CREM-241ENST00000490460 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
CREM-241ENST00000490460 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CREM-241ENST00000490460 CEP162Q5TB80 1403 aa34.08■■■■□ 3.05
CREM-241ENST00000490460 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.07■■■■□ 3.04
CREM-241ENST00000490460 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.01■■■■□ 3.04
CREM-241ENST00000490460 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.01■■■■□ 3.03
CREM-241ENST00000490460 CD109Q6YHK3 1445 aa34■■■■□ 3.03
CREM-241ENST00000490460 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.99■■■■□ 3.03
CREM-241ENST00000490460 KDM6BO15054 1643 aa33.99■■■■□ 3.03
CREM-241ENST00000490460 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.99■■■■□ 3.03
CREM-241ENST00000490460 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.99■■■■□ 3.03
CREM-241ENST00000490460 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.95■■■■□ 3.03
CREM-241ENST00000490460 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.94■■■■□ 3.02
CREM-241ENST00000490460 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.9■■■■□ 3.02
CREM-241ENST00000490460 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.84■■■■□ 3.01
CREM-241ENST00000490460 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
CREM-241ENST00000490460 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.84■■■■□ 3.01
CREM-241ENST00000490460 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CREM-241ENST00000490460 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
CREM-241ENST00000490460 KIF14Q15058 1648 aa33.78■■■■□ 3
CREM-241ENST00000490460 NEO1Q92859 1461 aa33.69■■■□□ 2.98
CREM-241ENST00000490460 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.66■■■□□ 2.98
CREM-241ENST00000490460 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.65■■■□□ 2.98
CREM-241ENST00000490460 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.64■■■□□ 2.98
CREM-241ENST00000490460 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.64■■■□□ 2.98
CREM-241ENST00000490460 FANCAO15360 1455 aa33.63■■■□□ 2.97
CREM-241ENST00000490460 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.62■■■□□ 2.97
CREM-241ENST00000490460 PLCH2O75038 1416 aa33.6■■■□□ 2.97
CREM-241ENST00000490460 AKNAQ7Z591 1439 aa33.55■■■□□ 2.96
CREM-241ENST00000490460 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.54■■■□□ 2.96
CREM-241ENST00000490460 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.51■■■□□ 2.95
CREM-241ENST00000490460 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.51■■■□□ 2.95
CREM-241ENST00000490460 PREX2Q70Z35 1606 aa33.5■■■□□ 2.95
CREM-241ENST00000490460 TIAM1Q13009 1591 aa33.5■■■□□ 2.95
CREM-241ENST00000490460 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.5■■■□□ 2.95
CREM-241ENST00000490460 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.48■■■□□ 2.95
CREM-241ENST00000490460 RAPGEF3O95398 923 aa33.47■■■□□ 2.95
CREM-241ENST00000490460 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.4 ms