RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490460.5

CREM-241, Transcript of cAMP responsive element modulator, humanhuman

TSL 3

Gene CREM, Length 1,074 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREM-241ENST00000490460 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.35■■■■■ 5.81
CREM-241ENST00000490460 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.69■■■■■ 4.9
CREM-241ENST00000490460 ABCC9O60706 1549 aa44.73■■■■■ 4.75
CREM-241ENST00000490460 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.99■■■■■ 4.47
CREM-241ENST00000490460 NACADO15069 1562 aa42.92■■■■■ 4.46
CREM-241ENST00000490460 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.9■■■■■ 4.46
CREM-241ENST00000490460 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
CREM-241ENST00000490460 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.63■■■■■ 4.42
CREM-241ENST00000490460 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.46■■■■■ 4.39
CREM-241ENST00000490460 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.07■■■■■ 4.33
CREM-241ENST00000490460 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.77■■■■■ 4.28
CREM-241ENST00000490460 SCRIBQ14160 1630 aa41.74■■■■■ 4.27
CREM-241ENST00000490460 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.71■■■■■ 4.27
CREM-241ENST00000490460 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.22■■■■■ 4.19
CREM-241ENST00000490460 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.99■■■■■ 4.15
CREM-241ENST00000490460 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CREM-241ENST00000490460 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.45■■■■■ 4.07
CREM-241ENST00000490460 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.17■■■■■ 4.02
CREM-241ENST00000490460 SMARCA4P51532 1647 aa39.89■■■■□ 3.98
CREM-241ENST00000490460 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
CREM-241ENST00000490460 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.64■■■■□ 3.94
CREM-241ENST00000490460 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.6■■■■□ 3.93
CREM-241ENST00000490460 SMARCA2P51531 1590 aa39.59■■■■□ 3.93
CREM-241ENST00000490460 NCAPD3P42695 1498 aa39.58■■■■□ 3.93
CREM-241ENST00000490460 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.46■■■■□ 3.91
CREM-241ENST00000490460 HMGXB3Q12766 1538 aa39.44■■■■□ 3.9
CREM-241ENST00000490460 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
CREM-241ENST00000490460 WIZO95785 1651 aa39.19■■■■□ 3.86
CREM-241ENST00000490460 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
CREM-241ENST00000490460 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
CREM-241ENST00000490460 NESP48681 1621 aa38.71■■■■□ 3.79
CREM-241ENST00000490460 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.57■■■■□ 3.77
CREM-241ENST00000490460 ERCC6Q03468 1493 aa38.55■■■■□ 3.76
CREM-241ENST00000490460 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.44■■■■□ 3.74
CREM-241ENST00000490460 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.29■■■■□ 3.72
CREM-241ENST00000490460 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.28■■■■□ 3.72
CREM-241ENST00000490460 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.28■■■■□ 3.72
CREM-241ENST00000490460 CFTRP13569 1480 aa38.22■■■■□ 3.71
CREM-241ENST00000490460 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
CREM-241ENST00000490460 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
CREM-241ENST00000490460 CUX2O14529 1486 aa38.11■■■■□ 3.69
CREM-241ENST00000490460 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.04■■■■□ 3.68
CREM-241ENST00000490460 CEP164Q9UPV0 1460 aa38■■■■□ 3.67
CREM-241ENST00000490460 PRDM2Q13029 1718 aa38■■■■□ 3.67
CREM-241ENST00000490460 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.95■■■■□ 3.67
CREM-241ENST00000490460 WDR62O43379 1518 aa37.82■■■■□ 3.65
CREM-241ENST00000490460 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
CREM-241ENST00000490460 TOPBP1Q92547 1522 aa37.43■■■■□ 3.58
CREM-241ENST00000490460 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.4■■■■□ 3.58
CREM-241ENST00000490460 ABCC8Q09428 1581 aa37.37■■■■□ 3.57
CREM-241ENST00000490460 IFT140Q96RY7 1462 aa37.19■■■■□ 3.54
CREM-241ENST00000490460 CUX1P39880 1505 aa37.16■■■■□ 3.54
CREM-241ENST00000490460 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
CREM-241ENST00000490460 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
CREM-241ENST00000490460 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.04■■■■□ 3.52
CREM-241ENST00000490460 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CREM-241ENST00000490460 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.96■■■■□ 3.51
CREM-241ENST00000490460 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CREM-241ENST00000490460 SOGA1O94964 1423 aa36.93■■■■□ 3.5
CREM-241ENST00000490460 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.5
CREM-241ENST00000490460 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.89■■■■□ 3.5
CREM-241ENST00000490460 SYNJ1O43426 1573 aa36.86■■■■□ 3.49
CREM-241ENST00000490460 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.85■■■■□ 3.49
CREM-241ENST00000490460 TOP2BQ02880 1626 aa36.83■■■■□ 3.49
CREM-241ENST00000490460 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.82■■■■□ 3.48
CREM-241ENST00000490460 WDR97A6NE52 1622 aa36.76■■■■□ 3.48
CREM-241ENST00000490460 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CREM-241ENST00000490460 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.64■■■■□ 3.46
CREM-241ENST00000490460 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.55■■■■□ 3.44
CREM-241ENST00000490460 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.53■■■■□ 3.44
CREM-241ENST00000490460 GRIN2BQ13224 1484 aa36.51■■■■□ 3.44
CREM-241ENST00000490460 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.51■■■■□ 3.44
CREM-241ENST00000490460 PBRM1Q86U86 1689 aa36.51■■■■□ 3.43
CREM-241ENST00000490460 OSCARQ8IYS5 282 aa36.48■■■■□ 3.43
CREM-241ENST00000490460 CHD1O14646 1710 aa36.48■■■■□ 3.43
CREM-241ENST00000490460 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CREM-241ENST00000490460 FBLN2P98095 1184 aa36.36■■■■□ 3.41
CREM-241ENST00000490460 SYNJ2O15056 1496 aa36.28■■■■□ 3.4
CREM-241ENST00000490460 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CREM-241ENST00000490460 ADAMTS12P58397 1594 aa36.21■■■■□ 3.39
CREM-241ENST00000490460 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.21■■■■□ 3.39
CREM-241ENST00000490460 KIF27Q86VH2 1401 aa36.11■■■■□ 3.37
CREM-241ENST00000490460 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.09■■■■□ 3.37
CREM-241ENST00000490460 GRIN2AQ12879 1464 aa36.06■■■■□ 3.36
CREM-241ENST00000490460 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.04■■■■□ 3.36
CREM-241ENST00000490460 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
CREM-241ENST00000490460 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
CREM-241ENST00000490460 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
CREM-241ENST00000490460 TRIM41Q8WV44 630 aa35.98■■■■□ 3.35
CREM-241ENST00000490460 ARHGEF11O15085 1522 aa35.97■■■■□ 3.35
CREM-241ENST00000490460 IGF1RP08069 1367 aa35.94■■■■□ 3.34
CREM-241ENST00000490460 CUL7Q14999 1698 aa35.91■■■■□ 3.34
CREM-241ENST00000490460 CEP170Q5SW79 1584 aa35.91■■■■□ 3.34
CREM-241ENST00000490460 NUP160Q12769 1436 aa35.89■■■■□ 3.34
CREM-241ENST00000490460 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.81■■■■□ 3.32
CREM-241ENST00000490460 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.75■■■■□ 3.31
CREM-241ENST00000490460 ARAP1Q96P48 1450 aa35.69■■■■□ 3.3
CREM-241ENST00000490460 SHROOM2Q13796 1616 aa35.64■■■■□ 3.3
CREM-241ENST00000490460 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.58■■■■□ 3.29
CREM-241ENST00000490460 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.57■■■■□ 3.28
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