RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482507.5

ATG4B-220, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-220ENST00000482507 NEUROD1Q13562 356 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-220ENST00000482507 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-220ENST00000482507 GRIN2BQ13224 1484 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-220ENST00000482507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-220ENST00000482507 FBLN2P98095 1184 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-220ENST00000482507 APLP2Q06481 763 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-220ENST00000482507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-220ENST00000482507 ARAP1Q96P48 1450 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-220ENST00000482507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-220ENST00000482507 PBRM1Q86U86 1689 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-220ENST00000482507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-220ENST00000482507 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-220ENST00000482507 CUL7Q14999 1698 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-220ENST00000482507 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-220ENST00000482507 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-220ENST00000482507 ADAMTS12P58397 1594 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-220ENST00000482507 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-220ENST00000482507 P3H3Q8IVL6 736 aa22.08■■□□□ 1.12
ATG4B-220ENST00000482507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-220ENST00000482507 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-220ENST00000482507 SYNJ2O15056 1496 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-220ENST00000482507 MIER1Q8N108 512 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-220ENST00000482507 GRIN2AQ12879 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-220ENST00000482507 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.02■■□□□ 1.12
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ATG4B-220ENST00000482507 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-220ENST00000482507 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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ATG4B-220ENST00000482507 CEP170Q5SW79 1584 aa21.89■■□□□ 1.1
ATG4B-220ENST00000482507 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.86■■□□□ 1.09
ATG4B-220ENST00000482507 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.86■■□□□ 1.09
ATG4B-220ENST00000482507 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.86■■□□□ 1.09
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ATG4B-220ENST00000482507 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.85■■□□□ 1.09
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ATG4B-220ENST00000482507 CHD1O14646 1710 aa21.83■■□□□ 1.08
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ATG4B-220ENST00000482507 ITGAEP38570 1179 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG4B-220ENST00000482507 TIAM1Q13009 1591 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-220ENST00000482507 MAP3K1Q13233 1512 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-220ENST00000482507 OSCARQ8IYS5 282 aa21.71■■□□□ 1.07
ATG4B-220ENST00000482507 DISP1Q96F81 1524 aa21.71■■□□□ 1.07
ATG4B-220ENST00000482507 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 SAMD9Q5K651 1589 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 ARID3CA6NKF2 412 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-220ENST00000482507 MAPKBP1O60336 1514 aa21.66■■□□□ 1.06
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ATG4B-220ENST00000482507 KIAA0556O60303 1618 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG4B-220ENST00000482507 FMN1Q68DA7 1419 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG4B-220ENST00000482507 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG4B-220ENST00000482507 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.58■■□□□ 1.05
ATG4B-220ENST00000482507 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.58■■□□□ 1.04
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ATG4B-220ENST00000482507 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.54■■□□□ 1.04
ATG4B-220ENST00000482507 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ATG4B-220ENST00000482507 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.52■■□□□ 1.03
ATG4B-220ENST00000482507 PTPRGP23470 1445 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-220ENST00000482507 SHROOM2Q13796 1616 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-220ENST00000482507 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-220ENST00000482507 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-220ENST00000482507 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-220ENST00000482507 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-220ENST00000482507 KCNH8Q96L42 1107 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-220ENST00000482507 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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ATG4B-220ENST00000482507 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.35■■□□□ 1.01
ATG4B-220ENST00000482507 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.34■■□□□ 1.01
ATG4B-220ENST00000482507 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.34■■□□□ 1.01
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ATG4B-220ENST00000482507 HECW1Q76N89 1606 aa21.33■■□□□ 1
ATG4B-220ENST00000482507 ABCA8O94911 1581 aa21.31■■□□□ 1
ATG4B-220ENST00000482507 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
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ATG4B-220ENST00000482507 ATP10BO94823 1461 aa21.28■■□□□ 1
ATG4B-220ENST00000482507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.28■■□□□ 1
ATG4B-220ENST00000482507 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.27■■□□□ 1
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ATG4B-220ENST00000482507 ARHGEF11O15085 1522 aa21.24■□□□□ 0.99
ATG4B-220ENST00000482507 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.24■□□□□ 0.99
ATG4B-220ENST00000482507 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
ATG4B-220ENST00000482507 NCOA2Q15596 1464 aa21.22■□□□□ 0.99
ATG4B-220ENST00000482507 HFM1A2PYH4 1435 aa21.21■□□□□ 0.99
ATG4B-220ENST00000482507 ABCC2Q92887 1545 aa21.2■□□□□ 0.98
ATG4B-220ENST00000482507 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.19■□□□□ 0.98
ATG4B-220ENST00000482507 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.18■□□□□ 0.98
ATG4B-220ENST00000482507 NAIPQ13075 1403 aa21.16■□□□□ 0.98
ATG4B-220ENST00000482507 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.14■□□□□ 0.97
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